More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1744 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6070  argininosuccinate lyase  75.16 
 
 
472 aa  699    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.566647  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1888  argininosuccinate lyase  70.88 
 
 
487 aa  636    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0738965  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3168  argininosuccinate lyase  89.83 
 
 
464 aa  816    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0440728 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2024  argininosuccinate lyase  74.11 
 
 
482 aa  703    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0998023 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2158  argininosuccinate lyase  73.61 
 
 
472 aa  673    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000750754  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1744  argininosuccinate lyase  100 
 
 
511 aa  994    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814038 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1895  argininosuccinate lyase  72.61 
 
 
487 aa  613  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.329316  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1256  argininosuccinate lyase  71.28 
 
 
489 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3069  argininosuccinate lyase  66.31 
 
 
470 aa  611  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3022  argininosuccinate lyase  68.35 
 
 
486 aa  587  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5465  argininosuccinate lyase  63.95 
 
 
472 aa  587  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559884  hitchhiker  0.0094933 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2051  argininosuccinate lyase  64.73 
 
 
476 aa  579  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1118  argininosuccinate lyase  61.75 
 
 
474 aa  548  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.542068 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22260  argininosuccinate lyase  60.62 
 
 
500 aa  549  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3055  argininosuccinate lyase  62.69 
 
 
472 aa  548  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.097869  normal  0.940422 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1503  argininosuccinate lyase  61.69 
 
 
479 aa  538  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1504  argininosuccinate lyase  61.04 
 
 
480 aa  538  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000851302 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14330  argininosuccinate lyase  62.04 
 
 
486 aa  536  1e-151  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00125191  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5449  argininosuccinate lyase  62.89 
 
 
463 aa  537  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25560  argininosuccinate lyase  61.99 
 
 
465 aa  533  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4124  argininosuccinate lyase  62.99 
 
 
485 aa  521  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.826501  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3155  argininosuccinate lyase  61.67 
 
 
481 aa  516  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2475  argininosuccinate lyase  59.96 
 
 
470 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2852  argininosuccinate lyase  59.57 
 
 
475 aa  514  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1333  argininosuccinate lyase  60.29 
 
 
484 aa  512  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279434  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2396  argininosuccinate lyase  58.35 
 
 
482 aa  510  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1648  argininosuccinate lyase  62.36 
 
 
471 aa  508  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2366  argininosuccinate lyase  60.78 
 
 
476 aa  510  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23929  decreased coverage  0.0035121 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3518  argininosuccinate lyase  57.36 
 
 
476 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10100  argininosuccinate lyase  58.87 
 
 
478 aa  488  1e-137  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0675  argininosuccinate lyase  53.56 
 
 
505 aa  489  1e-137  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21670  argininosuccinate lyase  59.47 
 
 
502 aa  488  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335342  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0809  argininosuccinate lyase  57.05 
 
 
490 aa  482  1e-135  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2834  argininosuccinate lyase  59.62 
 
 
495 aa  482  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3523  argininosuccinate lyase  60.09 
 
 
470 aa  480  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.286619 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6164  argininosuccinate lyase  56.53 
 
 
477 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6457  argininosuccinate lyase  56.32 
 
 
477 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3307  argininosuccinate lyase  58.84 
 
 
470 aa  472  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2980  argininosuccinate lyase  59.27 
 
 
470 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0620413 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1985  argininosuccinate lyase  56.29 
 
 
480 aa  468  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290932  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2965  argininosuccinate lyase  59.05 
 
 
470 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3009  argininosuccinate lyase  59.05 
 
 
470 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11677  argininosuccinate lyase  57.76 
 
 
470 aa  462  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480026  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4987  argininosuccinate lyase  51.83 
 
 
488 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718333 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  44.32 
 
 
458 aa  442  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  49.35 
 
 
462 aa  441  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  45.86 
 
 
459 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0979  argininosuccinate lyase  53.59 
 
 
505 aa  429  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  48.1 
 
 
456 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  47.03 
 
 
441 aa  427  1e-118  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  46.62 
 
 
460 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  46.76 
 
 
458 aa  426  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  50.45 
 
 
459 aa  426  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  49.24 
 
 
464 aa  425  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  48.34 
 
 
468 aa  422  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  49.55 
 
 
463 aa  419  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0126  argininosuccinate lyase  45.54 
 
 
459 aa  420  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.900188  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  47.9 
 
 
469 aa  419  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  47.53 
 
 
466 aa  419  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  50 
 
 
465 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  50 
 
 
464 aa  415  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  50.77 
 
 
478 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  45.29 
 
 
461 aa  418  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  50.45 
 
 
464 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  47.56 
 
 
469 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  49.25 
 
 
475 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  50 
 
 
464 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  50.45 
 
 
464 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1458  argininosuccinate lyase  45.27 
 
 
460 aa  416  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3006  argininosuccinate lyase  43.45 
 
 
462 aa  412  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365153  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  46.43 
 
 
458 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0126  argininosuccinate lyase  43.68 
 
 
462 aa  412  1e-114  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013786  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  45.71 
 
 
481 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  46.09 
 
 
458 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 
459 aa  412  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  45.05 
 
 
459 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0841  argininosuccinate lyase  47.03 
 
 
458 aa  415  1e-114  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.330511  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  52.21 
 
 
465 aa  412  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  44.2 
 
 
462 aa  409  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  50.9 
 
 
467 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  46.65 
 
 
461 aa  410  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  45.64 
 
 
458 aa  411  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1807  argininosuccinate lyase  47.32 
 
 
461 aa  411  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  45.41 
 
 
458 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  44.2 
 
 
462 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  48.67 
 
 
459 aa  410  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  43.97 
 
 
462 aa  411  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  48.25 
 
 
463 aa  409  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  46.21 
 
 
458 aa  411  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  43.75 
 
 
462 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  48.47 
 
 
463 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  47.96 
 
 
464 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  45.19 
 
 
458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  44.2 
 
 
462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  45.61 
 
 
491 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  43.75 
 
 
462 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  46.07 
 
 
473 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3714  argininosuccinate lyase  46.43 
 
 
462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.564837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3660  argininosuccinate lyase  46.43 
 
 
462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  48.64 
 
 
464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>