More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1673 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1673  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
411 aa  820    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.272276 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1184  glycosyl transferase, group 1  70.3 
 
 
412 aa  561  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4345  glycosyl transferase, group 1  54.98 
 
 
447 aa  412  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6402  glycosyl transferase group 1  57.18 
 
 
517 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4246  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
753 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 
748 aa  103  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3648  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 
738 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0250737  normal  0.0159543 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
362 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
399 aa  98.6  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
409 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1955  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
768 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.303263  normal  0.277598 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  24.28 
 
 
391 aa  94.4  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 
390 aa  93.6  5e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 
419 aa  92.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  29.54 
 
 
446 aa  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 
395 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
422 aa  90.1  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  32.57 
 
 
392 aa  90.1  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 
414 aa  90.5  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  24.35 
 
 
387 aa  89  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 
398 aa  89.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  30.02 
 
 
367 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 
415 aa  89  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2766  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 
413 aa  88.6  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.36427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6058  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 
417 aa  87  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  29.85 
 
 
402 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  33.87 
 
 
433 aa  87  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 
360 aa  86.7  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  37.37 
 
 
367 aa  87  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  25.72 
 
 
391 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 
453 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
371 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  25.46 
 
 
391 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
426 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 
425 aa  84.3  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 
369 aa  84  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
402 aa  83.2  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 
405 aa  83.2  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 
396 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  36.71 
 
 
426 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  25.69 
 
 
405 aa  82.8  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 
424 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  27.99 
 
 
399 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 
413 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  25.58 
 
 
417 aa  80.5  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 
421 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  29.64 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
385 aa  80.1  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  26.64 
 
 
414 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 
419 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  30.53 
 
 
363 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
402 aa  79  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5459  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 
660 aa  79  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 
800 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.78 
 
 
382 aa  77.8  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.14 
 
 
405 aa  77.8  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
689 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  23.75 
 
 
396 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
410 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  32.09 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.14 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 
435 aa  77.8  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 
384 aa  77.4  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  30.98 
 
 
423 aa  77  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  28.84 
 
 
382 aa  77  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 
425 aa  76.6  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  26.32 
 
 
404 aa  77  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  24 
 
 
365 aa  76.6  0.0000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 
417 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
414 aa  76.6  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
398 aa  76.3  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  28.72 
 
 
388 aa  76.6  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  38.51 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 
419 aa  76.3  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  23.76 
 
 
373 aa  76.3  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 
374 aa  76.3  0.0000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0294  hypothetical protein  23.1 
 
 
395 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
420 aa  75.5  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
420 aa  75.5  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  32.31 
 
 
423 aa  75.1  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  25.46 
 
 
426 aa  75.5  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  24.56 
 
 
383 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  29.64 
 
 
467 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 
408 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 
434 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  25.92 
 
 
638 aa  74.7  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 
370 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  30.66 
 
 
422 aa  73.6  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  35.32 
 
 
768 aa  73.9  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  24.46 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 
405 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 
421 aa  73.6  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
412 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  32.12 
 
 
358 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
409 aa  73.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 
408 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 
439 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 
439 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>