230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1474 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1474  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  276  6e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4010  hypothetical protein  80.29 
 
 		 253 aa  229  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  44.03 
 
 		 231 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0505  hypothetical protein  42.61 
 
 		 233 aa  95.9  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722938 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  32.35 
 
 		 235 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  35.04 
 
 		 244 aa  88.2  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  35.34 
 
 		 226 aa  85.5  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  39.42 
 
 		 240 aa  85.5  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  35.43 
 
 		 237 aa  84.7  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  31.54 
 
 		 241 aa  84.7  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  33.33 
 
 		 223 aa  83.6  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  35.14 
 
 		 238 aa  83.6  9e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  37.04 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  34.68 
 
 		 237 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  32.43 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  35.51 
 
 		 240 aa  80.9  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  34.51 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  36.27 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  35.92 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  36.11 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  34.62 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  29.29 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  35.71 
 
 		 244 aa  78.2  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  33.06 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  39.42 
 
 		 246 aa  77.8  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  39.42 
 
 		 246 aa  77.8  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  35.38 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  29.63 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  30.36 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  34.95 
 
 		 292 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1181  protein of unknown function DUF45  38.24 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  31.25 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  28.69 
 
 		 300 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  35.29 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  32.48 
 
 		 249 aa  75.1  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  32.14 
 
 		 292 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  28.89 
 
 		 227 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  28.69 
 
 		 300 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  32.14 
 
 		 292 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  32.74 
 
 		 243 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  33.66 
 
 		 288 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  29.41 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  31.68 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  31.58 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  30.65 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  37.5 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  38 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  32.67 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  30.36 
 
 		 252 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  36.19 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  31.68 
 
 		 295 aa  72  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  31.68 
 
 		 292 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  31.68 
 
 		 292 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  31.68 
 
 		 292 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  31.68 
 
 		 292 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  31.68 
 
 		 292 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  31.68 
 
 		 292 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  31.68 
 
 		 292 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  31.68 
 
 		 303 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  30.69 
 
 		 295 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  30.69 
 
 		 295 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  30.69 
 
 		 295 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  31.58 
 
 		 316 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  32.86 
 
 		 242 aa  70.5  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  33.08 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  29.75 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  26.17 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  35.04 
 
 		 244 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0011  hypothetical protein  33.98 
 
 		 236 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  30 
 
 		 308 aa  67  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  25 
 
 		 238 aa  66.6  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2343  hypothetical protein  30.71 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.781257  normal  0.0217963 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1632  protein of unknown function DUF45  27.93 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0543  peptidase S26A, signal peptidase I  33.9 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00150578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  33.04 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  28.57 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0977  protein of unknown function DUF45  32.2 
 
 		 259 aa  65.1  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  27.13 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  34.07 
 
 		 249 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2267  hypothetical protein  32.71 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.083076  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04860  predicted metal-dependent hydrolase  33.63 
 
 		 184 aa  64.3  0.0000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  35.16 
 
 		 230 aa  63.9  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  29.51 
 
 		 243 aa  63.5  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1339  hypothetical protein  29.91 
 
 		 243 aa  63.9  0.0000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  33.91 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  28.07 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0228  hypothetical protein  34.07 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31038  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0661  zinc protease, putative  34.19 
 
 		 243 aa  62  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.792264  normal  0.0577046 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  34.07 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  29.27 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  27.88 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3377  hypothetical protein  29.7 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  34.07 
 
 		 256 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0448  hypothetical protein  28.93 
 
 		 319 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  26.21 
 
 		 270 aa  61.2  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  31.91 
 
 		 266 aa  61.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2082  hypothetical protein  32.74 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7655  putative metal-dependent hydrolase  30.77 
 
 		 198 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1164  hypothetical protein  26.72 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  30.21 
 
 		 254 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>