81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1315 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1315  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 163 aa  310  5.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.9488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3220  putative transcriptional regulator  61.11 
 
 		 164 aa  159  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00911883  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1290  transcriptional regulator, HxlR family  39.2 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0961  putative transcriptional regulator  41.11 
 
 		 134 aa  67  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1054  HxlR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3596  putative transcriptional regulator  37.21 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0219854  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2404  HxlR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.598252  normal  0.595258 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6227  transcriptional regulator, HxlR family  46.91 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56146  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7489  transcriptional regulator, HxlR family  45.24 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1972  putative transcriptional regulator  40.86 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000001755  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2088  HxlR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203524  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5059  putative transcriptional regulator  41.86 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306977 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1715  transcriptional regulator protein-like protein  43.68 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118442  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5094  HxlR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.709504  normal  0.631599 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1763  helix-turn-helix, HxlR type  36.27 
 
 		 113 aa  52  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.168632  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3120  putative transcriptional regulator  38.95 
 
 		 107 aa  52  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0075021  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2818  transcriptional regulator, HxlR family  31.25 
 
 		 117 aa  50.8  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1388  putative transcriptional regulator  39.77 
 
 		 111 aa  50.8  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.682529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 230 aa  50.8  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2054  putative transcriptional regulator  38.3 
 
 		 105 aa  49.7  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.295818  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  34.44 
 
 		 120 aa  48.5  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2191  transcriptional regulator, HxlR family  27.42 
 
 		 135 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3145  putative transcriptional regulator  39.53 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2492  putative transcriptional regulator  39.53 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298845  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1319  transcriptional regulator  29.89 
 
 		 118 aa  48.1  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2326  HxlR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 237 aa  48.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.503495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2057  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 113 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 158 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1421  transcriptional regulator, HxlR family  27.48 
 
 		 129 aa  47  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  36.26 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1090  HxlR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000252079  normal  0.0375915 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 120 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  28.57 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0609  transcriptional regulator, HxlR family  34.83 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.822325  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 223 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 223 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 223 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1528  putative transcriptional regulator  40.26 
 
 		 107 aa  45.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  28.57 
 
 		 115 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0882  transcriptional regulator, HxlR family protein  28.89 
 
 		 118 aa  45.4  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  31.58 
 
 		 149 aa  44.7  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2207  putative transcriptional regulator  39.13 
 
 		 110 aa  44.3  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0386773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  33.03 
 
 		 140 aa  44.3  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2289  hypothetical protein  29.17 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1536  transcriptional regulator, MarR family  34.26 
 
 		 307 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4912  helix-turn-helix, HxlR type  29.17 
 
 		 233 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 318 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3490  HxlR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  30.11 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  33.33 
 
 		 154 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 122 aa  42.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  30.11 
 
 		 114 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  30.11 
 
 		 114 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 114 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30402  predicted protein  31.63 
 
 		 398 aa  42.4  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305478  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1806  HxlR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 285 aa  42.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.123948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  28.41 
 
 		 150 aa  42  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0207  HxlR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 123 aa  42  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2878  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 112 aa  42  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2488  transcriptional regulator, HxlR family  27.55 
 
 		 118 aa  41.6  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 117 aa  41.2  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  29.03 
 
 		 114 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  26.14 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  29.03 
 
 		 114 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  36.56 
 
 		 222 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0502  HxlR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 167 aa  41.2  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3097  HxlR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 314 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1805  HxlR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 236 aa  40.8  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.843769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3157  HxlR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 314 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.45366 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3117  HxlR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 314 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0817694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  29.29 
 
 		 170 aa  40.8  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3019  transcriptional regulator, HxlR family  26.04 
 
 		 247 aa  40.8  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.179056  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  32.38 
 
 		 134 aa  40.8  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>