More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1010 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1010  peptide chain release factor 1  100 
 
 
356 aa  711    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527553  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3720  peptide chain release factor 1  83.19 
 
 
357 aa  560  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.565362 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1751  peptide chain release factor 1  65.82 
 
 
357 aa  483  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102915  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2419  peptide chain release factor 1  67.14 
 
 
355 aa  474  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.922635  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1656  peptide chain release factor 1  66.86 
 
 
350 aa  467  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1205  peptide chain release factor 1  63.56 
 
 
356 aa  463  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326603  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4148  peptide chain release factor 1  69.43 
 
 
363 aa  461  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0324  peptide chain release factor 1  63.71 
 
 
356 aa  460  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.119961 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6150  peptide chain release factor 1  65.35 
 
 
354 aa  455  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.749977  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0641  peptide chain release factor 1  67.73 
 
 
364 aa  455  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1286  peptide chain release factor 1  69.25 
 
 
373 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.258232 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3931  peptide chain release factor 1  69.16 
 
 
361 aa  451  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.337468  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1785  peptide chain release factor 1  65.77 
 
 
361 aa  443  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19209  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0888  peptide chain release factor 1  65.99 
 
 
350 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.255714  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1304  peptide chain release factor 1  64.66 
 
 
367 aa  436  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29910  peptide chain release factor 1  64.2 
 
 
358 aa  435  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.363268 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11326  peptide chain release factor 1  61.52 
 
 
357 aa  431  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.11651  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2352  peptide chain release factor 1  60.28 
 
 
357 aa  432  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000547652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2101  peptide chain release factor 1  67.44 
 
 
361 aa  431  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015284  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2459  peptide chain release factor 1  65.62 
 
 
366 aa  430  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2619  peptide chain release factor 1  59.44 
 
 
357 aa  430  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.254824  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4026  peptide chain release factor 1  65.97 
 
 
362 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3873  peptide chain release factor 1  60.28 
 
 
357 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0688189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3887  peptide chain release factor 1  60.28 
 
 
357 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553297  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3961  peptide chain release factor 1  60.28 
 
 
357 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.287406 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09920  peptide chain release factor 1  65.78 
 
 
361 aa  422  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3644  peptide chain release factor 1  64.78 
 
 
362 aa  414  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.99323  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1257  peptide chain release factor 1  66.76 
 
 
355 aa  410  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626202  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1236  peptide chain release factor 1  59.15 
 
 
362 aa  405  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.417509  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4339  peptide chain release factor 1  59.55 
 
 
357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0776399 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08070  peptide chain release factor 1  63.46 
 
 
369 aa  399  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1086  peptide chain release factor 1  56.2 
 
 
365 aa  392  1e-108  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1889  peptide chain release factor 1  55.71 
 
 
362 aa  391  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.640153  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1909  peptide chain release factor 1  59.49 
 
 
364 aa  388  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150349  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2307  peptide chain release factor 1  60.8 
 
 
357 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1061  peptide chain release factor 1  67.26 
 
 
392 aa  377  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.742793  normal  0.892078 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18340  peptide chain release factor 1  61.8 
 
 
357 aa  375  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143544  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  50 
 
 
356 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  51.25 
 
 
356 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19240  peptide chain release factor 1  58.66 
 
 
378 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  51.33 
 
 
357 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  52.27 
 
 
355 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  49.28 
 
 
355 aa  348  7e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0063  peptide chain release factor 1  51.4 
 
 
355 aa  348  8e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000318273  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  50.73 
 
 
355 aa  347  1e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 
355 aa  347  2e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  47.43 
 
 
357 aa  345  6e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  48.86 
 
 
356 aa  345  7e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  46.65 
 
 
355 aa  343  2e-93  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0836  peptide chain release factor 1  47.29 
 
 
356 aa  342  7e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1652  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 
364 aa  342  7e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.534857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  49.12 
 
 
358 aa  341  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  48.71 
 
 
355 aa  340  2e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  46 
 
 
359 aa  338  7e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  48.83 
 
 
358 aa  338  9e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  48.83 
 
 
355 aa  338  9e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  52.12 
 
 
372 aa  338  9e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  48.83 
 
 
358 aa  338  9e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  48.83 
 
 
358 aa  338  9e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  48.83 
 
 
358 aa  338  9e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  48.83 
 
 
358 aa  338  9e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  48.83 
 
 
355 aa  338  9e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  47.95 
 
 
355 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0279  peptide chain release factor 1  52.92 
 
 
347 aa  337  9.999999999999999e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.156801  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  46.94 
 
 
355 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  46.93 
 
 
358 aa  336  3.9999999999999995e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  48.54 
 
 
358 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0980  peptide chain release factor 1  47.99 
 
 
356 aa  335  7.999999999999999e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000659041  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  44.57 
 
 
358 aa  334  1e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  48.86 
 
 
355 aa  333  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  48.21 
 
 
356 aa  333  3e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  47.84 
 
 
360 aa  333  3e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  45.22 
 
 
360 aa  330  2e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  46.84 
 
 
356 aa  330  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  46.09 
 
 
367 aa  330  3e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  45.82 
 
 
358 aa  329  4e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  48.32 
 
 
360 aa  329  4e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  47.85 
 
 
361 aa  329  4e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  47.85 
 
 
361 aa  329  4e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  42.18 
 
 
359 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0750  peptide chain release factor 1  54.46 
 
 
354 aa  328  9e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322203  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  46.54 
 
 
357 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  45.85 
 
 
357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  44.32 
 
 
356 aa  327  3e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  47.47 
 
 
361 aa  326  3e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  43.85 
 
 
357 aa  326  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  44.57 
 
 
353 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0041  peptide chain release factor 1  46.96 
 
 
358 aa  326  5e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.334875 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  46 
 
 
359 aa  325  5e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1808  peptide chain release factor 1  49.57 
 
 
357 aa  325  6e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2780  peptide chain release factor 1  51 
 
 
356 aa  325  6e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.014775  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1395  peptide chain release factor 1  48.29 
 
 
358 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  47.29 
 
 
358 aa  325  9e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  45.82 
 
 
361 aa  324  1e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  45.19 
 
 
360 aa  324  1e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  45.19 
 
 
360 aa  324  1e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  48.22 
 
 
370 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  47.34 
 
 
370 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  47.92 
 
 
356 aa  322  6e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  48.14 
 
 
357 aa  322  8e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>