More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4334 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4334  putative cytochrome P450  100 
 
 		 484 aa  980    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.686964 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2803  putative cytochrome P450-family protein  40.5 
 
 		 414 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348302  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4812  cytochrome P450-family protein  40.63 
 
 		 446 aa  308  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5491  putative cytochrome P450  41.63 
 
 		 488 aa  293  4e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.767325  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2751  putative cytochrome P450-family protein  40.1 
 
 		 426 aa  287  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.581871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1142  putative cytochrome P450  40.2 
 
 		 421 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4583  putative cytochrome P450  40.3 
 
 		 471 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5490  putative cytochrome P450  39.8 
 
 		 437 aa  278  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0347822  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33530  cytochrome P450  39.95 
 
 		 410 aa  261  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.101916  normal  0.234343 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2975  putative cytochrome P450  39.3 
 
 		 452 aa  254  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1747  putative cytochrome P450  37.31 
 
 		 454 aa  248  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0264528  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1433  Cytochrome P450-like protein  35.04 
 
 		 424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.667112  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4556  putative cytochrome P450  36.57 
 
 		 442 aa  242  9e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2597  Cytochrome P450  36.23 
 
 		 500 aa  227  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0573143  normal  0.048774 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4420  putative cytochrome P450  35.31 
 
 		 440 aa  209  7e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4184  cytochrome P450 monooxygenase  34.54 
 
 		 406 aa  202  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.1685  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3959  Cytochrome P450-like protein  35 
 
 		 465 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  30.49 
 
 		 409 aa  159  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1748  cytochrome P450-family protein  31.27 
 
 		 373 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.794769  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  31.11 
 
 		 412 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  28.99 
 
 		 410 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  30.14 
 
 		 426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2724  cytochrome P450  31.01 
 
 		 409 aa  147  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118546  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4949  cytochrome P450  30.33 
 
 		 412 aa  145  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  27.96 
 
 		 411 aa  143  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  27.43 
 
 		 405 aa  141  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  29.93 
 
 		 417 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  29.17 
 
 		 418 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  26.84 
 
 		 420 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  29.38 
 
 		 419 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  31.37 
 
 		 406 aa  137  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  28.57 
 
 		 422 aa  133  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  30.47 
 
 		 400 aa  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  25 
 
 		 411 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2750  cytochrome P450  29.12 
 
 		 416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  29.93 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  28.61 
 
 		 396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6983  cytochrome P450-family protein  28.5 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4555  cytochrome P450  31.48 
 
 		 366 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  27.85 
 
 		 420 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  31.5 
 
 		 423 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  24.44 
 
 		 411 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  24.75 
 
 		 411 aa  127  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1432  cytochrome P450  29.49 
 
 		 408 aa  127  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.675359  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  28.36 
 
 		 408 aa  127  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  28.89 
 
 		 402 aa  126  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  29.06 
 
 		 411 aa  126  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3533  cytochrome P450  28.87 
 
 		 432 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  27.11 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  25.73 
 
 		 411 aa  125  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4185  cytochrome P450  29.28 
 
 		 412 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059363  normal  0.410694 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  29.2 
 
 		 398 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5282  cytochrome P450  28.05 
 
 		 424 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  28.05 
 
 		 395 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  29.29 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  27.12 
 
 		 395 aa  121  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  26.35 
 
 		 411 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  28.5 
 
 		 400 aa  120  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  26.35 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  26.35 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  30.59 
 
 		 443 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  28.47 
 
 		 409 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  26.03 
 
 		 411 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  26.03 
 
 		 411 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  28.38 
 
 		 408 aa  117  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2582  cytochrome P450  28.57 
 
 		 423 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.416869  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  25.71 
 
 		 411 aa  117  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  25.71 
 
 		 411 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4427  cytochrome P450  30.29 
 
 		 382 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2544  cytochrome P450  28.27 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2589  cytochrome P450  28.27 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7442  Cytochrome P450-like protein  28.16 
 
 		 571 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  27.72 
 
 		 401 aa  113  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  28.14 
 
 		 399 aa  114  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  29.5 
 
 		 398 aa  113  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11908  cytochrome P450 140 cyp140  29.78 
 
 		 438 aa  113  9e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.818643 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2976  cytochrome P450-family protein  26.9 
 
 		 367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  29.49 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  30.55 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  27.89 
 
 		 407 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  26.79 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  27.89 
 
 		 407 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0290  putative cytochrome P450  26.47 
 
 		 405 aa  110  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  29.06 
 
 		 402 aa  110  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  28.85 
 
 		 421 aa  109  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4902  cytochrome P450  30.29 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  26.85 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  28 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3059  cytochrome P450  27.46 
 
 		 417 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222659  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  27.84 
 
 		 388 aa  107  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  26.77 
 
 		 407 aa  106  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  27.37 
 
 		 403 aa  106  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  28.84 
 
 		 403 aa  106  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  28.31 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  27.25 
 
 		 399 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  27.92 
 
 		 421 aa  106  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  25.55 
 
 		 410 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4706  cytochrome P450  30.94 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0288  cytochrome P450  28.76 
 
 		 444 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000866708  normal  0.107645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  29.09 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>