More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3720 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3720  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 357 aa  703    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.565362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1010  peptide chain release factor 1  81.92 
 
 		 356 aa  548  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2419  peptide chain release factor 1  71.14 
 
 		 355 aa  486  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.922635  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4148  peptide chain release factor 1  72.86 
 
 		 363 aa  479  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1656  peptide chain release factor 1  68.47 
 
 		 350 aa  478  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3931  peptide chain release factor 1  72.29 
 
 		 361 aa  475  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.337468  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0324  peptide chain release factor 1  67.8 
 
 		 356 aa  475  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119961 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1751  peptide chain release factor 1  67.8 
 
 		 357 aa  477  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102915  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6150  peptide chain release factor 1  69.21 
 
 		 354 aa  476  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.749977  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1205  peptide chain release factor 1  66.67 
 
 		 356 aa  473  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326603  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0888  peptide chain release factor 1  68.27 
 
 		 350 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.255714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1304  peptide chain release factor 1  68.12 
 
 		 367 aa  454  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0641  peptide chain release factor 1  69.97 
 
 		 364 aa  457  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2101  peptide chain release factor 1  68.64 
 
 		 361 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015284  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29910  peptide chain release factor 1  66.57 
 
 		 358 aa  444  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.363268 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11326  peptide chain release factor 1  63.2 
 
 		 357 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.11651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3887  peptide chain release factor 1  64.2 
 
 		 357 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553297  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3873  peptide chain release factor 1  64.2 
 
 		 357 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0688189 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3961  peptide chain release factor 1  64.2 
 
 		 357 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287406 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1286  peptide chain release factor 1  68.09 
 
 		 373 aa  435  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.258232 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1785  peptide chain release factor 1  66.07 
 
 		 361 aa  434  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19209  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1236  peptide chain release factor 1  63.2 
 
 		 362 aa  432  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.417509  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2619  peptide chain release factor 1  61.13 
 
 		 357 aa  430  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.254824  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2352  peptide chain release factor 1  61.41 
 
 		 357 aa  427  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000547652 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4026  peptide chain release factor 1  67.05 
 
 		 362 aa  424  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3644  peptide chain release factor 1  67.17 
 
 		 362 aa  420  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.99323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09920  peptide chain release factor 1  67.66 
 
 		 361 aa  419  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4339  peptide chain release factor 1  62.04 
 
 		 357 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776399 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2459  peptide chain release factor 1  65.35 
 
 		 366 aa  412  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08070  peptide chain release factor 1  64.79 
 
 		 369 aa  410  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1257  peptide chain release factor 1  66.12 
 
 		 355 aa  398  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626202  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1889  peptide chain release factor 1  56.73 
 
 		 362 aa  396  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.640153  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1909  peptide chain release factor 1  61.58 
 
 		 364 aa  394  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150349  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1086  peptide chain release factor 1  56.48 
 
 		 365 aa  393  1e-108  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2307  peptide chain release factor 1  61.42 
 
 		 357 aa  391  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18340  peptide chain release factor 1  63.38 
 
 		 357 aa  387  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1061  peptide chain release factor 1  67.36 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.742793  normal  0.892078 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  53.89 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  51.11 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19240  peptide chain release factor 1  60.39 
 
 		 378 aa  363  3e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  50.86 
 
 		 357 aa  360  2e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  52.71 
 
 		 355 aa  360  3e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  51.28 
 
 		 355 aa  353  2e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  47.74 
 
 		 357 aa  353  2.9999999999999997e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 355 aa  348  7e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  49.16 
 
 		 358 aa  348  9e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  51.4 
 
 		 355 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  48.42 
 
 		 359 aa  347  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0063  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 355 aa  347  2e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000318273  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  51.42 
 
 		 355 aa  347  2e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  51.4 
 
 		 355 aa  346  3e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  50.29 
 
 		 360 aa  345  5e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0980  peptide chain release factor 1  48.85 
 
 		 356 aa  345  5e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000659041  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  49.44 
 
 		 361 aa  345  7e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  48.7 
 
 		 367 aa  344  1e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  50.29 
 
 		 358 aa  344  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  49.42 
 
 		 355 aa  344  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  49.42 
 
 		 358 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  49.42 
 
 		 358 aa  344  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  49.42 
 
 		 358 aa  344  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  49.42 
 
 		 355 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  49.42 
 
 		 358 aa  344  2e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  49.42 
 
 		 358 aa  344  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1652  peptide chain release factor 1  50.7 
 
 		 364 aa  342  4e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.534857  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 356 aa  343  4e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  49.12 
 
 		 358 aa  342  5e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  48.6 
 
 		 358 aa  342  8e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  51.14 
 
 		 355 aa  342  8e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 355 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  45.48 
 
 		 358 aa  339  4e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  49.18 
 
 		 356 aa  339  4e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0836  peptide chain release factor 1  47.25 
 
 		 356 aa  338  9e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  49.28 
 
 		 372 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1808  peptide chain release factor 1  51.29 
 
 		 357 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 		 360 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 		 363 aa  335  5e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  45.25 
 
 		 355 aa  334  2e-90  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0442  peptide chain release factor 1  48.02 
 
 		 359 aa  333  2e-90  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.34864  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  46.67 
 
 		 355 aa  333  3e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2714  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 355 aa  333  3e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.64557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  46.09 
 
 		 358 aa  333  3e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  47.62 
 
 		 356 aa  332  4e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  45.83 
 
 		 355 aa  333  4e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0247  peptide chain release factor 1  46.45 
 
 		 359 aa  331  9e-90  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.736319  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  54.41 
 
 		 355 aa  330  3e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  48.57 
 
 		 360 aa  330  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  46.24 
 
 		 360 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  44.38 
 
 		 362 aa  329  5.0000000000000004e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0750  peptide chain release factor 1  55.08 
 
 		 354 aa  328  6e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322203  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0597  peptide chain release factor 1  47.18 
 
 		 359 aa  328  6e-89  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.349785  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 357 aa  328  6e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  44.88 
 
 		 360 aa  328  7e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  44.88 
 
 		 360 aa  328  7e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  48.29 
 
 		 360 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  46.99 
 
 		 361 aa  327  1.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  46.99 
 
 		 361 aa  327  1.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  46.13 
 
 		 357 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  48.29 
 
 		 360 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  48.29 
 
 		 360 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  47.65 
 
 		 357 aa  326  3e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>