More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2268 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  100 
 
 		 139 aa  291  3e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  73.72 
 
 		 142 aa  218  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  62.02 
 
 		 137 aa  179  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  60.15 
 
 		 136 aa  179  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  62.88 
 
 		 138 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  63.49 
 
 		 131 aa  178  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  65.12 
 
 		 135 aa  176  7e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  60 
 
 		 137 aa  175  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  62.2 
 
 		 159 aa  172  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  60.87 
 
 		 137 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  59.09 
 
 		 137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  59.42 
 
 		 137 aa  169  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  62.2 
 
 		 183 aa  168  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3669  methionine-R-sulfoxide reductase  60.47 
 
 		 133 aa  166  9e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.947591  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24060  methionine-R-sulfoxide reductase  61.24 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0197494 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  63.2 
 
 		 147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33670  methionine-R-sulfoxide reductase  58.73 
 
 		 131 aa  164  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.263102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1379  methionine-R-sulfoxide reductase  58.46 
 
 		 133 aa  164  5e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.217446  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0293  methionine-R-sulfoxide reductase  59.06 
 
 		 133 aa  163  6.9999999999999995e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3481  methionine-R-sulfoxide reductase  58.91 
 
 		 133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  59.35 
 
 		 140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  57.03 
 
 		 140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  57.94 
 
 		 131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0697  methionine-R-sulfoxide reductase  55.65 
 
 		 135 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  58.59 
 
 		 148 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  61.29 
 
 		 140 aa  161  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0705  methionine-R-sulfoxide reductase  63.64 
 
 		 137 aa  161  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.906192  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  56.69 
 
 		 136 aa  160  4.0000000000000004e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  60.16 
 
 		 136 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  57.48 
 
 		 135 aa  160  6e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 		 131 aa  160  6e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  57.81 
 
 		 131 aa  160  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  53.68 
 
 		 141 aa  159  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0833  methionine-R-sulfoxide reductase  57.89 
 
 		 138 aa  159  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  60.48 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0873  methionine-R-sulfoxide reductase  57.89 
 
 		 138 aa  159  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0384215 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2451  PilB-related protein  61.9 
 
 		 137 aa  158  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  56.83 
 
 		 141 aa  158  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00783664 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  58.73 
 
 		 136 aa  159  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  53.97 
 
 		 136 aa  157  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  58.87 
 
 		 163 aa  157  7e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  53.23 
 
 		 142 aa  156  7e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  57.81 
 
 		 150 aa  156  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  59.2 
 
 		 142 aa  156  8e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1768  methionine-R-sulfoxide reductase  56.92 
 
 		 135 aa  156  9e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205069  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  53.17 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  56.69 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  55.56 
 
 		 131 aa  154  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1612  methionine-R-sulfoxide reductase  50.4 
 
 		 130 aa  154  3e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0472443  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  55.91 
 
 		 131 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  54.69 
 
 		 134 aa  154  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  59.06 
 
 		 133 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  53.49 
 
 		 138 aa  154  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7390  methionine-R-sulfoxide reductase  55.47 
 
 		 136 aa  154  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.508661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  57.48 
 
 		 139 aa  154  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1893  methionine sulfoxide reductase B  55.91 
 
 		 140 aa  153  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0416766  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  57.03 
 
 		 131 aa  154  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  58.06 
 
 		 132 aa  153  7e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  57.03 
 
 		 131 aa  153  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  55.12 
 
 		 131 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2259  methionine-R-sulfoxide reductase  55.38 
 
 		 133 aa  152  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.128269 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  57.03 
 
 		 131 aa  152  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  55.81 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0799  methionine-R-sulfoxide reductase  56.39 
 
 		 138 aa  152  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126104  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  53.97 
 
 		 180 aa  152  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2975  protein-methionine-S-oxide reductase  63.64 
 
 		 135 aa  152  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0725689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6715  Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase  54.96 
 
 		 133 aa  153  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.264414 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  54.76 
 
 		 180 aa  153  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  57.26 
 
 		 134 aa  152  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  55.12 
 
 		 131 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0822  methionine-R-sulfoxide reductase  51.47 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000300416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  58.73 
 
 		 134 aa  151  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3799  methionine-R-sulfoxide reductase  53.97 
 
 		 161 aa  151  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4765  methionine-R-sulfoxide reductase  55.2 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220604  normal  0.0308681 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1595  methionine-R-sulfoxide reductase  54.76 
 
 		 134 aa  151  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  55.91 
 
 		 138 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  55.91 
 
 		 138 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  57.36 
 
 		 138 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  56.69 
 
 		 165 aa  150  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  56.69 
 
 		 146 aa  150  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  52.76 
 
 		 133 aa  150  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  51.52 
 
 		 155 aa  150  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  57.14 
 
 		 132 aa  149  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1330  methionine sulfoxide reductase B  54.33 
 
 		 171 aa  149  8.999999999999999e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  51.97 
 
 		 164 aa  149  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5715  methionine-R-sulfoxide reductase  55.12 
 
 		 171 aa  149  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.967491  normal  0.285245 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5959  methionine-R-sulfoxide reductase  55.12 
 
 		 171 aa  149  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109162  normal  0.856375 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1589  methionine-R-sulfoxide reductase  53.9 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  54.47 
 
 		 136 aa  149  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  55.97 
 
 		 147 aa  149  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.704968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2948  methionine-R-sulfoxide reductase  55.73 
 
 		 137 aa  148  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948084 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2028  methionine-R-sulfoxide reductase  54.96 
 
 		 137 aa  147  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3821  methionine sulfoxide reductase B  52.55 
 
 		 165 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2329  methionine sulfoxide reductase B  52.85 
 
 		 142 aa  147  4e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1676  methionine-R-sulfoxide reductase  54.96 
 
 		 137 aa  147  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6665  methionine sulfoxide reductase B  51.88 
 
 		 176 aa  147  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181254  normal  0.0736718 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  55.2 
 
 		 144 aa  147  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  52.76 
 
 		 167 aa  147  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2643  methionine-R-sulfoxide reductase  51.82 
 
 		 137 aa  147  6e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.427446  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  53.12 
 
 		 166 aa  147  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>