More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2234 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2234  ABC transporter related  100 
 
 		 323 aa  634    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.686469  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5742  ABC transporter related protein  60.54 
 
 		 319 aa  309  5e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  45.3 
 
 		 302 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  46.62 
 
 		 301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6155  ABC transporter related  42.36 
 
 		 368 aa  219  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.587956  normal  0.435406 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  42.67 
 
 		 300 aa  218  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  46.77 
 
 		 326 aa  217  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  40.24 
 
 		 346 aa  214  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  39.41 
 
 		 320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  52.38 
 
 		 301 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  40.86 
 
 		 304 aa  209  7e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  46.82 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  48.84 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1156  ABC transporter related protein  43.65 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0354846  hitchhiker  0.000104476 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1175  ABC transporter related  49.59 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.181845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  48.02 
 
 		 304 aa  202  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  41.72 
 
 		 310 aa  202  7e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2485  ABC transporter related protein  40.89 
 
 		 304 aa  202  8e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  36.6 
 
 		 307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2895  ABC transporter related  49.77 
 
 		 326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal  0.0275551 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0908  ABC transporter ATP-binding protein  36.93 
 
 		 307 aa  199  7e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.53 
 
 		 368 aa  198  7.999999999999999e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  41.22 
 
 		 303 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  41.22 
 
 		 331 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  37.29 
 
 		 303 aa  197  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.22 
 
 		 331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  41.22 
 
 		 303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  40.82 
 
 		 331 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0929  ABC transporter related  42.12 
 
 		 318 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.31859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02610  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.36 
 
 		 341 aa  194  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  36.96 
 
 		 303 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0642  ABC transporter related  41 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0145806  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1823  ABC transporter related  48.15 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.554896  normal  0.879198 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0249  ABC transporter related  44.62 
 
 		 336 aa  193  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  41.6 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.57 
 
 		 309 aa  192  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  42.21 
 
 		 457 aa  192  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.57 
 
 		 309 aa  192  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5495  ABC transporter, ATP-binding protein  35.59 
 
 		 305 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  35.93 
 
 		 305 aa  192  9e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  35.25 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02380  ABC transporter related  35.87 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01670  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.36 
 
 		 329 aa  191  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.684849  normal  0.194324 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  36.92 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5252  ABC transporter ATP-binding protein  35.25 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  36.79 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5650  ABC transporter ATP-binding protein  35.25 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  36.79 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  35.5 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  43.2 
 
 		 897 aa  190  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1292  ABC transporter related protein  49.55 
 
 		 351 aa  190  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  35.69 
 
 		 305 aa  189  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3425  ABC transporter related protein  43.92 
 
 		 340 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458573  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6513  ABC transporter related  49.34 
 
 		 409 aa  189  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0552468 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  44.39 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1642  ABC transporter related  39.46 
 
 		 301 aa  188  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0749423 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  38.49 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  35.02 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.23 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  35.02 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0386  ABC transporter related  46.81 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  41.44 
 
 		 305 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 		 309 aa  187  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  36.45 
 
 		 305 aa  186  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  41.41 
 
 		 300 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0607  ABC transporter related  44.67 
 
 		 347 aa  187  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000713126 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06055  hypothetical protein  33.44 
 
 		 299 aa  187  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  39.34 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  34.8 
 
 		 306 aa  186  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  35.49 
 
 		 309 aa  186  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.76 
 
 		 319 aa  186  6e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1167  ABC transporter related  46.73 
 
 		 232 aa  186  6e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal  0.478862 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  38.56 
 
 		 315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03750  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.95 
 
 		 237 aa  185  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.591537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5295  ABC transporter related  45.83 
 
 		 406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.569145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  37.79 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4755  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 242 aa  183  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.46 
 
 		 299 aa  184  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4839  ABC transporter related protein  43.09 
 
 		 322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3921  ABC transporter-related protein  39.34 
 
 		 305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.463673  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  37.7 
 
 		 309 aa  182  7e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7061  ABC transporter related  35.23 
 
 		 297 aa  182  8.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.505096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.37 
 
 		 944 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  42.23 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3301  ABC transporter related protein  49.32 
 
 		 306 aa  182  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.377119  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2348  ABC transporter related  32.89 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  38.76 
 
 		 303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  49.3 
 
 		 258 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  39.34 
 
 		 310 aa  179  4e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  47.03 
 
 		 245 aa  179  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  45.54 
 
 		 968 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.8 
 
 		 324 aa  179  4.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  38.81 
 
 		 309 aa  179  5.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3430  ABC transporter-like protein  46.95 
 
 		 236 aa  178  9e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.668414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  39.34 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5490  ABC transporter related  31.88 
 
 		 301 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.691656  normal  0.086802 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  48.65 
 
 		 242 aa  178  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.23 
 
 		 240 aa  178  1e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.874439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>