More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1966 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1966  transposase, IS605 OrfB  100 
 
 		 267 aa  535  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2681  transposase  67.73 
 
 		 261 aa  322  4e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2775  transposase, IS605 OrfB  68.92 
 
 		 356 aa  322  4e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3430  transposase  68.13 
 
 		 442 aa  322  5e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3267  transposase, IS605 OrfB  68.53 
 
 		 356 aa  320  9.999999999999999e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5114  IS605 family transposase OrfB  67.35 
 
 		 461 aa  318  5e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279407  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5677  IS605 family transposase OrfB  64.73 
 
 		 442 aa  313  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0685  IS605 family transposase OrfB  64.73 
 
 		 442 aa  313  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.289129 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2921  transposase, IS605 OrfB  65.05 
 
 		 249 aa  249  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0840725 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2297  transposase IS605 OrfB  71.52 
 
 		 192 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.294637  normal  0.708384 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1615  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  49.2 
 
 		 420 aa  204  8e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00623083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2200  transposase IS605 OrfB  80.65 
 
 		 134 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3537  transposase, IS605 OrfB family  39.04 
 
 		 393 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0103085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4920  transposase, IS607 family  39.04 
 
 		 393 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2141  transposase, IS605 OrfB family  42.13 
 
 		 363 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954173 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2003  IS605 family transposase OrfB  40.95 
 
 		 409 aa  165  5.9999999999999996e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1223  transposase  42.08 
 
 		 440 aa  161  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1343  transposase, IS607 family  40.64 
 
 		 393 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  42.26 
 
 		 410 aa  156  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  40.59 
 
 		 383 aa  153  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  39.13 
 
 		 399 aa  152  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3275  transposase  41.98 
 
 		 405 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151083  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  41 
 
 		 405 aa  149  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  40.15 
 
 		 405 aa  148  8e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  40.69 
 
 		 395 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  40.83 
 
 		 398 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  40.83 
 
 		 398 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  44.02 
 
 		 410 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3743  transposase  36.74 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  36.74 
 
 		 393 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  35.81 
 
 		 370 aa  144  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  40.42 
 
 		 398 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  35.35 
 
 		 370 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  35.81 
 
 		 370 aa  143  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  41.2 
 
 		 368 aa  143  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  38.83 
 
 		 390 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  33.65 
 
 		 370 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1657  transposase  34.12 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  35.35 
 
 		 370 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  35.81 
 
 		 370 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1266  IS605 family transposase OrfB  39.57 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  41.35 
 
 		 410 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  39.71 
 
 		 406 aa  138  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  33.65 
 
 		 370 aa  137  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  42.93 
 
 		 377 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  34.88 
 
 		 393 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  42.21 
 
 		 377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  35.04 
 
 		 403 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  35.04 
 
 		 403 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  35.04 
 
 		 403 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  35.04 
 
 		 403 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  39.02 
 
 		 403 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  38.26 
 
 		 399 aa  135  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  38.26 
 
 		 399 aa  135  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  42.71 
 
 		 424 aa  135  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0319  transposase  33.82 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.484329  normal  0.853888 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5487  IS605 family transposase OrfB  55.83 
 
 		 293 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.643829  normal  0.289527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  34.62 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  36.36 
 
 		 393 aa  133  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  32.73 
 
 		 372 aa  133  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  32.85 
 
 		 370 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  32.23 
 
 		 370 aa  132  9e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  37.5 
 
 		 393 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  36 
 
 		 391 aa  130  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  35.89 
 
 		 381 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3217  transposase  34.78 
 
 		 394 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  40.64 
 
 		 381 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1391  transposase, IS605 OrfB family  34.47 
 
 		 403 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000173221  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12899  transposase  41.67 
 
 		 460 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0267522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  36.76 
 
 		 391 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  35.1 
 
 		 405 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  40.68 
 
 		 377 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0442  transposase  43.75 
 
 		 384 aa  126  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469255  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  39.72 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  33.17 
 
 		 373 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  33.17 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  35.29 
 
 		 391 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  36.36 
 
 		 408 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  33.17 
 
 		 372 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  33.17 
 
 		 372 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  33.17 
 
 		 372 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  36.36 
 
 		 381 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  41.81 
 
 		 375 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  33.17 
 
 		 373 aa  122  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0348  IS605 family transposase OrfB  37.64 
 
 		 362 aa  122  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0991817  normal  0.583483 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  32.69 
 
 		 372 aa  122  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4149  IS605 family transposase OrfB  36.36 
 
 		 367 aa  122  8e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.247919 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  37.02 
 
 		 373 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12993  transposase  39.53 
 
 		 459 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000929698  normal  0.662784 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4184  IS605 family transposase OrfB  36.36 
 
 		 367 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.90515  normal  0.53705 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2768  transposase  38.46 
 
 		 392 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000132039  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  34.39 
 
 		 399 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2515  transposase, IS605 OrfB family  32.52 
 
 		 326 aa  120  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  32.11 
 
 		 383 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0757  IS605 family transposase OrfB  33.65 
 
 		 382 aa  120  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.825829  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5745  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  47.93 
 
 		 381 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  0.0649876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7865  IS605 family transposase OrfB  51.35 
 
 		 381 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  35.38 
 
 		 404 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  35.38 
 
 		 404 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  36.1 
 
 		 370 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>