53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3873 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3873  hypothetical protein  100 
 
 
647 aa  1342    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437353  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1419  Glycoside hydrolase 97  72.07 
 
 
648 aa  996    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.067122  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0476  alpha-glucosidase, putative, adg97A  37.6 
 
 
643 aa  444  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0790  alpha-glucosidase  36.66 
 
 
661 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0155602  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2159  alpha-glucosidase, putative, adg97A  37.18 
 
 
658 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2499  putative alpha-glucosidase  31.4 
 
 
674 aa  300  7e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1153  putative alpha-glucosidase  29.75 
 
 
574 aa  251  4e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2469  Glycoside hydrolase 97  28.78 
 
 
641 aa  241  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3876  Glycoside hydrolase 97  27.23 
 
 
571 aa  236  1.0000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0907495  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2708  hypothetical protein  26.23 
 
 
629 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0314889  normal  0.739389 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3217  alpha-glucosidase, putative  24.72 
 
 
682 aa  148  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751285  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2298  putative alpha-glucosidase  24.22 
 
 
647 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0169  putative alpha-glucosidase  24.08 
 
 
656 aa  144  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23190  alpha-glucosidase  25.2 
 
 
701 aa  143  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243429  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1312  putative alpha-glucosidase  23.44 
 
 
655 aa  140  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1420  hypothetical protein  25.28 
 
 
649 aa  140  8.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.828826  normal  0.205294 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4959  hypothetical protein  24.01 
 
 
659 aa  137  8e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1628  putative alpha-glucosidase  24.16 
 
 
678 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0539219  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2360  putative alpha-glucosidase  24.53 
 
 
679 aa  134  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103256  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5410  alpha-glucosidase, putative  27.54 
 
 
648 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0179561  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1209  hypothetical protein  25.04 
 
 
726 aa  134  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3590  hypothetical protein  26.05 
 
 
630 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116623  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5726  Glycoside hydrolase 97  21.95 
 
 
656 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.035847 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1400  hypothetical protein  23.72 
 
 
704 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4326  hypothetical protein  22.98 
 
 
672 aa  123  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4429  hypothetical protein  23.23 
 
 
707 aa  121  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.857441  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51780  alpha-glucosidase  22.15 
 
 
673 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.816262  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0058  Glycoside hydrolase 97  23.91 
 
 
693 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.52966 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1394  hypothetical protein  21.59 
 
 
700 aa  120  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.872498  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1777  alpha-glucosidase  23.82 
 
 
697 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0928  hypothetical protein  21.87 
 
 
728 aa  113  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.453447  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2740  alpha-glucosidase  21.59 
 
 
703 aa  111  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2002  alpha-glucosidase  23.55 
 
 
727 aa  110  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0626  alpha-glucosidase  23.01 
 
 
727 aa  108  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0367  putative alpha-glucosidase  21.91 
 
 
677 aa  107  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5767  putative alpha-glucosidase  22.64 
 
 
711 aa  103  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1876  alpha-glucosidase  22.4 
 
 
707 aa  103  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.507439 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1108  alpha-glucosidase  22.22 
 
 
676 aa  101  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1892  alpha-glucosidase  22.43 
 
 
682 aa  101  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2329  alpha-glucosidase  22.76 
 
 
710 aa  101  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0777  hypothetical protein  23.74 
 
 
606 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1931  alpha-glucosidase  22.27 
 
 
703 aa  96.3  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2445  alpha-glucosidase  22.48 
 
 
710 aa  96.3  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.607095  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0185  alpha-glucosidase  22.08 
 
 
680 aa  95.1  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2329  alpha-glucosidase  22.48 
 
 
710 aa  95.5  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20719  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2102  alpha-glucosidase  22.08 
 
 
703 aa  95.1  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.869354  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2450  alpha-glucosidase  23.28 
 
 
699 aa  95.1  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2017  alpha-glucosidase  22.83 
 
 
702 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.248833  hitchhiker  0.00490164 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0590  alpha-glucosidase  23.72 
 
 
684 aa  93.6  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.225417  normal  0.0221919 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1019  alpha-glucosidase  22.51 
 
 
683 aa  93.2  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1876  alpha-glucosidase  21.97 
 
 
703 aa  90.9  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3805  hypothetical protein  20.8 
 
 
615 aa  69.3  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  20.83 
 
 
1255 aa  66.2  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>