More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3177 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3177  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 471 aa  967    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.733678  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2843  AMP-dependent synthetase and ligase  49.01 
 
 		 459 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0145799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1979  AMP-dependent synthetase and ligase  32.01 
 
 		 830 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.10033  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2025  AMP-dependent synthetase and ligase  32.01 
 
 		 830 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1959  AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 		 830 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5747  AMP-dependent synthetase and ligase  30.95 
 
 		 831 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2019  AMP-dependent synthetase and ligase  29.68 
 
 		 841 aa  223  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00459182  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2121  AMP-dependent synthetase and ligase  31.09 
 
 		 868 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2512  AMP-dependent synthetase and ligase  31.8 
 
 		 460 aa  222  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.280527  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1889  AMP-dependent synthetase and ligase  30.15 
 
 		 860 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0471823  normal  0.0591915 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2855  AMP-dependent synthetase and ligase  30.94 
 
 		 829 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2199  AMP-dependent synthetase and ligase  35.5 
 
 		 862 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0560008  normal  0.885424 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4142  AMP-dependent synthetase and ligase  35.45 
 
 		 860 aa  210  5e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5341  AMP-dependent synthetase and ligase  31.03 
 
 		 915 aa  204  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0772  AMP-dependent synthetase and ligase  34.71 
 
 		 887 aa  203  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0989084 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  30.07 
 
 		 889 aa  203  6e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.813754 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2621  AMP-dependent synthetase and ligase  33.43 
 
 		 453 aa  194  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3111  AMP-dependent synthetase and ligase  28.06 
 
 		 418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0188419 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1742  AMP-dependent synthetase and ligase  30.06 
 
 		 497 aa  147  6e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2958  AMP-dependent synthetase and ligase  27.38 
 
 		 523 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2785  AMP-dependent synthetase and ligase  26.79 
 
 		 534 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634484  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2866  AMP-dependent synthetase and ligase  26.79 
 
 		 523 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3179  AMP-dependent synthetase and ligase  24.95 
 
 		 520 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1082  AMP-dependent synthetase and ligase  28.37 
 
 		 526 aa  126  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  30.8 
 
 		 520 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  28.29 
 
 		 490 aa  124  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  29.62 
 
 		 517 aa  124  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1249  AMP-dependent synthetase and ligase  26.22 
 
 		 530 aa  123  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0267  long-chain fatty-acid-CoA ligase  27.81 
 
 		 492 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.250834 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6138  AMP-dependent synthetase and ligase  27.73 
 
 		 524 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623044  normal  0.113053 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7423  AMP-dependent synthetase and ligase  28.31 
 
 		 524 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5320  AMP-dependent synthetase and ligase  28.22 
 
 		 521 aa  114  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6505  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  27.78 
 
 		 527 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679628 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5649  AMP-dependent synthetase and ligase  27.78 
 
 		 531 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0472962  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6014  AMP-dependent synthetase and ligase  27.78 
 
 		 531 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.010036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1956  AMP-dependent synthetase and ligase  25.34 
 
 		 538 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.536259  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2202  AMP-dependent synthetase and ligase  25.81 
 
 		 525 aa  108  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0699  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 545 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  27.65 
 
 		 505 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531462  normal  0.0257473 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2670  AMP-dependent synthetase and ligase  27.71 
 
 		 531 aa  103  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4336  AMP-dependent synthetase and ligase  27.43 
 
 		 515 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0623029  hitchhiker  0.00463044 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2020  AMP-dependent synthetase and ligase  28.97 
 
 		 523 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.256098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7014  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  24.8 
 
 		 529 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188129 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1292  AMP-dependent synthetase and ligase  27.17 
 
 		 523 aa  101  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1564  AMP-dependent synthetase and ligase  25.41 
 
 		 529 aa  100  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  26.88 
 
 		 499 aa  100  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0541  AMP-binding domain-containing protein  26.05 
 
 		 522 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0707  AMP-binding domain-containing protein  24.94 
 
 		 522 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160608  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0523  AMP-binding domain-containing protein  25.52 
 
 		 522 aa  100  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  24.35 
 
 		 529 aa  99.8  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.32 
 
 		 510 aa  99  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4273  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  24.19 
 
 		 536 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000408842 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.31 
 
 		 510 aa  99.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2529  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  25.95 
 
 		 532 aa  99.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0437982 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3426  AMP-dependent synthetase and ligase  27.51 
 
 		 505 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.872115 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.82 
 
 		 510 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.77 
 
 		 510 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.3 
 
 		 510 aa  99  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3648  AMP-dependent synthetase and ligase  25.9 
 
 		 519 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.77 
 
 		 510 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.77 
 
 		 510 aa  98.2  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.77 
 
 		 510 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3735  AMP-dependent synthetase and ligase  27.51 
 
 		 505 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.77 
 
 		 510 aa  98.2  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  27.14 
 
 		 505 aa  97.1  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2230  coenzyme A synthetase-like protein  25.58 
 
 		 535 aa  96.3  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  31.08 
 
 		 496 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.36 
 
 		 510 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27 
 
 		 510 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  27.65 
 
 		 553 aa  95.1  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0111  AMP-dependent synthetase and ligase  25 
 
 		 526 aa  95.5  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.471366  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0145  AMP-dependent synthetase and ligase  25.58 
 
 		 812 aa  95.1  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00701888  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4848  AMP-dependent synthetase and ligase  24.23 
 
 		 498 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2026  AMP-binding domain-containing protein  25.85 
 
 		 535 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1574  AMP-binding domain-containing protein  25.85 
 
 		 535 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.575944  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0616  AMP-binding domain-containing protein  25.85 
 
 		 608 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117672  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2338  AMP-dependent synthetase and ligase  24.37 
 
 		 509 aa  95.1  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2124  AMP-binding domain-containing protein  25.85 
 
 		 535 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0705  AMP-binding domain-containing protein  25.85 
 
 		 535 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0125  AMP-dependent synthetase and ligase  25.07 
 
 		 533 aa  94.7  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0928  AMP-dependent synthetase and ligase  27.35 
 
 		 537 aa  94.4  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.176435 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  25.84 
 
 		 512 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3158  AMP-binding domain-containing protein  24.68 
 
 		 522 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0128  AMP-binding domain-containing protein  24.68 
 
 		 522 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4029  AMP-dependent synthetase and ligase  24.6 
 
 		 509 aa  94  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302171  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2888  AMP-binding domain-containing protein  24.68 
 
 		 522 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1460  AMP-binding domain-containing protein  24.68 
 
 		 522 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2819  acyl-CoA synthetase  26.42 
 
 		 529 aa  94  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.427573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2211  AMP-binding domain-containing protein  26.14 
 
 		 691 aa  93.6  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  25.42 
 
 		 662 aa  93.6  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3804  AMP-dependent synthetase and ligase  24.04 
 
 		 529 aa  93.6  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  30.25 
 
 		 496 aa  93.2  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  30.25 
 
 		 496 aa  93.2  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  30.25 
 
 		 496 aa  93.2  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2048  AMP-dependent synthetase and ligase  24.15 
 
 		 516 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  24.93 
 
 		 515 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  23.6 
 
 		 513 aa  92.4  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  26.65 
 
 		 554 aa  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  28.25 
 
 		 495 aa  92.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.47 
 
 		 514 aa  91.7  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>