More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2855 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5341  AMP-dependent synthetase and ligase  50.06 
 
 
915 aa  687    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1959  AMP-dependent synthetase and ligase  65.34 
 
 
830 aa  1021    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4142  AMP-dependent synthetase and ligase  66.16 
 
 
860 aa  968    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  50.12 
 
 
889 aa  687    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.813754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2855  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
829 aa  1649    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1979  AMP-dependent synthetase and ligase  65.7 
 
 
830 aa  1025    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.10033  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1889  AMP-dependent synthetase and ligase  53.02 
 
 
860 aa  729    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0471823  normal  0.0591915 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2121  AMP-dependent synthetase and ligase  48.57 
 
 
868 aa  688    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5747  AMP-dependent synthetase and ligase  89.99 
 
 
831 aa  1475    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2025  AMP-dependent synthetase and ligase  65.7 
 
 
830 aa  1025    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2199  AMP-dependent synthetase and ligase  65.52 
 
 
862 aa  935    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0560008  normal  0.885424 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2019  AMP-dependent synthetase and ligase  46.28 
 
 
841 aa  592  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00459182  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0772  AMP-dependent synthetase and ligase  35.81 
 
 
887 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0989084 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2621  AMP-dependent synthetase and ligase  41.31 
 
 
453 aa  310  9e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2512  AMP-dependent synthetase and ligase  41.19 
 
 
460 aa  292  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.280527  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2843  AMP-dependent synthetase and ligase  43.66 
 
 
459 aa  252  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0145799  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3177  AMP-dependent synthetase and ligase  30.63 
 
 
471 aa  220  7e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.733678  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2785  AMP-dependent synthetase and ligase  43.23 
 
 
534 aa  187  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634484  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  33.62 
 
 
490 aa  185  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2866  AMP-dependent synthetase and ligase  41.96 
 
 
523 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2958  AMP-dependent synthetase and ligase  42.07 
 
 
523 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1742  AMP-dependent synthetase and ligase  32.94 
 
 
497 aa  175  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441923  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3111  AMP-dependent synthetase and ligase  37.63 
 
 
418 aa  172  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0188419 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1249  AMP-dependent synthetase and ligase  40.21 
 
 
530 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  31.9 
 
 
517 aa  161  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3314  amino acid adenylation domain-containing protein  28.15 
 
 
923 aa  157  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105674  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3152  amino acid adenylation domain-containing protein  27.59 
 
 
923 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.595865 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3179  AMP-dependent synthetase and ligase  37.73 
 
 
520 aa  151  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1082  AMP-dependent synthetase and ligase  37.82 
 
 
526 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0267  long-chain fatty-acid-CoA ligase  29.17 
 
 
492 aa  148  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.250834 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2563  antibiotic biosynthesis protein, putative  27.35 
 
 
923 aa  146  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136066  normal  0.595112 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5320  AMP-dependent synthetase and ligase  35.26 
 
 
521 aa  146  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2882  AMP-dependent synthetase and ligase  33.08 
 
 
514 aa  144  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0125  AMP-dependent synthetase and ligase  31.67 
 
 
533 aa  140  7e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2020  AMP-dependent synthetase and ligase  34.6 
 
 
523 aa  139  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.256098 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4336  AMP-dependent synthetase and ligase  36.96 
 
 
515 aa  139  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0623029  hitchhiker  0.00463044 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1956  AMP-dependent synthetase and ligase  32.01 
 
 
538 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.536259  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  34.29 
 
 
520 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  34.88 
 
 
505 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531462  normal  0.0257473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3426  AMP-dependent synthetase and ligase  34.13 
 
 
505 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.872115 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1930  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 
510 aa  130  8.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.426512  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  34.42 
 
 
522 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1564  AMP-dependent synthetase and ligase  30.81 
 
 
529 aa  127  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0111  AMP-dependent synthetase and ligase  34.86 
 
 
526 aa  127  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.471366  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  35.47 
 
 
529 aa  126  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4273  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  32.8 
 
 
536 aa  126  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000408842 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3648  AMP-dependent synthetase and ligase  34.77 
 
 
519 aa  125  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3735  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
505 aa  125  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0096  AMP-dependent synthetase and ligase  34.86 
 
 
527 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7014  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  32.63 
 
 
529 aa  123  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188129 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2529  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  34.01 
 
 
532 aa  122  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0437982 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0699  AMP-dependent synthetase and ligase  32.88 
 
 
545 aa  121  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1574  AMP-binding domain-containing protein  32.84 
 
 
535 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.575944  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2026  AMP-binding domain-containing protein  32.84 
 
 
535 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0705  AMP-binding domain-containing protein  32.84 
 
 
535 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2124  AMP-binding domain-containing protein  32.84 
 
 
535 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1393  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  35.15 
 
 
530 aa  120  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0696312  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1292  AMP-dependent synthetase and ligase  29.84 
 
 
523 aa  120  9e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0616  AMP-binding domain-containing protein  32.84 
 
 
608 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117672  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0137  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  33.24 
 
 
539 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2670  AMP-dependent synthetase and ligase  32.35 
 
 
531 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2211  AMP-binding domain-containing protein  34.34 
 
 
691 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4029  AMP-dependent synthetase and ligase  38.91 
 
 
509 aa  117  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302171  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  31.3 
 
 
553 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0750  bifunctional acyl-[acyl carrier protein] synthetase/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  32.31 
 
 
732 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.06 
 
 
514 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3804  AMP-dependent synthetase and ligase  34.74 
 
 
529 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3463  bifunctional acyl-[acyl carrier protein] synthetase/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  30.93 
 
 
723 aa  110  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.586165  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0490  AMP-dependent synthetase and ligase  32.73 
 
 
512 aa  110  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2380  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 
742 aa  109  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2338  AMP-dependent synthetase and ligase  34.81 
 
 
509 aa  108  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.62 
 
 
512 aa  108  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3277  bifunctional acyl-[acyl carrier protein] synthetase/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  29.3 
 
 
719 aa  107  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.53 
 
 
510 aa  107  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0912  AMP-binding protein  34.27 
 
 
570 aa  107  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0119  AMP-binding domain-containing protein  34.27 
 
 
521 aa  107  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0370  AMP-binding domain-containing protein  34.27 
 
 
521 aa  107  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0916  AMP-binding protein  34.27 
 
 
521 aa  107  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0991636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2505  AMP-binding domain-containing protein  34.27 
 
 
521 aa  107  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0670  AMP-binding domain-containing protein  34.27 
 
 
521 aa  107  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3617  bifunctional acyl-[acyl carrier protein] synthetase/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  30.45 
 
 
725 aa  106  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0422  putative AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
538 aa  106  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.838411  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1068  AMP-binding domain-containing protein  34.27 
 
 
731 aa  104  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3733  amino acid adenylation domain protein  31.76 
 
 
11233 aa  104  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1427  AMP-dependent synthetase and ligase  29.43 
 
 
556 aa  104  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00356403  decreased coverage  0.0000000268145 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3884  AMP-dependent synthetase and ligase  31.09 
 
 
497 aa  104  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.445629  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2984  bifunctional acyl-[acyl carrier protein] synthetase/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  28.65 
 
 
719 aa  104  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272141  normal  0.0211518 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3026  bifunctional acyl-[acyl carrier protein] synthetase/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  28.65 
 
 
719 aa  104  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266373  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02684  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  28.65 
 
 
719 aa  104  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.379527  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0854  AMP-dependent synthetase and ligase  28.65 
 
 
719 aa  104  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2983  bifunctional acyl-[acyl carrier protein] synthetase/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  28.65 
 
 
719 aa  104  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0560212  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3156  bifunctional acyl-[acyl carrier protein] synthetase/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  28.65 
 
 
719 aa  104  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.344135  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02645  hypothetical protein  28.65 
 
 
719 aa  104  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.337206  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  27.06 
 
 
4968 aa  104  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0879  bifunctional acyl-[acyl carrier protein] synthetase/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  28.65 
 
 
719 aa  104  8e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.513346  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4103  bifunctional acyl-[acyl carrier protein] synthetase/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  28.65 
 
 
719 aa  104  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.022489  hitchhiker  0.000184604 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.28 
 
 
510 aa  103  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.7 
 
 
510 aa  103  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3223  bifunctional acyl-[acyl carrier protein] synthetase/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  28.77 
 
 
719 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229398 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.7 
 
 
510 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>