243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2695 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0424  type I restriction enzyme, R subunit  39.15 
 
 		 1102 aa  666    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1014  type I restriction-modification system restriction subunit  42.96 
 
 		 965 aa  714    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0265  type III restriction protein res subunit  41.73 
 
 		 1010 aa  720    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.268157  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2685  DEAD/DEAH box helicase  62.62 
 
 		 1009 aa  1331    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0278  hypothetical protein  42.96 
 
 		 989 aa  752    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2689  hypothetical protein  38.15 
 
 		 1063 aa  655    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11077  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1553  protein of unknown function DUF450  40.85 
 
 		 985 aa  687    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0749  type III restriction protein res subunit  40.28 
 
 		 992 aa  674    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0598  type I site-specific restriction-modification system, R subunit  40.47 
 
 		 1052 aa  719    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1065  DEAD/DEAH box helicase-like  38.31 
 
 		 1039 aa  651    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00124695  normal  0.0212089 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22820  type I restriction enzyme R protein  40.27 
 
 		 1006 aa  726    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.324704 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3992  type III restriction protein res subunit  43.91 
 
 		 984 aa  783    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.208178 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0639  type III restriction enzyme, res subunit  41.89 
 
 		 1009 aa  714    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28859  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2607  hypothetical protein  52.07 
 
 		 1022 aa  1007    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2695  hypothetical protein  100 
 
 		 1008 aa  2083    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.285383  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1789  type III restriction enzyme, res subunit  52.5 
 
 		 1029 aa  1041    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2605  type III restriction enzyme, res subunit  38.13 
 
 		 1087 aa  666    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0189627  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0797  protein of unknown function DUF450  48.61 
 
 		 1000 aa  932    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00985204 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0230  hypothetical protein  39.27 
 
 		 1060 aa  681    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0415  hypothetical protein  39.41 
 
 		 1069 aa  676    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.484825  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4250  protein of unknown function DUF450  47.06 
 
 		 1027 aa  924    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0485  hypothetical protein  40 
 
 		 1039 aa  676    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.646894  decreased coverage  0.000377567 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3355  hypothetical protein  61.86 
 
 		 1007 aa  1301    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4924  hypothetical protein  42.43 
 
 		 1035 aa  766    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1482  hypothetical protein  38.34 
 
 		 1081 aa  644    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3444  type III restriction protein res subunit  42.77 
 
 		 1012 aa  756    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0780  type I site-specific deoxyribonuclease chain R  40.47 
 
 		 971 aa  645    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0180253  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1151  hypothetical protein  38.53 
 
 		 1059 aa  687    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.255903  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1325  type III restriction enzyme, res subunit  37.63 
 
 		 1112 aa  685    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0077  type I restriction-modification system subunit R  39.63 
 
 		 1067 aa  700    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0958  protein of unknown function DUF450  38.47 
 
 		 1067 aa  634  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19090  helicase, type I site-specific restriction-modification system restriction subunit  36.72 
 
 		 1004 aa  627  1e-178  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.210967 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0194  hypothetical protein  37.43 
 
 		 1041 aa  622  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.394359 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1497  protein of unknown function DUF450  36.61 
 
 		 1051 aa  612  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0324371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13690  helicase, type I site-specific restriction-modification system restriction subunit  36.83 
 
 		 1073 aa  608  9.999999999999999e-173  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.161894 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1859  DEAD/DEAH box helicase-like  38.09 
 
 		 997 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.397249  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1218  hypothetical protein  37.46 
 
 		 990 aa  605  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4471  hypothetical protein  38.5 
 
 		 991 aa  601  1e-170  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.756132  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2221  type III restriction enzyme, res subunit  41.21 
 
 		 905 aa  599  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432598  normal  0.944916 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1859  hypothetical protein  37.73 
 
 		 1033 aa  597  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4762  type I restriction-modification system endonuclease  37.62 
 
 		 1078 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2197  protein of unknown function DUF450  36.46 
 
 		 999 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0659  protein of unknown function DUF450  36.9 
 
 		 969 aa  572  1.0000000000000001e-162  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0274  type I restriction-modification system, R subunit, putative  35.7 
 
 		 1002 aa  569  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.273589  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2267  type I restriction-modification system endonuclease  35.56 
 
 		 1023 aa  566  1e-160  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1787  type III restriction enzyme, res subunit  36.89 
 
 		 1011 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.990163  normal  0.226288 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2175  hypothetical protein  35.41 
 
 		 1031 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0843  hypothetical protein  36.39 
 
 		 983 aa  561  1e-158  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.10122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2870  DEAD/DEAH box helicase-like  39.78 
 
 		 1085 aa  556  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.737132  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4456  type III restriction protein res subunit  39.37 
 
 		 1079 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003238  type I restriction-modification system restriction subunit R  35 
 
 		 1023 aa  542  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1363  putative type I restriction enzyme HsdR  35.19 
 
 		 1022 aa  546  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3575  protein of unknown function DUF450  40.65 
 
 		 976 aa  531  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6264  type III restriction protein res subunit  36.21 
 
 		 1016 aa  525  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.724284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2936  restriction enzyme type I helicase subunit; type I restriction enzyme HsdR  34.44 
 
 		 1034 aa  496  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1515  protein of unknown function DUF450  33.77 
 
 		 1142 aa  478  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.695629 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0160  type I site-specific restriction-modification system, R subunit (helicase)  27.46 
 
 		 1035 aa  395  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0504  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.78 
 
 		 1067 aa  137  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1944  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  27.37 
 
 		 1034 aa  132  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31477 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0040  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.02 
 
 		 1032 aa  132  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0011  type I site-specific deoxyribonuclease  26.96 
 
 		 1061 aa  131  8.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.386666 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2912  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  27.86 
 
 		 1045 aa  129  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0017  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.83 
 
 		 1032 aa  128  6e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.13213  hitchhiker  0.00259353 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0222  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  28.1 
 
 		 1028 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4244  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.16 
 
 		 1084 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104553 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2781  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.56 
 
 		 1042 aa  127  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.759966 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1534  type I restriction-modification enzyme, R subunit  26.23 
 
 		 1031 aa  126  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0146067  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1642  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  26.7 
 
 		 1003 aa  125  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0948  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  24.84 
 
 		 1030 aa  124  6e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000221808  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1863  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  27.31 
 
 		 855 aa  124  7e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0289  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.72 
 
 		 1044 aa  122  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1213  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.96 
 
 		 1074 aa  122  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0288  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  26.24 
 
 		 1003 aa  122  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4782  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  27.55 
 
 		 1029 aa  120  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0986  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  27.33 
 
 		 1040 aa  119  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0985  type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  25.19 
 
 		 1023 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.271239  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0616  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.15 
 
 		 1024 aa  119  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.945786  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2793  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.15 
 
 		 1012 aa  119  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.81193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1854  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.6 
 
 		 1026 aa  119  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3142  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.76 
 
 		 1053 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.311039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3755  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.59 
 
 		 1029 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0174443  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1089  type I restriction-modification enzyme, R subunit, putative  26.74 
 
 		 1040 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3142  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  26.88 
 
 		 1042 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.175068  normal  0.39911 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0608  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.04 
 
 		 1006 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0380  type I restriction-modification system, R subunit  25.46 
 
 		 1033 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1070  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.82 
 
 		 1067 aa  114  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.558069  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4470  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25 
 
 		 1084 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.566129  normal  0.610404 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0037  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.18 
 
 		 1022 aa  113  2.0000000000000002e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.18362  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2596  type I restriction-modification system, R subunit  25.96 
 
 		 1059 aa  113  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4822  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.22 
 
 		 1020 aa  113  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.5346  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2450  type I site-specific deoxyribonuclease HsdR family  26.65 
 
 		 1042 aa  113  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2251  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.83 
 
 		 1044 aa  112  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3172  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  23.91 
 
 		 995 aa  111  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000000957293 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3150  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25 
 
 		 1000 aa  111  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0842  type I restriction-modification enzyme, R subunit  25.12 
 
 		 967 aa  110  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.156677  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0790  type I restriction-modification enzyme, R subunit  25.12 
 
 		 967 aa  110  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.225053  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1124  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  24.2 
 
 		 1084 aa  109  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3131  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.17 
 
 		 1060 aa  110  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.789076  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3549  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  27.05 
 
 		 1092 aa  109  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.254191 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2911  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.89 
 
 		 1079 aa  108  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>