41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1688 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1688  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 
167 aa  335  9.999999999999999e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04305  putative outer membrane protein  45.83 
 
 
169 aa  149  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1359  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  39.05 
 
 
169 aa  121  5e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1054  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  35.93 
 
 
169 aa  105  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14055  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0988  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  37.5 
 
 
186 aa  97.8  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4390  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.66 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000436364  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0193  cationic outer membrane protein OmpH  32.39 
 
 
163 aa  77.4  0.00000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.757024 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4436  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.95 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.581191 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3414  ompH family outer membrane protein  28.26 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.556312  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05165  hypothetical protein  26.63 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3415  ompH family outer membrane protein  29.01 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3263  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.21 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08486  cationic outer membrane protein OmpH  27.71 
 
 
177 aa  64.3  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.1 
 
 
187 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0312  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.18 
 
 
185 aa  57  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.955196  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26 
 
 
211 aa  54.3  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00195183  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1957  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.48 
 
 
187 aa  53.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.396318  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0987  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.71 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.38 
 
 
184 aa  51.6  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.12 
 
 
171 aa  51.6  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1053  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.25 
 
 
178 aa  51.2  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.093719  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4435  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 
190 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0410  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.28 
 
 
182 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547835  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3413  ompH family outer membrane protein  24.52 
 
 
206 aa  48.5  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0979  outer membrane protein  34.04 
 
 
194 aa  48.5  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.536897  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0192  cationic outer membrane protein OmpH  23.57 
 
 
174 aa  48.1  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1958  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.94 
 
 
177 aa  48.1  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.78 
 
 
175 aa  47.4  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3467  hypothetical protein  24.81 
 
 
213 aa  47.4  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.16 
 
 
171 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.65 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1445  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.31 
 
 
172 aa  45.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0414  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.61 
 
 
196 aa  45.1  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0783  hypothetical protein  21.6 
 
 
213 aa  43.9  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0199  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.73 
 
 
170 aa  42.4  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.48 
 
 
173 aa  42.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.33 
 
 
172 aa  42  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3973  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.76 
 
 
206 aa  41.6  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.297953 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.57 
 
 
165 aa  41.2  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000628638  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  19.31 
 
 
166 aa  41.2  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3781  periplasmic chaperone  25.81 
 
 
176 aa  40.8  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038296  hitchhiker  0.00155188 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>