53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1400 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4429  hypothetical protein  78.09 
 
 
707 aa  1160    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.857441  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1209  hypothetical protein  58.77 
 
 
726 aa  857    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1394  hypothetical protein  54.56 
 
 
700 aa  804    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.872498  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1400  hypothetical protein  100 
 
 
704 aa  1463    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0928  hypothetical protein  68.3 
 
 
728 aa  1036    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.453447  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0626  alpha-glucosidase  66.53 
 
 
727 aa  1001    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5767  putative alpha-glucosidase  67.99 
 
 
711 aa  1013    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0058  Glycoside hydrolase 97  51.42 
 
 
693 aa  747    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.52966 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0367  putative alpha-glucosidase  41.62 
 
 
677 aa  559  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51780  alpha-glucosidase  41.3 
 
 
673 aa  528  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.816262  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4326  hypothetical protein  40.71 
 
 
672 aa  520  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23190  alpha-glucosidase  40.06 
 
 
701 aa  521  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243429  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1108  alpha-glucosidase  39.63 
 
 
676 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0590  alpha-glucosidase  39.46 
 
 
684 aa  489  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.225417  normal  0.0221919 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1019  alpha-glucosidase  39.02 
 
 
683 aa  487  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0185  alpha-glucosidase  38.71 
 
 
680 aa  484  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2740  alpha-glucosidase  37.27 
 
 
703 aa  479  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1892  alpha-glucosidase  37.62 
 
 
682 aa  477  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1876  alpha-glucosidase  37.13 
 
 
707 aa  478  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.507439 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1777  alpha-glucosidase  38.34 
 
 
697 aa  479  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1931  alpha-glucosidase  36.89 
 
 
703 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2102  alpha-glucosidase  36.89 
 
 
703 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.869354  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1876  alpha-glucosidase  36.89 
 
 
703 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2002  alpha-glucosidase  38.16 
 
 
727 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2329  alpha-glucosidase  36.5 
 
 
710 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2445  alpha-glucosidase  36.5 
 
 
710 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.607095  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2017  alpha-glucosidase  36.36 
 
 
702 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.248833  hitchhiker  0.00490164 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2329  alpha-glucosidase  36.5 
 
 
710 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20719  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2450  alpha-glucosidase  37.01 
 
 
699 aa  456  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0777  hypothetical protein  37.6 
 
 
606 aa  439  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  32.45 
 
 
1255 aa  317  4e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3217  alpha-glucosidase, putative  28.81 
 
 
682 aa  256  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751285  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0169  putative alpha-glucosidase  26.98 
 
 
656 aa  224  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1628  putative alpha-glucosidase  28.16 
 
 
678 aa  224  6e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0539219  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1312  putative alpha-glucosidase  26.2 
 
 
655 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2298  putative alpha-glucosidase  27.25 
 
 
647 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5410  alpha-glucosidase, putative  27.34 
 
 
648 aa  213  7.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0179561  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4959  hypothetical protein  27.08 
 
 
659 aa  213  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5726  Glycoside hydrolase 97  25.8 
 
 
656 aa  209  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.035847 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2360  putative alpha-glucosidase  26.47 
 
 
679 aa  196  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103256  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3805  hypothetical protein  25.87 
 
 
615 aa  184  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0476  alpha-glucosidase, putative, adg97A  26.03 
 
 
643 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2499  putative alpha-glucosidase  24.46 
 
 
674 aa  167  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0790  alpha-glucosidase  25.79 
 
 
661 aa  164  7e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0155602  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2708  hypothetical protein  24.4 
 
 
629 aa  156  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0314889  normal  0.739389 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3590  hypothetical protein  24.55 
 
 
630 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116623  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3876  Glycoside hydrolase 97  23.36 
 
 
571 aa  147  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0907495  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1153  putative alpha-glucosidase  24.22 
 
 
574 aa  143  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2469  Glycoside hydrolase 97  24.72 
 
 
641 aa  133  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3873  hypothetical protein  23.72 
 
 
647 aa  125  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2159  alpha-glucosidase, putative, adg97A  24.25 
 
 
658 aa  124  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1419  Glycoside hydrolase 97  24.68 
 
 
648 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.067122  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1420  hypothetical protein  23.02 
 
 
649 aa  121  3.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.828826  normal  0.205294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>