More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1536 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1536  thimet oligopeptidase  100 
 
 
676 aa  1390    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.100985  unclonable  4.6585e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1268  thimet oligopeptidase  47.28 
 
 
681 aa  617  1e-175  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000110784  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2053  thimet oligopeptidase  37.62 
 
 
660 aa  427  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499816  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0768  Thimet oligopeptidase  35.9 
 
 
701 aa  424  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.484964  normal  0.0509225 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3911  oligopeptidase A  35.72 
 
 
680 aa  359  9.999999999999999e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2211  Oligopeptidase A  34.46 
 
 
675 aa  358  1.9999999999999998e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0217  Oligopeptidase A  35.9 
 
 
680 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3698  oligopeptidase A  35.9 
 
 
680 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3787  oligopeptidase A  35.9 
 
 
680 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.894892 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0218  oligopeptidase A  35.9 
 
 
680 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3980  oligopeptidase A  35.9 
 
 
680 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03347  oligopeptidase A  35.9 
 
 
680 aa  356  5.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.642114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03300  hypothetical protein  35.9 
 
 
680 aa  356  5.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.762273  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4845  oligopeptidase A  35.9 
 
 
680 aa  356  7.999999999999999e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.88545 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3797  oligopeptidase A  34.83 
 
 
680 aa  356  8.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3824  oligopeptidase A  35.75 
 
 
680 aa  356  8.999999999999999e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3787  oligopeptidase A  34.68 
 
 
680 aa  353  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3907  oligopeptidase A  34.68 
 
 
680 aa  353  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3968  oligopeptidase A  34.68 
 
 
680 aa  353  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3864  oligopeptidase A  34.68 
 
 
680 aa  353  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28404  saccharolysin (oligopeptidase)  36.6 
 
 
687 aa  352  1e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0460468 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0045  oligopeptidase A  34.37 
 
 
683 aa  351  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0090  oligopeptidase A  32.82 
 
 
692 aa  345  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0144  oligopeptidase A  33.9 
 
 
683 aa  345  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0007  oligopeptidase A  34.13 
 
 
680 aa  345  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73797  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51091  saccharolysin (oligopeptidase)  33.77 
 
 
658 aa  344  4e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0096  oligopeptidase A  33.64 
 
 
683 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  hitchhiker  0.00599775 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0111  oligopeptidase A  33.64 
 
 
695 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000602107 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0010  oligopeptidase A  33.73 
 
 
680 aa  341  2e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0111  oligopeptidase A  33.49 
 
 
695 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3546  oligopeptidase A  33.33 
 
 
678 aa  340  5e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0114  oligopeptidase A  33.49 
 
 
695 aa  339  8e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.357976  normal  0.13234 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0791  oligopeptidase A  34.06 
 
 
679 aa  337  5e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01090  oligopeptidase A  33.13 
 
 
681 aa  337  5e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3492  oligopeptidase A  30.39 
 
 
692 aa  333  5e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865718  normal  0.378526 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4701  oligopeptidase A  32.88 
 
 
680 aa  333  5e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0054  oligopeptidase A  33.87 
 
 
681 aa  333  6e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0345207  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2570  oligopeptidase A  33.18 
 
 
680 aa  330  6e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5061  Thimet oligopeptidase  32.45 
 
 
655 aa  329  8e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4217  Oligopeptidase A  32.88 
 
 
679 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00790  oligopeptidase A  32.25 
 
 
681 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.983257  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4461  oligopeptidase A  32.4 
 
 
682 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0156  oligopeptidase A  33.5 
 
 
683 aa  327  5e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4392  oligopeptidase A  33.7 
 
 
679 aa  327  6e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001952  oligopeptidase A  32.18 
 
 
680 aa  327  6e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4196  oligopeptidase A  32.73 
 
 
680 aa  326  7e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4256  oligopeptidase A  33.39 
 
 
679 aa  326  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4699  oligopeptidase A  32.74 
 
 
679 aa  325  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0141  oligopeptidase A  33.5 
 
 
685 aa  325  2e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0067  oligopeptidase A  32.09 
 
 
681 aa  324  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0116  oligopeptidase A  33.03 
 
 
680 aa  323  5e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4086  oligopeptidase A  32.73 
 
 
680 aa  323  6e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.902618 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0124  oligopeptidase A  33.23 
 
 
679 aa  323  6e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4065  oligopeptidase A  33.07 
 
 
679 aa  323  7e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4479  oligopeptidase A  32.58 
 
 
680 aa  323  8e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1595  oligopeptidase A  31.64 
 
 
706 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4047  oligopeptidase A  33.38 
 
 
682 aa  322  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.980043  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0087  oligopeptidase A  33.23 
 
 
679 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1253  oligopeptidase A  32.55 
 
 
682 aa  321  3e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0320  oligopeptidase A  32.33 
 
 
676 aa  321  3e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0399  oligopeptidase A  32.37 
 
 
694 aa  321  3e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00526  Zn-dependent oligopeptidase  32.29 
 
 
695 aa  321  3e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4986  oligopeptidase A  32.86 
 
 
683 aa  320  5e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3874  oligopeptidase A  33.19 
 
 
679 aa  320  5e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2026  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  34.7 
 
 
697 aa  320  6e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0253758  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0859  Oligopeptidase A  30.19 
 
 
694 aa  319  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1858  Oligopeptidase A  33.44 
 
 
709 aa  319  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375638  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0885  Oligopeptidase A  30.19 
 
 
694 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4051  oligopeptidase A  32.39 
 
 
679 aa  318  3e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0948  oligopeptidase A  34.07 
 
 
690 aa  315  9.999999999999999e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.613607  normal  0.240038 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4207  oligopeptidase A  31.54 
 
 
680 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0426  Thimet oligopeptidase  34.15 
 
 
648 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06491  M3 family peptidase  30.48 
 
 
703 aa  315  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.172258  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3842  oligopeptidase A  31.73 
 
 
679 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0425  Thimet oligopeptidase  33.45 
 
 
648 aa  313  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0397  thimet oligopeptidase  33.97 
 
 
648 aa  313  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2626  Oligopeptidase A  30.23 
 
 
700 aa  313  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.762505  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3935  oligopeptidase A  31.73 
 
 
679 aa  312  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2167  Oligopeptidase A  31.42 
 
 
700 aa  311  2e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.803751  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1534  oligopeptidase A  32.11 
 
 
716 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2240  oligopeptidase A  33.18 
 
 
712 aa  311  4e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1860  oligopeptidase A  30.77 
 
 
700 aa  310  8e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.709239  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1951  Oligopeptidase A  30.99 
 
 
704 aa  310  8e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844627  normal  0.0899993 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0029  peptidase family M3  29.88 
 
 
703 aa  309  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1623  Oligopeptidase A  30.99 
 
 
704 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.932062 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3595  oligopeptidase A  31.57 
 
 
679 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0212  oligopeptidase A  32.28 
 
 
683 aa  308  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2597  Oligopeptidase A  31.6 
 
 
702 aa  307  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.219931  normal  0.0217228 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4180  thimet oligopeptidase  33.1 
 
 
644 aa  307  3e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1476  oligopeptidase A  30.95 
 
 
704 aa  308  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0816638  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0124  oligopeptidase A  31.7 
 
 
679 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4484  oligopeptidase A  29.91 
 
 
702 aa  306  8.000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2618  oligopeptidase A  30.95 
 
 
699 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0145  oligopeptidase A  32.08 
 
 
679 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.491748  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1298  oligopeptidase A  31.54 
 
 
692 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.757231  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3084  oligopeptidase A  30.95 
 
 
699 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1726  oligopeptidase A  30.95 
 
 
699 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.328644  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2750  oligopeptidase A  30.84 
 
 
699 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2235  oligopeptidase A  30.95 
 
 
699 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1507  oligopeptidase A  30.95 
 
 
699 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>