More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1258 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1258  methyltransferase GidB  100 
 
 
202 aa  416  9.999999999999999e-116  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  31.16 
 
 
242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  32.52 
 
 
241 aa  107  9.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  29.38 
 
 
242 aa  107  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  29.13 
 
 
239 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  29.13 
 
 
239 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  29.13 
 
 
239 aa  95.5  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  29.13 
 
 
239 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  29.13 
 
 
239 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  29.13 
 
 
239 aa  95.1  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  29.13 
 
 
239 aa  95.1  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  29.13 
 
 
239 aa  95.1  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  29.13 
 
 
239 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  28.91 
 
 
231 aa  94.4  9e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  27.36 
 
 
239 aa  93.6  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  28.57 
 
 
239 aa  93.6  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  28.64 
 
 
239 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  27.36 
 
 
239 aa  93.6  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  32.92 
 
 
231 aa  92  5e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1851  methyltransferase GidB  30.99 
 
 
251 aa  90.5  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  34.34 
 
 
239 aa  89  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2847  methyltransferase GidB  32.68 
 
 
217 aa  88.6  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4100  16S rRNA methyltransferase GidB  30 
 
 
207 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205274  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  30 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  30 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4085  16S rRNA methyltransferase GidB  30 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0040729  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  30 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  29.89 
 
 
239 aa  87.8  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  28.5 
 
 
239 aa  86.7  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  29.34 
 
 
236 aa  86.3  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  31.55 
 
 
211 aa  86.3  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  28.16 
 
 
241 aa  86.3  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  32.35 
 
 
234 aa  85.1  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0042  methyltransferase GidB  33.73 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  31.02 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  32.94 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  27.83 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  28.1 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  28.1 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  28.08 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  28.1 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4124  16S rRNA methyltransferase GidB  29.72 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000172745  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  28.1 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3762  16S rRNA methyltransferase GidB  28.92 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.247019  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  28.1 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  28.1 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  28.1 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2756  methyltransferase GidB  33.67 
 
 
238 aa  82.4  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  31.25 
 
 
240 aa  82  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  29.56 
 
 
237 aa  81.6  0.000000000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  27.62 
 
 
207 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4305  methyltransferase GidB  27.94 
 
 
212 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.412707  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  30.58 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4055  16S rRNA methyltransferase GidB  27.32 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4496  16S rRNA methyltransferase GidB  27.67 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.227983  hitchhiker  0.00000107328 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  25.85 
 
 
238 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4539  16S rRNA methyltransferase GidB  29.47 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4249  16S rRNA methyltransferase GidB  29.44 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3740  16S rRNA methyltransferase GidB  32.37 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal  0.158212 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  31.55 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  30.63 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00432  16S rRNA methyltransferase GidB  28.02 
 
 
211 aa  79  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4757  16S rRNA methyltransferase GidB  29.41 
 
 
206 aa  79  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4908  16S rRNA methyltransferase GidB  28.29 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127096  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3069  16S rRNA methyltransferase GidB  28.36 
 
 
209 aa  79  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2126  16S rRNA methyltransferase GidB  29.09 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0197  16S rRNA methyltransferase GidB  29.09 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3935  16S rRNA methyltransferase GidB  29.9 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.387591  hitchhiker  0.000403371 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4027  16S rRNA methyltransferase GidB  29.9 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.537471  normal  0.874868 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  33.78 
 
 
239 aa  78.2  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3966  16S rRNA methyltransferase GidB  29.76 
 
 
206 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.181169  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  29.24 
 
 
238 aa  77.8  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0111  16S rRNA methyltransferase GidB  25.82 
 
 
228 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  33.78 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4185  methyltransferase GidB  28.77 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0282933  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3880  16S rRNA methyltransferase GidB  28.64 
 
 
245 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.480171  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3276  16S rRNA methyltransferase GidB  26.09 
 
 
228 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4376  16S rRNA methyltransferase GidB  29.27 
 
 
206 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000253102  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4517  16S rRNA methyltransferase GidB  29.27 
 
 
206 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289594 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2961  16S rRNA methyltransferase GidB  25.82 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  25.82 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4320  16S rRNA methyltransferase GidB  29.27 
 
 
206 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000104223 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4375  16S rRNA methyltransferase GidB  29.27 
 
 
206 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2518  16S rRNA methyltransferase GidB  29.11 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015126  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2517  methyltransferase GidB  28.9 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00460923  hitchhiker  0.00173513 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2336  methyltransferase GidB  29.26 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000208151  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0001  16S rRNA methyltransferase GidB  30.24 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.895325  hitchhiker  0.000116578 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0064  16S rRNA methyltransferase GidB  31.29 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.75809 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  28 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3985  methyltransferase GidB  29.53 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3654  16S rRNA methyltransferase GidB  30.34 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.611058  hitchhiker  0.00060095 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0251  methyltransferase GidB  28.1 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4250  16S rRNA methyltransferase GidB  27.18 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  24.12 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002020  ribosomal RNA small subunit methyltransferase G  27.14 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000210084  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1555  methyltransferase GidB  32.75 
 
 
240 aa  75.1  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126282  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0095  16S rRNA methyltransferase GidB  25.76 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  25.63 
 
 
228 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978547  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4011  glucose inhibited division protein B  27.44 
 
 
223 aa  74.7  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.256555 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0085  16S rRNA methyltransferase GidB  25.76 
 
 
228 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>