More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_3031 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0501  molydopterin dinucleotide-binding region  39.17 
 
 
1032 aa  694    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.638156 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3031  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 
1193 aa  2480    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22740  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  38.6 
 
 
1053 aa  688    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.945653 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0497  molydopterin dinucleotide-binding region  60.56 
 
 
1102 aa  1390    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.455569 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0507  molydopterin dinucleotide-binding region  44.06 
 
 
952 aa  427  1e-118  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.485596  normal  0.607063 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0515  molydopterin dinucleotide-binding region  44.4 
 
 
964 aa  394  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.470196 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16890  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  41.85 
 
 
1018 aa  378  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27350  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  41.72 
 
 
1023 aa  371  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0511  molydopterin dinucleotide-binding region  38.9 
 
 
1002 aa  369  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.3924 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0471  molydopterin dinucleotide-binding region  40.31 
 
 
1017 aa  363  9e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06120  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  34.72 
 
 
1003 aa  268  2.9999999999999995e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2768  molydopterin dinucleotide-binding region  33.54 
 
 
898 aa  164  7e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81742  normal  0.229258 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20860  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  34.57 
 
 
942 aa  159  4e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0607  molydopterin dinucleotide-binding region  32.39 
 
 
910 aa  147  8.000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.408169 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1588  molydopterin dinucleotide-binding region  31.03 
 
 
945 aa  147  9e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0385421 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1567  molybdopterin oxidoreductase  24.16 
 
 
803 aa  136  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  33.73 
 
 
729 aa  128  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4198  molybdopterin oxidoreductase  33.6 
 
 
1155 aa  128  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.676689 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1646  molybdopterin oxidoreductase  26.82 
 
 
807 aa  127  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165657  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2375  molybdopterin oxidoreductase  34.09 
 
 
747 aa  127  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0112  molybdopterin oxidoreductase  25.36 
 
 
971 aa  126  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101891  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2304  molybdopterin oxidoreductase  28.03 
 
 
803 aa  126  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6878  molybdopterin oxidoreductase  29.43 
 
 
1148 aa  125  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0354139  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2377  Formate dehydrogenase  25.15 
 
 
791 aa  124  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05600  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  27.79 
 
 
979 aa  119  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.533202  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2511  molybdopterin oxidoreductase  31.73 
 
 
776 aa  119  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2365  molybdopterin oxidoreductase  34.14 
 
 
777 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  29.57 
 
 
745 aa  116  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3287  molybdopterin oxidoreductase  27.75 
 
 
781 aa  115  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239512  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1509  Formate dehydrogenase  29.35 
 
 
732 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  29.55 
 
 
730 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  28.67 
 
 
759 aa  114  9e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  32.24 
 
 
747 aa  114  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1907  molybdopterin oxidoreductase  31.6 
 
 
794 aa  114  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0541  molybdopterin oxidoreductase  24.6 
 
 
755 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1006  molybdopterin oxidoreductase  29.45 
 
 
761 aa  113  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.249803 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  31.16 
 
 
731 aa  113  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1208  molybdopterin oxidoreductase  30.45 
 
 
947 aa  113  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  32.05 
 
 
726 aa  111  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  32.45 
 
 
744 aa  111  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  28.19 
 
 
722 aa  110  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1904  molydopterin dinucleotide-binding region  31.45 
 
 
753 aa  108  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2753  molydopterin dinucleotide-binding region  31.48 
 
 
749 aa  108  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28964  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  28.09 
 
 
734 aa  107  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  30.24 
 
 
1055 aa  107  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0899  Formate dehydrogenase  30.68 
 
 
756 aa  107  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4227  molybdopterin oxidoreductase  29.02 
 
 
817 aa  107  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3094  molybdopterin oxidoreductase  29.43 
 
 
858 aa  105  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.799457  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5761  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:oxidoreductase FAD-binding region  30.47 
 
 
1142 aa  104  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3636  molybdopterin oxidoreductase  25.51 
 
 
765 aa  104  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  25.86 
 
 
739 aa  104  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2453  molybdopterin oxidoreductase  25.45 
 
 
909 aa  100  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154365  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1629  molybdopterin oxidoreductase  27.18 
 
 
789 aa  101  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2315  putative anaerobic dehydrogenase  26.8 
 
 
763 aa  101  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  27.36 
 
 
758 aa  100  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02420  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  29.1 
 
 
824 aa  100  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  28.51 
 
 
700 aa  100  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  28.45 
 
 
744 aa  99.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1228  molybdopterin oxidoreductase  28.77 
 
 
843 aa  99  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  27.03 
 
 
758 aa  98.6  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  29.92 
 
 
891 aa  98.6  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  27.03 
 
 
758 aa  98.6  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  27.03 
 
 
758 aa  98.6  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  26.47 
 
 
856 aa  98.2  8e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3374  formate dehydrogenase, alpha subunit  27 
 
 
1061 aa  98.2  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  27.03 
 
 
758 aa  97.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0286  twin-arginine translocation pathway signal  27.1 
 
 
733 aa  97.8  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2563  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  28.8 
 
 
794 aa  97.8  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000909986  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2718  molybdopterin oxidoreductase  27.84 
 
 
737 aa  97.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0619  molybdopterin oxidoreductase  28.1 
 
 
911 aa  96.7  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3659  twin-arginine translocation pathway signal  26.77 
 
 
733 aa  96.3  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0930  molybdopterin oxidoreductase  29.8 
 
 
731 aa  95.9  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.99852  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  28.18 
 
 
739 aa  95.9  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1181  molybdopterin oxidoreductase  27.17 
 
 
1073 aa  95.9  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  27.24 
 
 
698 aa  95.9  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  27.55 
 
 
732 aa  95.9  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  23.57 
 
 
812 aa  95.5  6e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18490  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  26.33 
 
 
763 aa  95.1  7e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  25.76 
 
 
760 aa  95.1  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2478  molybdopterin oxidoreductase  28.68 
 
 
820 aa  94  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.495104  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1335  molybdopterin oxidoreductase  26.23 
 
 
928 aa  94  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374333  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0479  molybdopterin oxidoreductase  26.38 
 
 
784 aa  94.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2385  molybdopterin oxidoreductase  28.43 
 
 
839 aa  94.4  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0793925 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2813  molybdopterin oxidoreductase  27.84 
 
 
738 aa  94.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2374  Nitrate reductase  28.48 
 
 
821 aa  94.4  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.037868  normal  0.51028 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1999  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.87 
 
 
657 aa  94  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3264  Nitrate reductase  24.38 
 
 
836 aa  93.6  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0520925 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1149  molybdopterin oxidoreductase  29.28 
 
 
856 aa  93.2  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000213682  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1773  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  27.65 
 
 
808 aa  93.2  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0307  molybdopterin oxidoreductase  27.3 
 
 
938 aa  92.8  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000512628  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4271  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.73 
 
 
1016 aa  92.8  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.12828  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2256  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  27.33 
 
 
816 aa  92.4  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  26.4 
 
 
741 aa  92  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2043  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  27.1 
 
 
808 aa  91.7  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4651  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25.96 
 
 
809 aa  91.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00741112  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01556  oxidoreductase subunit  27.42 
 
 
808 aa  91.7  8e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.56782  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4700  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25.96 
 
 
809 aa  91.7  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1613  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  27.1 
 
 
808 aa  91.7  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1597  molybdopterin oxidoreductase  24.74 
 
 
800 aa  91.7  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01546  hypothetical protein  27.42 
 
 
808 aa  91.7  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.838194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>