More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1678 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1678  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  100 
 
 		 250 aa  493  9.999999999999999e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0788652  normal  0.0488768 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3374  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.33 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1033  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.5 
 
 		 266 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0364714  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0989  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.85 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2876  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.2 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0487293  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0211  formate dehydrogenase accessory protein  31.91 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1205  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.04 
 
 		 303 aa  116  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.495294 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4143  formate dehydrogenase subunit FdhD  27.31 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02271  hypothetical protein  29.92 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2175  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.74 
 
 		 260 aa  112  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.145342 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0053  formate dehydrogenase, subunit FdhD  29.08 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1448  putative formate dehydrogenase accessory protein  28.4 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0343  formate dehydrogenase, subunit FdhD  30 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00229888  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3910  formate dehydrogenase accessory protein FdhD, putative  28.63 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.131875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0051  formate dehydrogenase, subunit FdhD  28.03 
 
 		 284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3714  formate dehydrogenase, subunit FdhD  28.63 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.525322 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4503  formate dehydrogenase accessory protein FdhD, putative  29.39 
 
 		 249 aa  108  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2431  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.03 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3132  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.48 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2756  formate dehydrogenase subunit FdhD  31.8 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000145311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0239  formate dehydrogenase subunit FdhD  28.63 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000144632 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3785  formate dehydrogenase, subunit FdhD  28.22 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0292467  normal  0.549187 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003500  formate dehydrogenase chain D  28.69 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0501  formate dehydrogenase accessory protein  29.22 
 
 		 268 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06930  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.96 
 
 		 297 aa  106  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.215671 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4218  formate dehydrogenase subunit FdhD  27.62 
 
 		 296 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.072328  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4130  formate dehydrogenase subunit FdhD  27.62 
 
 		 296 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.142791  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4100  formate dehydrogenase subunit FdhD  27.62 
 
 		 296 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4819  formate dehydrogenase subunit FdhD  28.17 
 
 		 298 aa  105  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0817  formate dehydrogenase accessory protein  30.95 
 
 		 276 aa  105  8e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0766349  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4427  formate dehydrogenase, subunit FdhD  27.31 
 
 		 295 aa  105  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3585  formate dehydrogenase accessory protein  27.5 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3278  formate dehydrogenase accessory protein  27.5 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3578  formate dehydrogenase accessory protein  28.63 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0687  formate dehydrogenase, subunit FdhD  30.54 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3595  formate dehydrogenase accessory protein  27.5 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3678  formate dehydrogenase accessory protein  27.5 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.688402  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3364  formate dehydrogenase accessory protein  28.22 
 
 		 265 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.144836  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1126  formate dehydrogenase accessory protein  28.1 
 
 		 337 aa  102  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1840  formate dehydrogenase accessory protein  33.03 
 
 		 268 aa  102  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00380429  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1062  formate dehydrogenase, subunit FdhD  30.93 
 
 		 479 aa  102  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0656292 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3628  formate dehydrogenase accessory protein  28.22 
 
 		 265 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3370  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.91 
 
 		 487 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1860  formate dehydrogenase accessory protein  29.36 
 
 		 260 aa  102  7e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3328  formate dehydrogenase accessory protein  28.22 
 
 		 265 aa  102  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0183588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1343  formate dehydrogenase accessory protein  30.93 
 
 		 263 aa  101  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4115  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  26.69 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.271618  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3619  formate dehydrogenase accessory protein FdhD, putative  26.78 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0626  formate dehydrogenase accessory protein  27.57 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1216  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.07 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.944709  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1437  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.59 
 
 		 255 aa  99.8  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0654  formate dehydrogenase accessory protein  27.57 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1681  formate dehydrogenase accessory protein  29.11 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1500  formate dehydrogenase accessory protein  29.11 
 
 		 260 aa  99.4  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.919736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4711  formate dehydrogenase accessory protein  27.16 
 
 		 268 aa  99  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4033  formate dehydrogenase accessory protein  32.18 
 
 		 287 aa  99  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.681532  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3385  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.79 
 
 		 483 aa  99  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0715  formate dehydrogenase accessory protein  27.57 
 
 		 268 aa  98.6  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2347  formate dehydrogenase accessory protein  30.38 
 
 		 265 aa  98.6  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2305  formate dehydrogenase accessory protein  30.38 
 
 		 265 aa  98.6  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1639  formate dehydrogenase accessory protein  28.05 
 
 		 223 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1058  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.21 
 
 		 264 aa  97.8  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3715  formate dehydrogenase subunit FdhD  26.47 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.351414  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0556  formate dehydrogenase accessory protein  27.57 
 
 		 268 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0498  formate dehydrogenase accessory protein  27.57 
 
 		 268 aa  97.1  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0588  formate dehydrogenase accessory protein  27.57 
 
 		 268 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0644  formate dehydrogenase accessory protein  27.57 
 
 		 268 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12913  formate dehydrogenase accessory protein  32.6 
 
 		 276 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.167876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1958  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.11 
 
 		 468 aa  96.7  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0994  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.23 
 
 		 295 aa  96.7  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0500  formate dehydrogenase accessory protein  27.57 
 
 		 268 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2076  formate dehydrogenase, subunit FdhD  29.46 
 
 		 263 aa  96.3  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.82479e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2264  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.69 
 
 		 468 aa  96.3  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1030  formate dehydrogenase accessory protein  31.25 
 
 		 263 aa  96.3  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2817  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.74 
 
 		 255 aa  96.3  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1157  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.8 
 
 		 274 aa  95.5  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2367  FDHD protein  27.43 
 
 		 291 aa  95.1  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0478854 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00469  formate dehydrogenase accessory protein  30.31 
 
 		 273 aa  95.1  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0504  formate dehydrogenase accessory protein  26.45 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2852  formate dehydrogenase accessory protein  31.47 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.743331  normal  0.675793 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3577  formate dehydrogenase accessory protein  30.89 
 
 		 274 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3572  formate dehydrogenase accessory protein  30.89 
 
 		 274 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3645  formate dehydrogenase accessory protein  30.89 
 
 		 274 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.259742 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2742  formate dehydrogenase accessory protein  30.64 
 
 		 271 aa  92.8  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.455642 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0556  formate dehydrogenase accessory protein  32.26 
 
 		 281 aa  93.2  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152789  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2277  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.12 
 
 		 258 aa  92.4  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3819  formate dehydrogenase accessory protein  31.28 
 
 		 269 aa  92.4  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1320  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.89 
 
 		 254 aa  92.4  6e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2557  formate dehydrogenase accessory protein  29.71 
 
 		 269 aa  92  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0780  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  28.76 
 
 		 478 aa  91.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.162723  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3635  formate dehydrogenase accessory protein  31.37 
 
 		 274 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222739 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0466  formate dehydrogenase accessory protein  26.78 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.276769  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1081  formate dehydrogenase accessory protein  30.34 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3723  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.11 
 
 		 303 aa  91.3  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.521477 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29960  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.55 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0806  formate dehydrogenase accessory protein  31.25 
 
 		 276 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2346  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.08 
 
 		 284 aa  90.5  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36394  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0719  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.64 
 
 		 278 aa  90.5  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2580  formate dehydrogenase subunit FdhD  28.44 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal  0.264505 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1176  putative fdhD protein  30.08 
 
 		 299 aa  90.5  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.108793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>