More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1154 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1154  putative CheW protein  100 
 
 		 216 aa  434  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.239991  normal  0.152516 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0776  CheW protein  64.89 
 
 		 228 aa  280  1e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.01614 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1575  CheW protein  56.3 
 
 		 239 aa  256  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0210476  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1381  CheW protein  36.99 
 
 		 245 aa  148  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.519881  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  32.21 
 
 		 218 aa  88.6  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  35.77 
 
 		 147 aa  85.9  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  34.06 
 
 		 165 aa  85.1  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  34.06 
 
 		 165 aa  85.1  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  33.33 
 
 		 159 aa  84.3  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  30 
 
 		 154 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3468  CheW protein  32.35 
 
 		 153 aa  84  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.406032  normal  0.213899 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  32.35 
 
 		 139 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  36.67 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  28.08 
 
 		 167 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  30.28 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  27.66 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  31.25 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  31.47 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0320  CheW protein  27.82 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  34.4 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3603  CheW protein  36.03 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861446  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  31.43 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.62 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  35.83 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  32.12 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1529  CheW protein  29.41 
 
 		 163 aa  77.4  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  26.28 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  30.94 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  32.54 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  31.39 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0206  CheW domain protein  30.14 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00161643  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  26.28 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  29.41 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  31.39 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  32.54 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  39.81 
 
 		 531 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  24.82 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  28.78 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  31.62 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  26.28 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  29.93 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  30.95 
 
 		 158 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  26.32 
 
 		 174 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  28.78 
 
 		 163 aa  74.7  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  31.82 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  30.88 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  30.15 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  28.57 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  31.2 
 
 		 518 aa  72.8  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.14 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  29.71 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  27.21 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.58 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  27.97 
 
 		 171 aa  72  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  33.33 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  27.94 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  28.47 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2709  putative CheW protein  29.93 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  40.4 
 
 		 479 aa  70.9  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  30.71 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0331  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.49 
 
 		 173 aa  70.9  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.337865  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  27.21 
 
 		 165 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  27.54 
 
 		 164 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  28.8 
 
 		 148 aa  70.9  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0309  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.49 
 
 		 173 aa  70.9  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1688  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.49 
 
 		 173 aa  70.9  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  27.21 
 
 		 165 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  26.62 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  27.21 
 
 		 165 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  30.5 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3887  CheW protein  31.62 
 
 		 141 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.110248  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  27.94 
 
 		 159 aa  70.5  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  27.86 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  25.37 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  26.56 
 
 		 478 aa  70.5  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  27.27 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  25.37 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  28.68 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  27.94 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  26.87 
 
 		 159 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  25.19 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  30.91 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2218  chemotaxis protein CheW  33.09 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  25.9 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  33.09 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  28.47 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  27.54 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  27.94 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  26.81 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  36.04 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0568  CheW protein  26.62 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141879  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  27.33 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  26.47 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.86 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  23.7 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  27.33 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0275  putative CheW protein  28.06 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.18524  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  27.86 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  27.86 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  27.86 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>