More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0797 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0797  hypothetical protein  100 
 
 
488 aa  963    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2954  protein of unknown function DUF214  72.08 
 
 
443 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0954365 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0268  ABC-type transport system, permease component  63.13 
 
 
417 aa  509  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1336  hypothetical protein  56.19 
 
 
454 aa  491  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.420659  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  32.76 
 
 
401 aa  211  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  34.46 
 
 
402 aa  200  6e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  31.84 
 
 
400 aa  196  8.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  34.15 
 
 
409 aa  193  7e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  31.68 
 
 
401 aa  192  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  33.42 
 
 
409 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  33.09 
 
 
409 aa  190  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  31.93 
 
 
406 aa  190  5.999999999999999e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  33.42 
 
 
409 aa  189  7e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  32.59 
 
 
405 aa  189  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  33.5 
 
 
401 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  31.34 
 
 
406 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  34.71 
 
 
409 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  32.69 
 
 
443 aa  187  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  34.71 
 
 
409 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  34.84 
 
 
402 aa  184  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  33.5 
 
 
408 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  33.58 
 
 
402 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  33.58 
 
 
402 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  34.22 
 
 
409 aa  182  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  33.99 
 
 
401 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  31.77 
 
 
400 aa  181  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  33.99 
 
 
401 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  34.15 
 
 
407 aa  181  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  32.73 
 
 
400 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  30.02 
 
 
406 aa  179  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  29.35 
 
 
406 aa  177  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  28.71 
 
 
405 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  31.09 
 
 
400 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  32.1 
 
 
402 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  31.37 
 
 
405 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  29.14 
 
 
403 aa  173  5e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  31.09 
 
 
400 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0320  hypothetical protein  32.36 
 
 
401 aa  173  6.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.895075  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  31.55 
 
 
405 aa  172  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  32.51 
 
 
403 aa  170  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  30.2 
 
 
657 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  32.03 
 
 
405 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  29.56 
 
 
409 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  31.43 
 
 
418 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  32.51 
 
 
658 aa  166  8e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  31.33 
 
 
657 aa  166  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1168  hypothetical protein  32.75 
 
 
406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.69946  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  30.92 
 
 
663 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  31.68 
 
 
656 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  30.67 
 
 
663 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3570  protein of unknown function DUF214  32.84 
 
 
409 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  31.7 
 
 
403 aa  162  9e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  32.86 
 
 
410 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  29.9 
 
 
647 aa  162  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  32.59 
 
 
409 aa  161  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  34.65 
 
 
398 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  29.78 
 
 
656 aa  160  5e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  31.14 
 
 
409 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  29.76 
 
 
405 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  31.39 
 
 
405 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  31.39 
 
 
405 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0835  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  32.18 
 
 
653 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.077145  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2185  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  32.18 
 
 
653 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  31.44 
 
 
653 aa  159  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2453  ABC transporter related  31.35 
 
 
676 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  26.91 
 
 
456 aa  159  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  31.36 
 
 
656 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0926  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  32.18 
 
 
653 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  26.46 
 
 
406 aa  157  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  28.78 
 
 
415 aa  157  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  28.5 
 
 
412 aa  157  5.0000000000000005e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  32.08 
 
 
671 aa  156  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  32 
 
 
681 aa  156  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  31.13 
 
 
409 aa  156  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  32 
 
 
681 aa  156  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  29.26 
 
 
654 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  29.75 
 
 
391 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  30 
 
 
411 aa  155  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  30.94 
 
 
644 aa  155  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  30.75 
 
 
412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2608  hypothetical protein  31.77 
 
 
411 aa  154  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  30.73 
 
 
657 aa  154  4e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  31.25 
 
 
687 aa  154  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  30.02 
 
 
403 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  29.98 
 
 
405 aa  153  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  29.98 
 
 
405 aa  153  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  32.28 
 
 
411 aa  153  8e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  32.33 
 
 
661 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  31.45 
 
 
408 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3269  hypothetical protein  30.02 
 
 
417 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392624  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  30.17 
 
 
651 aa  152  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  27.91 
 
 
715 aa  152  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  28.74 
 
 
417 aa  150  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  29.27 
 
 
423 aa  150  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  31.8 
 
 
657 aa  150  7e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  29.78 
 
 
412 aa  150  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  28.61 
 
 
649 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  29 
 
 
657 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  31.09 
 
 
655 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  30.3 
 
 
668 aa  148  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>