184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0377 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0377  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
387 aa  779    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.82002 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1853  glycosyl transferase group 1  75.67 
 
 
385 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0428  glycosyltransferase-like protein  49.59 
 
 
642 aa  327  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0449  glycosyl transferase group 1  36.8 
 
 
394 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3288  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 
393 aa  195  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2768  putative glycosyl transferase  44.73 
 
 
407 aa  182  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2887  putative glycosyl transferase  32.51 
 
 
394 aa  176  8e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2598  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
418 aa  168  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0313  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 
410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.448937  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2969  WbdP  35.53 
 
 
404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.640876  hitchhiker  0.0000040837 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0851  a-glycosyltransferase  30.19 
 
 
389 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0398981  normal  0.216121 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2575  glycosyl transferase group 1  30.55 
 
 
409 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1846  glycosyl transferase  34.29 
 
 
391 aa  154  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4221  glycosyl transferase group 1  34.8 
 
 
407 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.775919  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3057  glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 
409 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
393 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 
431 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3194  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 
362 aa  68.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  23.71 
 
 
372 aa  68.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  24.37 
 
 
376 aa  67.4  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1813  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
413 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
371 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3951  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 
408 aa  64.3  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.703007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 
440 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  27.24 
 
 
417 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
381 aa  60.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  27.35 
 
 
375 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 
386 aa  60.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3158  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
408 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3591  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 
416 aa  59.7  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 
366 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 
382 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 
420 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 
458 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  26.81 
 
 
376 aa  57  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4295  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
416 aa  56.6  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0106355  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
355 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3093  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
361 aa  57  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 
419 aa  56.2  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  26.99 
 
 
375 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  24.51 
 
 
386 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  22.91 
 
 
382 aa  56.2  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.44 
 
 
369 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 
384 aa  53.9  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  22 
 
 
395 aa  54.3  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  20.51 
 
 
366 aa  53.1  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
385 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 
467 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  24.66 
 
 
569 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
361 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  23.14 
 
 
372 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  23.84 
 
 
364 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  25.41 
 
 
374 aa  51.6  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  29.82 
 
 
406 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  22.88 
 
 
1119 aa  51.6  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  27.65 
 
 
353 aa  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
426 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2799  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 
421 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  28.36 
 
 
409 aa  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0528  glycosyl transferase group 1  23.05 
 
 
368 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  22.61 
 
 
364 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  22.99 
 
 
364 aa  51.2  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  23.67 
 
 
371 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  23.48 
 
 
373 aa  51.2  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
1080 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  27.23 
 
 
397 aa  51.2  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0295  hypothetical protein  27.36 
 
 
413 aa  50.8  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3369  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 
422 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0357213 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  25.97 
 
 
428 aa  50.8  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 
446 aa  50.8  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7580  WbdA; mannosyl transferase A  35.07 
 
 
377 aa  50.8  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207702  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0755  glycosyl transferase, group 1  33.08 
 
 
344 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
400 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 
360 aa  50.1  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5498  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
381 aa  50.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  35.87 
 
 
800 aa  49.7  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  25.31 
 
 
384 aa  50.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  31.47 
 
 
426 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 
395 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  28.73 
 
 
423 aa  49.7  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3058  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
402 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
361 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  23.12 
 
 
387 aa  49.3  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  27.54 
 
 
935 aa  49.3  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1999  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
403 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  24.5 
 
 
381 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  33.91 
 
 
390 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1676  glycosyl transferase, group 1  24.91 
 
 
639 aa  48.9  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13811  hypothetical protein  27.45 
 
 
374 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.47971  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2458  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
774 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.745195  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  22.27 
 
 
369 aa  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 
366 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5069  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
434 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750506  normal  0.0356262 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3130  glycosyl transferase, group 1  23.57 
 
 
765 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215662  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  29.19 
 
 
392 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
393 aa  47.8  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  18.63 
 
 
388 aa  47.4  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5854  putative glycosyl transferase  33.04 
 
 
381 aa  47.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707632  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4017  glycosyl transferase, group 1  28.47 
 
 
784 aa  47  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.997952  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  22.95 
 
 
536 aa  47  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>