More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1098 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1098  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 408 aa  832    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.152067 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0592  glycosyltransferase-like protein  33.5 
 
 		 379 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0615  glycosyl transferase, group 1  33.71 
 
 		 377 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0230  glycosyl transferase group 1  34.69 
 
 		 369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  31.01 
 
 		 386 aa  139  8.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0291  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 		 372 aa  109  8.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 		 375 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0113  glycosyl transferase, group 1  32.66 
 
 		 369 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 		 381 aa  100  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0169  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 		 372 aa  96.3  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1546  glycosyl transferase, group 1  24.22 
 
 		 400 aa  94.7  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0752517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 		 381 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  32.71 
 
 		 414 aa  90.5  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1977  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 		 404 aa  90.1  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.665081 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1737  glycosyl transferase, group 1  31.72 
 
 		 403 aa  90.1  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.75946 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  33.16 
 
 		 405 aa  89.7  8e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 		 385 aa  89.7  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 		 378 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0074  glycosyl transferase group 1  25.28 
 
 		 374 aa  86.3  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.82 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0522  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.62557  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  38.97 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2793  glycosyl transferase, group 1  27.12 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.09685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 		 409 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  28.43 
 
 		 405 aa  82.8  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4376  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66230  UDP-glucose:(heptosyl) LPS alpha 1,3-glucosyltransferase WaaG  28.06 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4047  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  26.15 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.40753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4109  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  26.15 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3921  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  26.15 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.149392  hitchhiker  0.00193824 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  26.15 
 
 		 374 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.04812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  32.79 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  27 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0371  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 		 374 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145576  normal  0.379585 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3939  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  25.77 
 
 		 374 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 		 770 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0368  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44840  Lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.8 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0581  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0475822 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  33.53 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4860  glycosyl transferase group 1  27 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.480448 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  35.29 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0343  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  27 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.213865  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  25.89 
 
 		 364 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6086  glycosyl transferase group 1  28 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964104  decreased coverage  0.00104043 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  35.17 
 
 		 363 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 		 373 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  35.33 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  29.15 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1274  glucosyltransferase I  25.26 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  37.43 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  34.36 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  34.92 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  30.15 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 		 453 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  28.52 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2085  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  30.37 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1454  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0515255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  32.95 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  37.19 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  28.02 
 
 		 401 aa  76.3  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5745  UDP-glucose:(heptosyl) LPS alpha 1,3-glucosyltransferase WaaG  26.02 
 
 		 373 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.856314  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0467  glycosyl transferase, group 1  27 
 
 		 373 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 		 408 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 		 391 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 		 819 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 394 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  35.27 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4132  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  25.19 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000485252  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  35.57 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03488  glucosyltransferase I  25.19 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4279  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00024185  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  31.53 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03440  hypothetical protein  25.19 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  35.47 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3966  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  25.19 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0237842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1409  WabG  23.29 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  33.55 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4056  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  25.19 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  25.19 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0164155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  29.65 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 		 448 aa  73.9  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 		 536 aa  73.6  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3840  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  24.81 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000503275  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  34.51 
 
 		 372 aa  72.8  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>