More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0277 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0277  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 		 225 aa  435  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0902119 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2047  hypothetical protein  52.54 
 
 		 163 aa  159  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0813552  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1252  hypothetical protein  53.8 
 
 		 162 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.508507 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1704  protein of unknown function UPF0079  48.39 
 
 		 168 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.44845  normal  0.0233413 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1142  protein of unknown function UPF0079  42.68 
 
 		 161 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1852  protein of unknown function UPF0079  41.01 
 
 		 158 aa  105  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.562422  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  34.81 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  42.54 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  38 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1296  hypothetical protein  39.81 
 
 		 161 aa  74.3  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0433075  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1159  hypothetical protein  38.89 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147113  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  36.08 
 
 		 505 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0101  hypothetical protein  43.17 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.286215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  35.53 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  33.51 
 
 		 504 aa  71.6  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  40.51 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  39.64 
 
 		 165 aa  70.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20781  ATPase or kinase  36.05 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.645705  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2754  hypothetical protein  29.31 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2627  hypothetical protein  29.31 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1203  hypothetical protein  34.25 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  42.75 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  36.14 
 
 		 503 aa  68.9  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  37.01 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  36.94 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  36.44 
 
 		 149 aa  67.8  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  35.34 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  33.74 
 
 		 152 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  33.74 
 
 		 152 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  36.03 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0145  hypothetical protein  40 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550915  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  35.14 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  36.03 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  31.45 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  35.14 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  40.74 
 
 		 540 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  33.74 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  33.13 
 
 		 152 aa  64.7  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  31.48 
 
 		 162 aa  64.3  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  33.13 
 
 		 152 aa  64.7  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl495  ATPase  32.26 
 
 		 139 aa  63.9  0.000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  35.54 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  33.13 
 
 		 152 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  33.13 
 
 		 152 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  33.13 
 
 		 152 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  35.09 
 
 		 549 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  33.13 
 
 		 152 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  37.24 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37266  predicted protein  34.92 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01741  ATPase or kinase  38.02 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  36.22 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04610  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  44.54 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.343919 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  38.05 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  43.24 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  37.96 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  36.15 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  35.37 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  35.37 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  37.06 
 
 		 506 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3209  hypothetical protein  34.97 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000564317  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2330  hypothetical protein  43.55 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  32.45 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  44.57 
 
 		 542 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  35.37 
 
 		 156 aa  62  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1355  P-loop hydrolase/phosphotransferase  31.33 
 
 		 497 aa  62  0.000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1719  hypothetical protein  30.37 
 
 		 145 aa  62  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.266415  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  35.77 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0818  hypothetical protein  30.73 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000019093  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  33.54 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1524  hypothetical protein  34.19 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.535681  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0387  hypothetical protein  40.48 
 
 		 168 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.919602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0100  protein of unknown function UPF0079  36.7 
 
 		 151 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0009157  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2157  hypothetical protein  37.5 
 
 		 165 aa  61.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  36.17 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  37.41 
 
 		 152 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  33.6 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2666  hypothetical protein  38.53 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0641125  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0666  protein of unknown function UPF0079  36.11 
 
 		 523 aa  60.1  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  39.71 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  32.8 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  30.57 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  38.26 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1496  hypothetical protein  36.81 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00826257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  32.56 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0082  hypothetical protein  39.62 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.659659 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6124  protein of unknown function UPF0079  38.35 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  33.09 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  38.89 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  34.13 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  41.9 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1081  ATPase  26.74 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  33.08 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  36.69 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0122  protein of unknown function UPF0079  35.96 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000147481  hitchhiker  0.00840651 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1503  hypothetical protein  40.94 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170985  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  33.08 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  34.32 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  32.12 
 
 		 505 aa  58.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>