More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1252 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1252  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  323  7e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.508507 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2047  hypothetical protein  50 
 
 		 163 aa  144  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0813552  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0277  protein of unknown function UPF0079  51.46 
 
 		 225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0902119 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1704  protein of unknown function UPF0079  50 
 
 		 168 aa  125  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.44845  normal  0.0233413 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1142  protein of unknown function UPF0079  45.99 
 
 		 161 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1852  protein of unknown function UPF0079  53.78 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.562422  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  40.52 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  40.28 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0974  protein of unknown function UPF0079  37.42 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000133858  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  38.24 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  41.73 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  38.64 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  37.5 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  33.75 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  40.31 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  41.91 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  37.88 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  38.64 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  38.81 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  40.14 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  38.13 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  38.13 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  38.46 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  37.5 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  37.88 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  38.64 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  37.88 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  38.64 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  36.42 
 
 		 171 aa  70.5  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  38.46 
 
 		 156 aa  70.5  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  38.46 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  38.28 
 
 		 157 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  38.46 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  38.46 
 
 		 157 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04610  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  40.52 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.343919 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1203  hypothetical protein  33.09 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  33.77 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20781  ATPase or kinase  33.09 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.645705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  39.86 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  45 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3578  hypothetical protein  39.1 
 
 		 498 aa  68.2  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.303943  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  36.28 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1453  hypothetical protein  40.34 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2157  hypothetical protein  39.44 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  31.75 
 
 		 157 aa  67  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  40.57 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  35.61 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  36.36 
 
 		 152 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  39.06 
 
 		 504 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  41.74 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  41.38 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0186  hypothetical protein  34.45 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  36.89 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  36.76 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  34.01 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  33.54 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  35.48 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1296  hypothetical protein  33.62 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0433075  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  38.93 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1524  hypothetical protein  34.59 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.535681  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1159  hypothetical protein  33.62 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147113  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  33.59 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  33.59 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0122  protein of unknown function UPF0079  36.36 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000147481  hitchhiker  0.00840651 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  37.9 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  37.75 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1784  protein of unknown function UPF0079  36.36 
 
 		 176 aa  63.9  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0485483  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  35.71 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  39.66 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  39.46 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0387  hypothetical protein  40 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.919602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3923  putative ATPase  36.76 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00130971  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2001  hypothetical protein  42.2 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0195579  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  38.1 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0531  protein of unknown function UPF0079  34.51 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0352512  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  36.73 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  40.58 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0893  protein of unknown function UPF0079  38.81 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl495  ATPase  36.04 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  37.96 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  43.37 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  38.66 
 
 		 540 aa  62  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0357  hypothetical protein  40.87 
 
 		 179 aa  62  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.479824  normal  0.0878506 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2666  hypothetical protein  35.76 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0641125  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0174  hypothetical protein  39.46 
 
 		 169 aa  62  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00309519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0351  putative ATPase  34.42 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000572111  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3725  putative ATPase  36.03 
 
 		 160 aa  62  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  34.92 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  34.51 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1492  hypothetical protein  32.48 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  35.04 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  41.43 
 
 		 183 aa  60.8  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  31.94 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00412  hypothetical protein  36.99 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.238798  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  38.89 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0095  hypothetical protein  33.77 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29240  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  42.61 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  40.91 
 
 		 506 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  38.14 
 
 		 549 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4639  putative ATPase  32.89 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162208  normal  0.0835245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>