256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2242 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2242  putative metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
333 aa  668    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2752  putative metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
333 aa  668    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380843  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1852  putative metal dependent phosphohydrolase  70.75 
 
 
349 aa  442  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3466  putative metal dependent phosphohydrolase  70.34 
 
 
330 aa  442  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4783  putative metal dependent phosphohydrolase  59.62 
 
 
329 aa  350  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0983875  normal  0.561862 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2693  HD-GYP domain-containing protein  52.88 
 
 
319 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1003  putative metal dependent phosphohydrolase  35.76 
 
 
423 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4051  HD-GYP domain-containing protein  31.91 
 
 
449 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4666  putative metal dependent phosphohydrolase  35.52 
 
 
403 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2795  hypothetical protein  33.56 
 
 
331 aa  144  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0489  HD-GYP domain-containing protein  32.48 
 
 
402 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2773  hypothetical protein  30.8 
 
 
409 aa  132  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.804833  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1357  metal dependent phosphohydrolase  32.93 
 
 
399 aa  126  6e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2647  metal dependent phosphohydrolase  32.43 
 
 
385 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.427362 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4311  putative metal dependent phosphohydrolase  33.19 
 
 
408 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  33.49 
 
 
377 aa  94.7  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0258  metal dependent phosphohydrolase  28.83 
 
 
375 aa  86.3  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0373  putative metal dependent phosphohydrolase  29.65 
 
 
410 aa  82.4  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  25.47 
 
 
436 aa  72.4  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0570  metal dependent phosphohydrolase  27.96 
 
 
417 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000128734 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  26.26 
 
 
424 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  22.22 
 
 
410 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0132  metal dependent phosphohydrolase  26.51 
 
 
457 aa  67  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000251031  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  23.81 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1256  HD domain-containing protein  23.11 
 
 
392 aa  65.9  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0488462  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  22.69 
 
 
421 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  27.42 
 
 
404 aa  64.3  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  26.67 
 
 
414 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  23.94 
 
 
393 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  21.18 
 
 
388 aa  63.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2375  metal dependent phosphohydrolase  20.75 
 
 
407 aa  63.2  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000143917  unclonable  0.000001487 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  26.42 
 
 
427 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22020  metal dependent phosphohydrolase  22.99 
 
 
362 aa  62.8  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  25.94 
 
 
372 aa  62.4  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2680  HD-GYP domain-containing protein  24.65 
 
 
488 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.467072 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2489  metal dependent phosphohydrolase  19.58 
 
 
416 aa  62  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  25.87 
 
 
448 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  22.95 
 
 
395 aa  61.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2512  hypothetical protein  25.23 
 
 
406 aa  61.6  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  26.64 
 
 
395 aa  61.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  24.53 
 
 
448 aa  60.5  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2302  HD domain-containing protein  24.64 
 
 
421 aa  60.1  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.332838  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  24.32 
 
 
401 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  26.39 
 
 
413 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  22.36 
 
 
390 aa  59.7  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  24.87 
 
 
411 aa  59.3  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3114  metal dependent phosphohydrolase  25.84 
 
 
446 aa  59.3  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1691  metal dependent phosphohydrolase  22.34 
 
 
398 aa  58.9  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0771353  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  23.11 
 
 
406 aa  58.5  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0282  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 
448 aa  58.5  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  22.81 
 
 
350 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1740  metal dependent phosphohydrolase  21.4 
 
 
401 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0020457  hitchhiker  0.000000139322 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1707  metal dependent phosphohydrolase  23.59 
 
 
401 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.336199  hitchhiker  0.00000000228232 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1510  metal dependent phosphohydrolase  24.1 
 
 
401 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.933649  hitchhiker  0.00011733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1577  metal dependent phosphohydrolase  24.1 
 
 
401 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1724  metal dependent phosphohydrolase  23.24 
 
 
419 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1571  metal dependent phosphohydrolase  24.1 
 
 
401 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000899891 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1942  HDIG domain-containing protein  20.75 
 
 
420 aa  57.4  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2862  HDIG domain-containing protein  23.59 
 
 
401 aa  57.4  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  20.81 
 
 
401 aa  57.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1519  putative metal dependent phosphohydrolase  23.27 
 
 
404 aa  57.8  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000671855  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3198  metal dependent phosphohydrolase  24.88 
 
 
359 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2677  metal dependent phosphohydrolase  23.08 
 
 
401 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0495903  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2756  metal dependent phosphohydrolase  23.08 
 
 
401 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  22.48 
 
 
421 aa  56.6  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  19.59 
 
 
418 aa  56.6  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2497  metal dependent phosphohydrolase  20.17 
 
 
420 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.542039  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1847  metal dependent phosphohydrolase  20.17 
 
 
420 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300439  hitchhiker  0.00112641 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  24.17 
 
 
401 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  22.51 
 
 
404 aa  56.2  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  27.08 
 
 
413 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  23.24 
 
 
400 aa  55.8  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  26.52 
 
 
713 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3285  response regulator receiver  27.21 
 
 
362 aa  55.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  24.64 
 
 
389 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2617  metal dependent phosphohydrolase  19.83 
 
 
421 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2504  metal dependent phosphohydrolase  19.83 
 
 
420 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.683485  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  24.69 
 
 
402 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2333  hypothetical protein  18.49 
 
 
426 aa  54.7  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250947  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  23.08 
 
 
564 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1194  metal dependent phosphohydrolase  23.08 
 
 
339 aa  54.3  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4105  metal dependent phosphohydrolase  27.74 
 
 
199 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000135531  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0663  putative PAS/PAC sensor protein  28.14 
 
 
384 aa  54.3  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  23.08 
 
 
563 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  24.64 
 
 
402 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1930  metal dependent phosphohydrolase  22.18 
 
 
379 aa  53.9  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.421896  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2459  metal dependent phosphohydrolase  24.53 
 
 
400 aa  53.5  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  23.81 
 
 
363 aa  53.5  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0571  metal dependent phosphohydrolase  25.25 
 
 
346 aa  53.1  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1823  metal dependent phosphohydrolase  22.99 
 
 
405 aa  53.1  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1721  metal dependent phosphohydrolase  19.59 
 
 
420 aa  53.1  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6453  normal  0.200178 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  23.04 
 
 
402 aa  53.5  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0202  metal dependent phosphohydrolase  22.53 
 
 
375 aa  53.1  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2642  metal dependent phosphohydrolase  23.59 
 
 
401 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3755  metal-dependent phosphohydrolase  25.74 
 
 
435 aa  53.1  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1577  metal dependent phosphohydrolase  18.41 
 
 
420 aa  52.8  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  24.68 
 
 
439 aa  53.1  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0551  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 
240 aa  52.8  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  23.68 
 
 
349 aa  52.8  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1326  metal dependent phosphohydrolase  25.87 
 
 
428 aa  52.8  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>