110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1336 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2015  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1089 bp  2159    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0089  transposase, IS4 family protein  98.53 
 
 		 1089 bp  2032    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0576  transposase, IS4 family protein  98.53 
 
 		 1089 bp  2032    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78227  normal  0.0868679 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0754  transposase, IS4 family protein  98.53 
 
 		 1089 bp  2032    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0806  transposase, IS4 family protein  98.53 
 
 		 1089 bp  2032    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1230  transposase, IS4 family protein  98.53 
 
 		 1089 bp  2032    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1431  transposase, IS4 family protein  98.53 
 
 		 1089 bp  2032    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.771105 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1519  transposase, IS4 family protein  98.53 
 
 		 1089 bp  2032    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1871  transposase, IS4 family protein  98.53 
 
 		 1089 bp  2032    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.85058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1916  transposase, IS4 family protein  98.53 
 
 		 1089 bp  2032    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.176419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2122  transposase, IS4 family protein  98.53 
 
 		 1089 bp  2032    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.973511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2523  ATP-dependent DNA ligase  98.04 
 
 		 2514 bp  3826    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000543878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2685  transposase, IS4 family protein  98.53 
 
 		 1089 bp  2032    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235088  normal  0.541519 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2866  transposase, IS4 family protein  98.53 
 
 		 1089 bp  2032    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.953499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3184  transposase, IS4 family protein  98.53 
 
 		 1089 bp  2032    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3331  transposase, IS4 family protein  98.53 
 
 		 1089 bp  2032    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  0.0435671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3410  transposase, IS4 family protein  98.53 
 
 		 1089 bp  2032    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3613  transposase, IS4 family protein  98.53 
 
 		 1089 bp  2032    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3703  transposase, IS4 family protein  98.53 
 
 		 1089 bp  2032    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.757011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3918  transposase, IS4 family protein  98.53 
 
 		 1089 bp  2032    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2124  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1098 bp  1697    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.436654  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1337  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1089 bp  2159    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1336    100 
 
 		 3842 bp  7616    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0222  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1089 bp  2159    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0686  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1089 bp  2159    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.278758  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0050  ISMca1, transposase  83.24 
 
 		 1101 bp  462  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0096  ISMca1, transposase  83.24 
 
 		 1101 bp  462  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0227  ISMca1, transposase  83.24 
 
 		 1101 bp  462  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0751226  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0307  ISMca1, transposase  83.24 
 
 		 1101 bp  462  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0723  ISMca1, transposase  83.24 
 
 		 1101 bp  462  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.619399  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0980  ISMca1, transposase  83.24 
 
 		 1101 bp  462  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1090  ISMca1, transposase  83.24 
 
 		 1101 bp  462  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1177  ISMca1, transposase  83.24 
 
 		 1101 bp  462  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1197  ISMca1, transposase  83.24 
 
 		 1101 bp  462  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1312  ISMca1, transposase  83.24 
 
 		 1101 bp  462  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1514  ISMca1, transposase  83.24 
 
 		 1101 bp  462  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332926  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1517  ISMca1, transposase  83.24 
 
 		 1101 bp  462  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1580  ISMca1, transposase  83.24 
 
 		 1101 bp  462  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1956  ISMca1, transposase  83.24 
 
 		 1101 bp  462  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725664  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2178  ISMca1, transposase  83.24 
 
 		 1101 bp  462  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2511  ISMca1, transposase  83.24 
 
 		 1101 bp  462  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229212  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2556  ISMca1, transposase  83.24 
 
 		 1101 bp  462  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.186429  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2687  prophage LambdaMc01, ISMca1, transposase  83.24 
 
 		 1101 bp  462  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.765288  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2810  ISMca1, transposase  83.24 
 
 		 1101 bp  462  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2964  ISMca1, transposase  83.24 
 
 		 1101 bp  462  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0221    100 
 
 		 141 bp  280  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4339  ATP-dependent DNA ligase  83.06 
 
 		 2616 bp  276  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0275716 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0687    100 
 
 		 150 bp  274  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110792  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1229  LysR family transcriptional regulator  97.87 
 
 		 903 bp  256  4e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3612  hypothetical protein  97.2 
 
 		 267 bp  252  6.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1870    97.83 
 
 		 291 bp  250  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2121  putative transposase  97.83 
 
 		 1593 bp  250  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2519  ATP-dependent DNA ligase  88.29 
 
 		 2820 bp  216  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0498  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  87.06 
 
 		 897 bp  163  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1660  ATP-dependent DNA ligase  82.74 
 
 		 2544 bp  139  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.600549  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2125  hypothetical protein  98.31 
 
 		 234 bp  109  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.180582  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2247  ATP-dependent DNA ligase  82.72 
 
 		 2541 bp  99.6  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3183  type IV pilus modification protein PilV  96.36 
 
 		 474 bp  93.7  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3614  phage integrase family protein  96.36 
 
 		 1068 bp  93.7  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36910  ATP-dependent DNA ligase  88.24 
 
 		 2523 bp  89.7  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0564843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5079  ATP-dependent DNA ligase  86.02 
 
 		 2706 bp  81.8  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.795218  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3173  ATP-dependent DNA ligase  82.27 
 
 		 2544 bp  81.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1177  ATP-dependent DNA ligase  81.76 
 
 		 2562 bp  79.8  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0283  transposase IS4  87.84 
 
 		 1077 bp  75.8  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1069  transposase IS4  87.84 
 
 		 1077 bp  75.8  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0456377 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2091  transposase IS4  87.84 
 
 		 1077 bp  75.8  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000396436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2240  transposase IS4  87.84 
 
 		 1077 bp  75.8  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000126004 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2488  transposase IS4  87.84 
 
 		 1077 bp  75.8  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2883  transposase IS4  87.84 
 
 		 1077 bp  75.8  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446649 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3283  transposase IS4  87.84 
 
 		 1014 bp  75.8  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5660  transposase IS4 family protein  95.45 
 
 		 1098 bp  71.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3217  ATP-dependent DNA ligase  87.32 
 
 		 2514 bp  69.9  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.311781 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2635  ATP-dependent DNA ligase  89.83 
 
 		 2502 bp  69.9  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232561  normal  0.576376 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3003  ATP-dependent DNA ligase  81.82 
 
 		 2649 bp  65.9  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0636525  normal  0.554248 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2097  ATP-dependent DNA ligase  85.92 
 
 		 2547 bp  61.9  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0529    87.3 
 
 		 723 bp  61.9  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117782 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5975    93.02 
 
 		 895 bp  61.9  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100438  normal  0.316362 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3260  ATP-dependent DNA ligase  85.14 
 
 		 2502 bp  60  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1803  putative transposase  87.93 
 
 		 1107 bp  60  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3685  ATP-dependent DNA ligase  96.97 
 
 		 2736 bp  58  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.865038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4820  hypothetical protein  94.59 
 
 		 603 bp  58  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55390  hypothetical protein  94.44 
 
 		 603 bp  56  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000287177  normal  0.0495553 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0488  DNA ligase D  96.88 
 
 		 2604 bp  56  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160576  normal  0.373477 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7582  DNA ligase D  100 
 
 		 1956 bp  56  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3464  DNA ligase, ATP-dependent, putative  82.11 
 
 		 2556 bp  54  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5476  DNA ligase D  90.7 
 
 		 2784 bp  54  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388357 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00235  putative ISXoo14 transposase  84.51 
 
 		 1098 bp  54  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00514  putative ISXoo14 transposase  84.51 
 
 		 1002 bp  54  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342548  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5975  IS4 family transposase  100 
 
 		 1101 bp  52  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0501  DNA ligase D  100 
 
 		 2592 bp  52  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535245  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3490  ATP-dependent DNA ligase  93.94 
 
 		 2793 bp  50.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1346  ATP dependent DNA ligase  100 
 
 		 2811 bp  50.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.893044  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0987  transposase, IS4  88.89 
 
 		 1104 bp  50.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1112  transposase, IS4  88.89 
 
 		 1104 bp  50.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.325371  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3700  transposase, IS4  88.89 
 
 		 1104 bp  50.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3889  transposase, IS4  88.89 
 
 		 1104 bp  50.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3984  transposase, IS4  88.89 
 
 		 1104 bp  50.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2770  transposase, IS4  88.89 
 
 		 1104 bp  50.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6073  DNA ligase D  100 
 
 		 2784 bp  50.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6340  DNA ligase D  100 
 
 		 2850 bp  50.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.15116 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>