46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3594 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009957  Dshi_3932  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.609829  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3594  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0376172  normal  0.29662 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3677  hypothetical protein  46.13 
 
 		 297 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.160508 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0010  protein of unknown function DUF305  60.26 
 
 		 173 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0712  hypothetical protein  61.54 
 
 		 158 aa  185  7e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118157 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1942  hypothetical protein  62.18 
 
 		 170 aa  180  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0695  hypothetical protein  58.04 
 
 		 161 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000975548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1589  hypothetical protein  58.04 
 
 		 161 aa  175  7e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000759319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0287  protein of unknown function DUF305  52.8 
 
 		 201 aa  166  4e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.087537 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11708  hypothetical protein  57.75 
 
 		 163 aa  163  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1170  protein of unknown function DUF305  56.16 
 
 		 148 aa  163  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11363  hypothetical protein  54.23 
 
 		 161 aa  152  7e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1088  hypothetical protein  47.8 
 
 		 185 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0359  protein of unknown function DUF305  48.98 
 
 		 178 aa  142  8e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6962  protein of unknown function DUF305  46.1 
 
 		 161 aa  139  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211177  normal  0.0771819 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2305  hypothetical protein  43.26 
 
 		 210 aa  135  9e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.775317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00407  hypothetical protein  57.52 
 
 		 137 aa  133  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4398  hypothetical protein  43.62 
 
 		 157 aa  130  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4663  hypothetical protein  48.62 
 
 		 118 aa  93.2  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000351024 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3077  hypothetical protein  36.17 
 
 		 164 aa  91.3  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2051  protein of unknown function DUF305  36.55 
 
 		 171 aa  90.5  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6892  protein of unknown function DUF305  33.57 
 
 		 175 aa  85.9  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6646  protein of unknown function DUF305  34.03 
 
 		 170 aa  85.9  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.350625  normal  0.51653 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2420  hypothetical protein  32.58 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4811  hypothetical protein  32.37 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4925  hypothetical protein  34.51 
 
 		 147 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3896  hypothetical protein  33.1 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1322  hypothetical protein  31.72 
 
 		 166 aa  72  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.338762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2287  hypothetical protein  31.72 
 
 		 151 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000356026  hitchhiker  0.00039069 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3245  hypothetical protein  31.47 
 
 		 167 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  52.63 
 
 		 134 aa  50.8  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  46.94 
 
 		 211 aa  48.9  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  48.15 
 
 		 134 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1101  protein of unknown function DUF305  44.07 
 
 		 132 aa  47  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1143  protein of unknown function DUF305  42.59 
 
 		 200 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  48.98 
 
 		 128 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  46 
 
 		 113 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  42.11 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  38.98 
 
 		 134 aa  43.5  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  35.85 
 
 		 223 aa  43.5  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  50 
 
 		 202 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  46 
 
 		 134 aa  43.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  46.94 
 
 		 128 aa  42.7  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  48 
 
 		 119 aa  42.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  36.25 
 
 		 215 aa  42.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  34 
 
 		 131 aa  42  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>