More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2725 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2725  hypothetical protein  100 
 
 		 499 aa  959    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  73.08 
 
 		 386 aa  499  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.104653  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0632  signal recognition particle-docking protein FtsY  87.68 
 
 		 410 aa  485  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1843  Signal recognition particle-docking protein FtsY  87.68 
 
 		 393 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0101232  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0492  signal recognition particle-docking protein FtsY  87.32 
 
 		 379 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0977518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1921  signal recognition particle-docking protein FtsY  75.6 
 
 		 346 aa  483  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0684564 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1214  signal recognition particle-docking protein FtsY  78.48 
 
 		 381 aa  480  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3410  signal recognition particle-docking protein FtsY  62.59 
 
 		 473 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.457129 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2723  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.77 
 
 		 488 aa  355  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2950  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.86 
 
 		 488 aa  354  2e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.260236  hitchhiker  0.00455351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2845  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.41 
 
 		 493 aa  353  4e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.634202 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0361  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.46 
 
 		 408 aa  352  7e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1181  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.05 
 
 		 506 aa  348  1e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0879214  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0517  signal recognition particle-docking protein FtsY  60.29 
 
 		 315 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0362  signal recognition particle-docking protein FtsY  60.29 
 
 		 315 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5338  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.51 
 
 		 466 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.870799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0207  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.48 
 
 		 315 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0402  signal recognition particle-docking protein FtsY  59.57 
 
 		 315 aa  341  2e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0375  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.84 
 
 		 315 aa  340  5e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0316  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  58.63 
 
 		 315 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0212  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.18 
 
 		 316 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135462 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3223  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.12 
 
 		 483 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000124674 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0413  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.2 
 
 		 529 aa  335  7.999999999999999e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.571496  normal  0.495384 
 
 
-
 
NC_004310  BR1934  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.18 
 
 		 463 aa  333  6e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0925  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.82 
 
 		 494 aa  333  6e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1861  cell division protein FtsY  58.18 
 
 		 465 aa  333  6e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.229627  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4411  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.05 
 
 		 437 aa  332  8e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2496  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.09 
 
 		 312 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0017  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.64 
 
 		 387 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.278591  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.52 
 
 		 528 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4069  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.52 
 
 		 533 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.605645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3389  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.8 
 
 		 500 aa  324  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3091  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.64 
 
 		 520 aa  324  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.694563 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1413  signal recognition particle-docking protein FtsY  59.64 
 
 		 316 aa  321  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0521  signal recognition particle-docking protein FtsY  59.85 
 
 		 326 aa  316  8e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.948166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4196  cell division particle  56.15 
 
 		 454 aa  311  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.701722  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2732  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.88 
 
 		 308 aa  312  1e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2930  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.68 
 
 		 311 aa  311  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.285108 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1400  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.88 
 
 		 308 aa  310  4e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0324422  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.05 
 
 		 485 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.77 
 
 		 561 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0219  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.12 
 
 		 540 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3468  cell division protein FtsY  47.83 
 
 		 563 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00185267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.74 
 
 		 452 aa  302  7.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  54.74 
 
 		 495 aa  301  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  54.38 
 
 		 471 aa  300  3e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3883  cell division protein FtsY  55.21 
 
 		 491 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.629527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3840  cell division protein FtsY  55.21 
 
 		 491 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3773  cell division protein FtsY  55.21 
 
 		 491 aa  296  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.22 
 
 		 491 aa  296  7e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.65 
 
 		 432 aa  295  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  54.83 
 
 		 511 aa  295  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3942  cell division protein FtsY  54.83 
 
 		 491 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.9 
 
 		 373 aa  294  3e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.36 
 
 		 453 aa  294  3e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3763  cell division protein FtsY  54.83 
 
 		 491 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.14 
 
 		 481 aa  293  7e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002138  signal recognition particle receptor protein FtsY  55.38 
 
 		 407 aa  292  9e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.745787  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0289  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.1 
 
 		 482 aa  292  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.26 
 
 		 405 aa  292  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2374  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.77 
 
 		 387 aa  292  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000224512  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3505  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.79 
 
 		 487 aa  291  2e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000471575  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.08 
 
 		 643 aa  291  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  53.67 
 
 		 497 aa  291  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  53.67 
 
 		 498 aa  291  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  53.67 
 
 		 498 aa  291  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  53.67 
 
 		 498 aa  291  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3858  cell division protein FtsY  53.67 
 
 		 497 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0414  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.86 
 
 		 447 aa  290  3e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.98 
 
 		 510 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.65 
 
 		 375 aa  290  5.0000000000000004e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4164  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.37 
 
 		 611 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00648424  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3774  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.2 
 
 		 582 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00390438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0171  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.37 
 
 		 621 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116132  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0221  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.67 
 
 		 535 aa  287  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359451  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_002978  WD0888  cell division ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein FtsY  51.56 
 
 		 303 aa  286  4e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4094  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.37 
 
 		 615 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000394743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00280  signal recognition particle GTPase  54.72 
 
 		 408 aa  287  4e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3972  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.9 
 
 		 562 aa  286  4e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00124798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2853  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.31 
 
 		 309 aa  286  5e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0239  cell division protein FtsY  54.44 
 
 		 541 aa  286  5.999999999999999e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0752366  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3979  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.44 
 
 		 523 aa  286  5.999999999999999e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4295  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.37 
 
 		 540 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00341336  normal  0.0288649 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0577  cell division protein  54.44 
 
 		 553 aa  286  7e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4586  cell division protein FtsY  54.02 
 
 		 510 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3847  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.02 
 
 		 584 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00993758  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.64 
 
 		 494 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  52 
 
 		 514 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.64 
 
 		 497 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2372  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.79 
 
 		 320 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2903  cell division protein FtsY  55 
 
 		 410 aa  283  5.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.297557  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1001  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.11 
 
 		 397 aa  283  5.000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000041577  hitchhiker  0.00000536863 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4980  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.81 
 
 		 317 aa  283  5.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0151  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.97 
 
 		 317 aa  282  1e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0889  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.11 
 
 		 310 aa  282  1e-74  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.23 
 
 		 501 aa  282  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  52.36 
 
 		 505 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0934  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.43 
 
 		 478 aa  281  2e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000272201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1319  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.64 
 
 		 416 aa  281  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025253  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1294  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.64 
 
 		 416 aa  281  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000563395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>