More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2050 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  749    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  61.32 
 
 		 364 aa  396  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  56.58 
 
 		 366 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  57.22 
 
 		 366 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  56.58 
 
 		 366 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  47.54 
 
 		 377 aa  305  9.000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  45.3 
 
 		 365 aa  299  6e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  46.38 
 
 		 383 aa  295  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5557  putative ABC transporter (permease protein)  43.58 
 
 		 377 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.396746 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  46.09 
 
 		 383 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  45.37 
 
 		 378 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  45.32 
 
 		 383 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  44.35 
 
 		 377 aa  282  9e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  43.95 
 
 		 378 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  44.02 
 
 		 382 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  43.54 
 
 		 388 aa  281  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  44.25 
 
 		 378 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  47.38 
 
 		 406 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  45.71 
 
 		 382 aa  276  5e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  46.95 
 
 		 430 aa  275  7e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  47.49 
 
 		 385 aa  275  8e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  42.03 
 
 		 372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  43.53 
 
 		 368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  42.29 
 
 		 372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  45.53 
 
 		 387 aa  269  5e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  43.83 
 
 		 396 aa  268  1e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  47.65 
 
 		 377 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  47.73 
 
 		 382 aa  265  7e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  47.73 
 
 		 381 aa  265  7e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  40.9 
 
 		 378 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  45.87 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0160  hypothetical protein  47.62 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  41.46 
 
 		 370 aa  264  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  44.18 
 
 		 376 aa  264  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0817  protein of unknown function DUF140  48.47 
 
 		 382 aa  263  4e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000758551  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  42.74 
 
 		 373 aa  262  6.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  46.76 
 
 		 377 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  42.43 
 
 		 344 aa  260  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  38.67 
 
 		 376 aa  256  5e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  42.7 
 
 		 382 aa  256  6e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  43.17 
 
 		 384 aa  256  6e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  44.44 
 
 		 381 aa  255  7e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  40.74 
 
 		 383 aa  255  7e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  44.44 
 
 		 381 aa  256  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  44.47 
 
 		 379 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4113  hypothetical protein  43.48 
 
 		 474 aa  252  6e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1952  hypothetical protein  44.79 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0257894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  37.01 
 
 		 370 aa  251  2e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1893  ABC transporter membrane spanning protein  43.6 
 
 		 376 aa  250  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.228416  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  42.4 
 
 		 384 aa  249  4e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  42.39 
 
 		 382 aa  249  6e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2195  protein of unknown function DUF140  42.44 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130725  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1540  hypothetical protein  39.41 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3564  hypothetical protein  42.9 
 
 		 371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.777285  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1019  toulene ABC transporter, permease protein, putative  39.49 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4961  protein of unknown function DUF140  47.27 
 
 		 386 aa  243  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.77669  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  42.59 
 
 		 377 aa  241  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3668  hypothetical protein  43.73 
 
 		 377 aa  240  2.9999999999999997e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0702453 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2807  protein of unknown function DUF140  40.97 
 
 		 379 aa  239  8e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0986  putative toulene ABC transporter, permease protein  42.04 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1984  protein of unknown function DUF140  42.98 
 
 		 383 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.622106 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4933  hypothetical protein  45.21 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0419987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1554  hypothetical protein  43.67 
 
 		 379 aa  227  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  37.71 
 
 		 368 aa  226  5.0000000000000005e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  34.9 
 
 		 369 aa  226  7e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  36.24 
 
 		 374 aa  224  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  34.63 
 
 		 369 aa  223  4e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  34.63 
 
 		 369 aa  222  7e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1839  hypothetical protein  38.94 
 
 		 376 aa  222  8e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  38.55 
 
 		 374 aa  222  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2107  hypothetical protein  38.93 
 
 		 391 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  33.52 
 
 		 373 aa  219  5e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  35.05 
 
 		 368 aa  218  1e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  36.87 
 
 		 382 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  35.75 
 
 		 377 aa  214  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  35.75 
 
 		 377 aa  214  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  37.36 
 
 		 383 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  33.64 
 
 		 367 aa  212  1e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  34.86 
 
 		 380 aa  209  7e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  38.17 
 
 		 388 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  41.7 
 
 		 413 aa  204  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2277  protein of unknown function DUF140  35.23 
 
 		 371 aa  203  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  36.29 
 
 		 370 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  35.73 
 
 		 375 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0365  hypothetical protein  38.16 
 
 		 376 aa  199  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  36.36 
 
 		 382 aa  199  7.999999999999999e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  35.9 
 
 		 375 aa  199  9e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0247  ABC transport system permease protein  36.9 
 
 		 364 aa  196  8.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  35.98 
 
 		 374 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0313  hypothetical protein  34.84 
 
 		 374 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  35.84 
 
 		 447 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  35.77 
 
 		 374 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0648  ABC transporter, permease protein, putative  36.67 
 
 		 378 aa  194  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0798  protein of unknown function DUF140  36.67 
 
 		 378 aa  194  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.737521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  35.96 
 
 		 374 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  35.71 
 
 		 374 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  35.96 
 
 		 374 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0175  protein of unknown function DUF140  35.49 
 
 		 374 aa  192  9e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1206  hypothetical protein  32.88 
 
 		 368 aa  192  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.699357 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  34.31 
 
 		 376 aa  190  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>