More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1332 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1194  beta-lactamase domain-containing protein  66.43 
 
 		 557 aa  735    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496445  normal  0.175299 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2534  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  66.43 
 
 		 557 aa  735    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.316819  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1199  beta-lactamase-like  67.27 
 
 		 558 aa  759    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.640626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0763  beta-lactamase-like  67.21 
 
 		 555 aa  793    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.614365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1988  beta-lactamase domain-containing protein  64.44 
 
 		 557 aa  729    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2228  beta-lactamase domain-containing protein  63.26 
 
 		 558 aa  726    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.96004  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1332  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 556 aa  1113    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  0.0195233 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1070  beta-lactamase domain-containing protein  41.45 
 
 		 557 aa  425  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131651  normal  0.340413 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1199  beta-lactamase domain protein  41.45 
 
 		 557 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1004  beta-lactamase domain protein  40.36 
 
 		 557 aa  415  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00402664  normal  0.192677 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2044  beta-lactamase domain-containing protein  42.96 
 
 		 557 aa  411  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0914949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4141  beta-lactamase domain protein  40.33 
 
 		 556 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3211  beta-lactamase domain-containing protein  41.85 
 
 		 567 aa  401  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4405  beta-lactamase domain-containing protein  39.27 
 
 		 557 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  normal  0.32787 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1371  beta-lactamase domain-containing protein  40.36 
 
 		 556 aa  395  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0514771 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1872  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  40.77 
 
 		 557 aa  392  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.60462  normal  0.167955 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0905  beta-lactamase domain-containing protein  41.68 
 
 		 555 aa  389  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4546  metallo-beta-lactamase family hydrolase  40.33 
 
 		 556 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.030557  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_004310  BR0817  metallo-beta-lactamase family protein  38.88 
 
 		 558 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0812  metallo-beta-lactamase family protein  38.88 
 
 		 558 aa  384  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1368  beta-lactamase domain protein  40.89 
 
 		 556 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1731  metal dependent hydrolase  40 
 
 		 555 aa  381  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0816025  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2408  beta-lactamase domain-containing protein  39.17 
 
 		 558 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3001  beta-lactamase domain-containing protein  38.45 
 
 		 546 aa  375  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1276  beta-lactamase domain protein  40.89 
 
 		 556 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2589  Beta-lactamase-like protein  38.48 
 
 		 556 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.76936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1293  beta-lactamase-like protein  39.82 
 
 		 544 aa  368  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1037  beta-lactamase-like  41.41 
 
 		 555 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34364  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3283  beta-lactamase domain protein  38.84 
 
 		 556 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.820283  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4618  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 556 aa  363  3e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2870  beta-lactamase-like  38.67 
 
 		 556 aa  364  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.820732  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2205  beta-lactamase-like  40.15 
 
 		 557 aa  363  5.0000000000000005e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2816  beta-lactamase domain-containing protein  37.79 
 
 		 564 aa  363  5.0000000000000005e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2419  beta-lactamase-like  41.24 
 
 		 556 aa  363  6e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.183431  normal  0.0102773 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3342  beta-lactamase domain protein  38.09 
 
 		 548 aa  362  1e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2933  beta-lactamase domain protein  39.13 
 
 		 556 aa  361  2e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1571  metallo-beta-lactamase  39.31 
 
 		 560 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212236  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2383  beta-lactamase domain-containing protein  38.29 
 
 		 556 aa  358  1.9999999999999998e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2284  beta-lactamase-like  38.59 
 
 		 550 aa  357  2.9999999999999997e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.311347  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0793  putative RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.87 
 
 		 558 aa  347  2e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279593  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0039  metallo-beta-lactamase family protein  34.77 
 
 		 544 aa  346  6e-94  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0937  beta-lactamase domain-containing protein  38.67 
 
 		 548 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0829  metallo-beta-lactamase family protein  34.77 
 
 		 542 aa  324  3e-87  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0228245  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0966  metallo-beta-lactamase family protein  33.2 
 
 		 540 aa  323  3e-87  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0157  Beta-lactamase-like  35.24 
 
 		 544 aa  323  7e-87  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0259079  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 		 560 aa  317  4e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  34.19 
 
 		 618 aa  316  7e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  35.09 
 
 		 555 aa  314  2.9999999999999996e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  35.61 
 
 		 558 aa  311  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  34.1 
 
 		 558 aa  306  7e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  34.35 
 
 		 558 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  34.54 
 
 		 555 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  37.82 
 
 		 552 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000333928  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1616  beta-lactamase domain-containing protein  36.2 
 
 		 559 aa  303  4.0000000000000003e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0224319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  34.12 
 
 		 555 aa  300  6e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0897  beta-lactamase domain-containing protein  37.53 
 
 		 447 aa  299  7e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.528069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  35.77 
 
 		 593 aa  299  8e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  33.94 
 
 		 555 aa  298  1e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0676  metallo-beta-lactamase family protein  31.65 
 
 		 560 aa  296  5e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  35.14 
 
 		 558 aa  296  5e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0095  Beta-lactamase-like protein  37.46 
 
 		 550 aa  296  9e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.560108  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0324  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  32.09 
 
 		 561 aa  293  5e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2305  metallo-beta-lactamase family protein  40.9 
 
 		 461 aa  293  7e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2242  beta-lactamase domain protein  36.58 
 
 		 580 aa  293  7e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.138314  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1149  beta-lactamase domain-containing protein  31.31 
 
 		 565 aa  293  8e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1171  beta-lactamase domain-containing protein  31.31 
 
 		 565 aa  293  8e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  32.25 
 
 		 555 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0102  beta-lactamase domain protein  36.73 
 
 		 546 aa  289  9e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2074  beta-lactamase-like protein  38.57 
 
 		 560 aa  289  9e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000552882  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25240  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  35.11 
 
 		 565 aa  288  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  35.81 
 
 		 561 aa  288  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2104  beta-lactamase domain-containing protein  36.28 
 
 		 558 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.739055  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2117  beta-lactamase-like protein  36.28 
 
 		 558 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2163  beta-lactamase domain-containing protein  36.28 
 
 		 558 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142592  normal  0.270544 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1747  metallo-beta-lactamase family protein  32.17 
 
 		 677 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0113  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 		 546 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1625  beta-lactamase domain protein  36.82 
 
 		 590 aa  284  2.0000000000000002e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000210591  hitchhiker  0.00000143957 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  31.53 
 
 		 553 aa  285  2.0000000000000002e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2388  beta-lactamase domain-containing protein  36.46 
 
 		 558 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.801347  normal  0.0151024 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4026  hypothetical protein  31.42 
 
 		 555 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0999117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3887  hypothetical protein  31.42 
 
 		 555 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0624715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3719  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  31.42 
 
 		 555 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.998295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3735  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  31.42 
 
 		 555 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4190  hypothetical protein  31.42 
 
 		 555 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4097  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  31.42 
 
 		 555 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000534796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3992  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  31.42 
 
 		 555 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3804  beta-lactamase domain-containing protein  31.42 
 
 		 555 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199247  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  32.55 
 
 		 554 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  30.57 
 
 		 560 aa  283  8.000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4080  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  31.24 
 
 		 555 aa  282  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0747948  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  31.35 
 
 		 566 aa  282  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1160  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  31.24 
 
 		 555 aa  281  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  33.15 
 
 		 569 aa  281  3e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2679  beta-lactamase domain-containing protein  30.82 
 
 		 555 aa  281  3e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000157483  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  33.45 
 
 		 554 aa  280  4e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1763  beta-lactamase domain protein  33.89 
 
 		 650 aa  280  5e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0018  metallo-beta-lactamase family protein  31.51 
 
 		 652 aa  280  5e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  32.73 
 
 		 554 aa  280  7e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1811  metallo-beta-lactamase family protein  31.69 
 
 		 645 aa  280  7e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0004  metallo-beta-lactamase family protein  31.88 
 
 		 662 aa  278  1e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000419484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>