225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1321 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1321  deoxyribodipyrimidine photolyase  100 
 
 
469 aa  971    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.533615  normal  0.0703748 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2012  deoxyribodipyrimidine photolyase  56.55 
 
 
450 aa  481  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2829  deoxyribodipyrimidine photolyase, putative  54.88 
 
 
461 aa  479  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242896  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1961  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  55.61 
 
 
468 aa  478  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.351083  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0527  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  51.88 
 
 
462 aa  474  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0876  DNA photolyase, class 2  52.78 
 
 
459 aa  462  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0767  deoxyribodipyrimidine photolyase  51.12 
 
 
451 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.268516 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1775  deoxyribodipyrimidine photolyase  53.6 
 
 
447 aa  450  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00154316  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0179  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  52.07 
 
 
487 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2851  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  50.43 
 
 
473 aa  425  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0415  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  49.65 
 
 
452 aa  426  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0522  DNA photolyase, class 2  49.38 
 
 
495 aa  421  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.372488 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1936  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  50.98 
 
 
494 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30886  predicted protein  47.88 
 
 
506 aa  393  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.25268 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2693  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  43.53 
 
 
449 aa  363  4e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41733  predicted protein  45.7 
 
 
477 aa  352  7e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908244  normal  0.188048 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36787  predicted protein  45.7 
 
 
477 aa  352  7e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00684152  hitchhiker  0.00249943 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04990  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.69 
 
 
466 aa  327  3e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0663  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  43.6 
 
 
464 aa  325  9e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4497  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  41.35 
 
 
446 aa  318  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.112755  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_51952  class II CPD photolyase  40.74 
 
 
511 aa  315  8e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3129  DNA photolyase, FAD-binding  40.31 
 
 
468 aa  310  2.9999999999999997e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3221  deoxyribodipyrimidine photolyase  40.87 
 
 
448 aa  310  4e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.147791  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0725  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.21 
 
 
455 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2139  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.73 
 
 
456 aa  301  2e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0155  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  41.69 
 
 
476 aa  291  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3500  DNA photolyase FAD-binding protein  35.4 
 
 
453 aa  290  3e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3762  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.33 
 
 
462 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12101  normal  0.44256 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2531  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.6 
 
 
467 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.695435  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2459  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.27 
 
 
467 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2754  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.51 
 
 
467 aa  272  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.853539 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_45715  predicted protein  38.49 
 
 
467 aa  267  4e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.380145  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2716  deoxyribodipyrimidine photolyase  38.78 
 
 
490 aa  265  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6363  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.41 
 
 
465 aa  263  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.111638 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1430  DNA photolyase FAD-binding protein  33.88 
 
 
493 aa  251  3e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3226  DNA photolyase FAD-binding  38 
 
 
486 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4973  DNA photolyase FAD-binding protein  33.33 
 
 
496 aa  234  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3125  DNA photolyase FAD-binding  37.15 
 
 
486 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.848481  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3028  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  36.11 
 
 
490 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3007  DNA photolyase FAD-binding  37.34 
 
 
493 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.742505 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  31.21 
 
 
843 aa  180  4.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1907  DNA photolyase, class 2  51.22 
 
 
104 aa  92  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2256  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  30.46 
 
 
479 aa  87.4  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.786952  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3384  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.36 
 
 
512 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1309  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.05 
 
 
499 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0820  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.15 
 
 
469 aa  81.3  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.627339 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3211  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.95 
 
 
499 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.941968 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0513  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.71 
 
 
475 aa  80.5  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.237418 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1166  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  25.22 
 
 
493 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0811  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.38 
 
 
475 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3054  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.29 
 
 
505 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.746759  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2714  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.32 
 
 
493 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00387  DNA photolyase (Eurofung)  26.49 
 
 
567 aa  77  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.892479  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3068  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.34 
 
 
500 aa  77  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1165  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  25.11 
 
 
493 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1236  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  25.22 
 
 
493 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3165  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  24.89 
 
 
476 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0377  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.39 
 
 
486 aa  72.4  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2838  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.11 
 
 
497 aa  72  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.182548  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2777  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.44 
 
 
469 aa  72  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1215  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.98 
 
 
477 aa  71.2  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.300983  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0870  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.67 
 
 
479 aa  71.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.040956 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1479  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.08 
 
 
478 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1604  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.54 
 
 
486 aa  70.5  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49165  predicted protein  29.17 
 
 
495 aa  70.5  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0998  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.46 
 
 
453 aa  70.1  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  28.36 
 
 
471 aa  69.7  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  28.36 
 
 
471 aa  69.7  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1615  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.09 
 
 
471 aa  68.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5309  deoxyribodipyrimidine photolyase  24.24 
 
 
477 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2919  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.13 
 
 
478 aa  68.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.219923 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4086  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.9 
 
 
449 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.703366  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1394  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.09 
 
 
483 aa  67.8  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4932  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  26.55 
 
 
481 aa  67.4  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1262  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.57 
 
 
463 aa  67.4  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103305  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02016  DNA photolyase  28.66 
 
 
474 aa  67  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0782959  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2257  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.73 
 
 
442 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2075  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  23.79 
 
 
476 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3589  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.49 
 
 
483 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3187  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  23.76 
 
 
476 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4676  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.14 
 
 
500 aa  64.7  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.499221 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3180  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  23.53 
 
 
469 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.478094  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2903  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  25.53 
 
 
478 aa  65.1  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.599485  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2956  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  23.53 
 
 
476 aa  64.7  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13805  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5849  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.38 
 
 
505 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2469  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.37 
 
 
475 aa  64.7  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000205711 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1623  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.17 
 
 
482 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1212  deoxyribodipyrimidine photolyase  21.8 
 
 
470 aa  64.3  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.0350184 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3184  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  24.61 
 
 
476 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.262936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3193  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  23.89 
 
 
476 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1252  deoxyribodipyrimidine photolyase  22.95 
 
 
476 aa  63.9  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0460072  normal  0.903658 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2935  deoxyribodipyrimidine photolyase  23.7 
 
 
476 aa  63.2  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1364  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.77 
 
 
473 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1759  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  27.41 
 
 
454 aa  62.4  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0257219  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1121  deoxyribodipyrimidine photolyase  21.18 
 
 
482 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0780  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  22.32 
 
 
475 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431367  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04795  photolyase  28.69 
 
 
472 aa  61.6  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.722935  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2357  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  22.66 
 
 
463 aa  61.6  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3349  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.11 
 
 
477 aa  61.6  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.355989  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1071  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  22.39 
 
 
477 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>