More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2541 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 412 aa  830    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  56.42 
 
 		 380 aa  463  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  51.95 
 
 		 388 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  48.66 
 
 		 377 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  48.92 
 
 		 378 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  48.7 
 
 		 387 aa  342  9e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  45.76 
 
 		 378 aa  315  8e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  40.53 
 
 		 365 aa  299  5e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  42.89 
 
 		 372 aa  283  5.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  37.71 
 
 		 379 aa  273  3e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  39.47 
 
 		 366 aa  258  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  40 
 
 		 366 aa  253  6e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  40.24 
 
 		 366 aa  249  7e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  41.85 
 
 		 417 aa  246  4e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  40.63 
 
 		 365 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  41.6 
 
 		 421 aa  244  3e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  39.53 
 
 		 367 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  41.95 
 
 		 417 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  40.72 
 
 		 366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  41.95 
 
 		 417 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  39.85 
 
 		 366 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  40.48 
 
 		 366 aa  239  8e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  39.34 
 
 		 369 aa  237  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  36.72 
 
 		 373 aa  237  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  35.89 
 
 		 374 aa  237  3e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  41.72 
 
 		 419 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  43.17 
 
 		 384 aa  236  6e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  39.08 
 
 		 367 aa  235  9e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  41.48 
 
 		 426 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  39.9 
 
 		 438 aa  234  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  42.41 
 
 		 371 aa  232  9e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  41.21 
 
 		 374 aa  232  9e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0956  rod shape-determining protein RodA  40.18 
 
 		 382 aa  230  3e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215548  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  43.54 
 
 		 369 aa  229  5e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  41.69 
 
 		 368 aa  228  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  38.67 
 
 		 373 aa  228  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1543  rod shape-determining protein RodA  36.65 
 
 		 401 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.391462  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  45.04 
 
 		 366 aa  227  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2113  stage V sporulation protein E  35.56 
 
 		 374 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  36.43 
 
 		 367 aa  226  6e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  34.24 
 
 		 368 aa  226  6e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  33.99 
 
 		 368 aa  226  7e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2623  rod shape-determining protein RodA  42.42 
 
 		 437 aa  225  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  40.75 
 
 		 376 aa  225  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  41.32 
 
 		 368 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1565  cell division protein FtsW  41.41 
 
 		 364 aa  224  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  40.18 
 
 		 368 aa  223  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  40.24 
 
 		 398 aa  223  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  36.97 
 
 		 372 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  40.79 
 
 		 367 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  40.79 
 
 		 368 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  41.09 
 
 		 368 aa  222  7e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  41.09 
 
 		 363 aa  223  7e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  40.79 
 
 		 367 aa  222  8e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  40.79 
 
 		 367 aa  222  8e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  42.81 
 
 		 368 aa  222  9e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  42.12 
 
 		 368 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  42.12 
 
 		 368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  42.12 
 
 		 368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  42.12 
 
 		 368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  38.46 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0484  cell cycle protein  34.26 
 
 		 509 aa  220  3e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  41.99 
 
 		 368 aa  220  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  32.66 
 
 		 371 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  38.96 
 
 		 364 aa  219  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  41.21 
 
 		 368 aa  219  5e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  38.07 
 
 		 373 aa  219  6e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  38.96 
 
 		 403 aa  219  6e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  38.06 
 
 		 423 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  38.73 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  35.71 
 
 		 413 aa  218  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  37.99 
 
 		 372 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  41.46 
 
 		 382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0930  rod shape-determining protein RodA  40.73 
 
 		 371 aa  216  5.9999999999999996e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  38.86 
 
 		 370 aa  215  9e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  43.26 
 
 		 366 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  38.55 
 
 		 370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0079  putative rod shape-determining transmembrane protein  40 
 
 		 385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09080  stage V sporulation protein E  39.38 
 
 		 365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.861786  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  35.68 
 
 		 422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17711  cell division membrane protein  36.44 
 
 		 422 aa  214  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  38.79 
 
 		 383 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  41.77 
 
 		 362 aa  213  3.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2495  rod shape-determining protein RodA  36.21 
 
 		 364 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1234  rod shape-determining protein RodA  36.04 
 
 		 366 aa  213  5.999999999999999e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1200  cell wall shape-determining protein  38.97 
 
 		 370 aa  213  5.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  38.44 
 
 		 370 aa  212  7.999999999999999e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  38.44 
 
 		 370 aa  212  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  37.88 
 
 		 363 aa  212  7.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  38.44 
 
 		 370 aa  212  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  38.55 
 
 		 370 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  38.55 
 
 		 370 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  38.55 
 
 		 370 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0755  cell wall shape-determining protein  38.55 
 
 		 370 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.850126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2349  cell cycle protein  39.05 
 
 		 367 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0681  cell wall shape-determining protein  38.55 
 
 		 370 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125336  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  39.22 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  34.16 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  38.25 
 
 		 370 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  37.65 
 
 		 370 aa  211  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>