More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0741 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  100 
 
 
241 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  68.88 
 
 
240 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  68.88 
 
 
240 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  68.88 
 
 
240 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  68.88 
 
 
240 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  68.88 
 
 
240 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  68.46 
 
 
240 aa  325  3e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  68.46 
 
 
240 aa  325  6e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  68.46 
 
 
240 aa  325  6e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  67.63 
 
 
240 aa  323  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  67.63 
 
 
240 aa  322  3e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  64.73 
 
 
244 aa  317  7e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0345  ABC transporter-related protein  67.22 
 
 
240 aa  314  6e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  63.07 
 
 
240 aa  314  9e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  65.56 
 
 
244 aa  312  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  63.49 
 
 
242 aa  311  6.999999999999999e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  63.9 
 
 
240 aa  310  1e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  65.15 
 
 
240 aa  310  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  64.32 
 
 
239 aa  309  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  65.56 
 
 
240 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  64.32 
 
 
240 aa  308  4e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  63.9 
 
 
241 aa  308  5e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  63.9 
 
 
241 aa  308  5e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.49 
 
 
241 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  63.07 
 
 
242 aa  307  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  63.49 
 
 
241 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  63.9 
 
 
240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  61 
 
 
240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  63.49 
 
 
242 aa  305  5.0000000000000004e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  61 
 
 
240 aa  303  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  62.66 
 
 
246 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  63.9 
 
 
243 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  62.24 
 
 
255 aa  302  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  60.58 
 
 
244 aa  302  3.0000000000000004e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  61 
 
 
240 aa  301  6.000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  62.66 
 
 
240 aa  301  8.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  61 
 
 
253 aa  300  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  62.24 
 
 
242 aa  300  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  62.24 
 
 
240 aa  300  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  60.17 
 
 
243 aa  300  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  62.24 
 
 
242 aa  300  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  61.41 
 
 
247 aa  300  1e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  59.34 
 
 
241 aa  300  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  61 
 
 
240 aa  299  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  61.41 
 
 
242 aa  300  2e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  63.49 
 
 
243 aa  299  2e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  62.66 
 
 
241 aa  299  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  63.49 
 
 
243 aa  300  2e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  62.5 
 
 
249 aa  300  2e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  61.83 
 
 
246 aa  299  2e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  62.24 
 
 
241 aa  298  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.41 
 
 
244 aa  298  4e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.17 
 
 
240 aa  298  4e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  62.66 
 
 
241 aa  298  4e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  62.66 
 
 
241 aa  298  4e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  62.24 
 
 
246 aa  298  5e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  61.41 
 
 
244 aa  298  7e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  62.66 
 
 
241 aa  297  9e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  61.83 
 
 
252 aa  296  1e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  59.6 
 
 
260 aa  296  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  59.75 
 
 
242 aa  295  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  62.5 
 
 
249 aa  295  3e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2740  ABC transporter related  60.49 
 
 
248 aa  295  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  60.66 
 
 
248 aa  295  4e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  58 
 
 
273 aa  295  5e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  60.33 
 
 
243 aa  295  6e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  58 
 
 
256 aa  294  7e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  61.83 
 
 
241 aa  294  7e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  62.5 
 
 
244 aa  294  8e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  59.75 
 
 
244 aa  294  8e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  61.83 
 
 
241 aa  294  8e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  61.16 
 
 
243 aa  293  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  59.75 
 
 
278 aa  293  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  60 
 
 
248 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  59.34 
 
 
243 aa  292  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  59.58 
 
 
248 aa  292  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  60.17 
 
 
242 aa  292  3e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.17 
 
 
240 aa  292  4e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  58.09 
 
 
249 aa  292  4e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  58.8 
 
 
250 aa  292  4e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.17 
 
 
240 aa  291  5e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  60.83 
 
 
244 aa  291  5e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  59.2 
 
 
260 aa  291  5e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.34 
 
 
240 aa  291  8e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.51 
 
 
251 aa  291  8e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  59.75 
 
 
241 aa  291  8e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  59.92 
 
 
243 aa  290  9e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.34 
 
 
240 aa  290  1e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  59.34 
 
 
247 aa  290  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  58.4 
 
 
250 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  58.4 
 
 
254 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  60.17 
 
 
243 aa  289  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.75 
 
 
240 aa  290  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.75 
 
 
240 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.75 
 
 
240 aa  290  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.75 
 
 
240 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  58.51 
 
 
242 aa  289  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  60.57 
 
 
255 aa  290  2e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  60 
 
 
247 aa  289  2e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  58.09 
 
 
249 aa  290  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>