257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1378 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1378  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  229  9e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2483  hypothetical protein  73.21 
 
 
119 aa  168  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  34.82 
 
 
302 aa  71.6  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3045  protein of unknown function DUF81  35.58 
 
 
302 aa  67  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  35.64 
 
 
270 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2089  hypothetical protein  37.74 
 
 
252 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  35.48 
 
 
300 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  33.64 
 
 
313 aa  58.9  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  38.89 
 
 
315 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  33.08 
 
 
270 aa  58.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  34.26 
 
 
303 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  30.36 
 
 
267 aa  58.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02210  hypothetical protein  32.14 
 
 
267 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  30.69 
 
 
270 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  30.25 
 
 
261 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  29.09 
 
 
254 aa  56.6  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  33.33 
 
 
294 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1600  protein of unknown function DUF81  34.04 
 
 
250 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280313  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4952  protein of unknown function DUF81  37.36 
 
 
262 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  26.02 
 
 
255 aa  55.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  31.86 
 
 
307 aa  55.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  33.05 
 
 
268 aa  54.7  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  34.48 
 
 
270 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01324  hypothetical protein  33.66 
 
 
263 aa  53.9  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  37.63 
 
 
306 aa  53.9  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1097  hypothetical protein  29.09 
 
 
262 aa  53.9  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  33.33 
 
 
304 aa  53.9  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004140  predicted permease  31.68 
 
 
251 aa  53.9  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.835021  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  31.86 
 
 
310 aa  53.5  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  29.41 
 
 
261 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  29.41 
 
 
261 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  29.41 
 
 
261 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  32.5 
 
 
263 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  32.17 
 
 
264 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0571  integral membrane protein  30.43 
 
 
267 aa  52.4  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00851307  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3013  hypothetical protein  31.53 
 
 
251 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131671  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0453  hypothetical protein  29.92 
 
 
272 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3672  protein of unknown function DUF81  38.46 
 
 
251 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  32.17 
 
 
268 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  34.58 
 
 
293 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  37.93 
 
 
296 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  33.98 
 
 
268 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  35.85 
 
 
305 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  36.27 
 
 
306 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  36.27 
 
 
306 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  36.17 
 
 
291 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  30.1 
 
 
257 aa  51.2  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  36.17 
 
 
291 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  36.17 
 
 
291 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  28.93 
 
 
254 aa  51.2  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  31.86 
 
 
268 aa  50.8  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0205  hypothetical protein  30.33 
 
 
264 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004429  hypothetical protein  31.09 
 
 
263 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108567  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  31.93 
 
 
274 aa  50.8  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3831  hypothetical protein  32.58 
 
 
277 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1540  hypothetical protein  32.11 
 
 
305 aa  50.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.472601 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  36.21 
 
 
273 aa  50.1  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  33.64 
 
 
304 aa  50.4  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0958  protein of unknown function DUF81  31.03 
 
 
259 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0931  protein of unknown function DUF81  31.03 
 
 
259 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  32.46 
 
 
260 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0553  protein of unknown function DUF81  34.78 
 
 
250 aa  49.7  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  32.46 
 
 
260 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  36.27 
 
 
306 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  34.04 
 
 
307 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30740  predicted permease  31.46 
 
 
306 aa  50.1  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3289  permeases-like  33.04 
 
 
439 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  30.4 
 
 
261 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  34.75 
 
 
272 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4013  hypothetical protein  30.71 
 
 
269 aa  49.7  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0650  hypothetical protein  28.35 
 
 
270 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0144  membrane protein, permease  37.04 
 
 
120 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.703678  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  31.93 
 
 
298 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  30.11 
 
 
260 aa  49.7  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  33.33 
 
 
307 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1329  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  30.21 
 
 
259 aa  48.5  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.520044  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  29.09 
 
 
312 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5106  hypothetical protein  31.76 
 
 
255 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  28.95 
 
 
255 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0440  hypothetical protein  34.12 
 
 
256 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1164  hypothetical protein  35.65 
 
 
246 aa  48.5  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.344756  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8368  protein of unknown function DUF81  28.45 
 
 
244 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154223  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2913  protein of unknown function DUF81  33.67 
 
 
272 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  30.17 
 
 
263 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0247  hypothetical protein  31.96 
 
 
277 aa  48.1  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0865  hypothetical protein  29.59 
 
 
255 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  35.11 
 
 
291 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  35.11 
 
 
291 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  29.82 
 
 
269 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2926  protein of unknown function DUF81  33.66 
 
 
318 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3621  hypothetical protein  36.26 
 
 
251 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  33.66 
 
 
300 aa  47.8  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  34 
 
 
308 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  25.24 
 
 
2798 aa  47.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  27.19 
 
 
286 aa  47.8  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2672  hypothetical protein  29.75 
 
 
270 aa  47.4  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1725  protein of unknown function DUF81  28.71 
 
 
242 aa  47.8  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5037  protein of unknown function DUF81  34.07 
 
 
137 aa  47.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.092296  normal  0.114228 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0626  hypothetical protein  29.59 
 
 
356 aa  47.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  30.7 
 
 
260 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>