More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0700 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  100 
 
 		 174 aa  348  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  49.71 
 
 		 174 aa  172  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  47.67 
 
 		 172 aa  164  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  50.58 
 
 		 174 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  49.71 
 
 		 173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  49.7 
 
 		 172 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  50 
 
 		 174 aa  160  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  47.4 
 
 		 189 aa  157  5e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  47.98 
 
 		 173 aa  157  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  47.98 
 
 		 173 aa  157  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  46.24 
 
 		 173 aa  157  9e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  48.81 
 
 		 172 aa  155  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  47.98 
 
 		 174 aa  155  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2783  50S ribosomal protein L10  46.2 
 
 		 172 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189787  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  46.82 
 
 		 174 aa  152  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  47.9 
 
 		 172 aa  151  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2994  50S ribosomal protein L10  46.47 
 
 		 173 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  46.78 
 
 		 174 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  47.95 
 
 		 177 aa  150  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1634  50S ribosomal protein L10  45.29 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  51.16 
 
 		 176 aa  149  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  46.71 
 
 		 174 aa  147  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  46.24 
 
 		 174 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  46.11 
 
 		 176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  47.31 
 
 		 183 aa  145  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  43.98 
 
 		 175 aa  141  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  42.11 
 
 		 173 aa  141  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  47.47 
 
 		 165 aa  140  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  40.83 
 
 		 176 aa  140  9e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0396  50S ribosomal protein L10  50.34 
 
 		 173 aa  138  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252363  hitchhiker  0.00709296 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  42.11 
 
 		 178 aa  136  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  43.4 
 
 		 164 aa  134  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2178  ribosomal protein L10  41.62 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.905696 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  43.02 
 
 		 173 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  43.02 
 
 		 173 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  43.14 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  39.29 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  44.94 
 
 		 168 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  44.94 
 
 		 168 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  41.18 
 
 		 166 aa  128  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  41.18 
 
 		 166 aa  128  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  41.18 
 
 		 166 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  43.04 
 
 		 173 aa  127  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  40.61 
 
 		 179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  43.27 
 
 		 165 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  40.26 
 
 		 170 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  42.44 
 
 		 165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  44.74 
 
 		 174 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  41.92 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  41.92 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  39.88 
 
 		 172 aa  125  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0300  ribosomal protein L10  42.35 
 
 		 181 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000817286  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  44.93 
 
 		 166 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0867  50S ribosomal protein L10  39.88 
 
 		 175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  44.93 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  44.93 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  44.93 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  44.93 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  40.59 
 
 		 177 aa  124  5e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  40.59 
 
 		 177 aa  124  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  44.93 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  44.93 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  44.93 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  44.93 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  42.44 
 
 		 168 aa  124  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  41.86 
 
 		 165 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  41.86 
 
 		 165 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  41.86 
 
 		 165 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  38.55 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  38.55 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0325  50S ribosomal protein L10  37.79 
 
 		 174 aa  122  3e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00522529  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1864  50S ribosomal protein L10  37.79 
 
 		 174 aa  122  3e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0922754  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  42.76 
 
 		 173 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  39.64 
 
 		 174 aa  122  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5088  50S ribosomal protein L10  39.88 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000128873  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  46.26 
 
 		 167 aa  121  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  38.55 
 
 		 173 aa  121  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0314  ribosomal protein L10  38.73 
 
 		 175 aa  121  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000329441  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  39.05 
 
 		 181 aa  121  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1064  50S ribosomal protein L10  44.22 
 
 		 175 aa  121  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0220515  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3887  50S ribosomal protein L10  40.46 
 
 		 165 aa  120  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.452938  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3733  50S ribosomal protein L10  40.46 
 
 		 165 aa  120  7e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0337  50S ribosomal protein L10  40.46 
 
 		 165 aa  120  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.239078  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2808  50S ribosomal protein L10  40.46 
 
 		 165 aa  120  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000036942  normal  0.222423 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3862  50S ribosomal protein L10  40.46 
 
 		 165 aa  120  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104786  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03861  50S ribosomal protein L10  40.46 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000311393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4010  ribosomal protein L10  40.46 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000237202  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4040  50S ribosomal protein L10  40.46 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00830699  hitchhiker  0.000887574 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4433  50S ribosomal protein L10  40.46 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000818528  hitchhiker  0.00000264015 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4473  50S ribosomal protein L10  40.46 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239877  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  43.14 
 
 		 179 aa  120  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0355  50S ribosomal protein L10  40.83 
 
 		 172 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000413063  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4525  50S ribosomal protein L10  40.46 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111294  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0922  50S ribosomal protein L10  36.42 
 
 		 176 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00116615  hitchhiker  0.00000161737 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4218  50S ribosomal protein L10  40.46 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.4618e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5450  50S ribosomal protein L10  40.46 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000850473  hitchhiker  0.000626343 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03814  hypothetical protein  40.46 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360524  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0203  50S ribosomal protein L10  40.46 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0744309  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  41.21 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  42.48 
 
 		 215 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>