More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4717 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4717  Triose-phosphate isomerase  100 
 
 		 255 aa  514  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000120949  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  55.87 
 
 		 254 aa  274  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  53.85 
 
 		 254 aa  261  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  51.59 
 
 		 253 aa  258  5.0000000000000005e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  51.59 
 
 		 253 aa  258  5.0000000000000005e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  52.63 
 
 		 250 aa  258  5.0000000000000005e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  52.23 
 
 		 251 aa  257  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  53.04 
 
 		 253 aa  255  4e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 251 aa  255  5e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  52.23 
 
 		 251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  51.59 
 
 		 253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  52.44 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  52.44 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  52.44 
 
 		 251 aa  252  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  52.85 
 
 		 251 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  52.85 
 
 		 251 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  50.8 
 
 		 265 aa  253  3e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  52.44 
 
 		 251 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  52.44 
 
 		 251 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  52.44 
 
 		 251 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  52.44 
 
 		 251 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  52.03 
 
 		 249 aa  250  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  52.23 
 
 		 253 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  47.77 
 
 		 251 aa  248  7e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  52.82 
 
 		 250 aa  247  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2017  triosephosphate isomerase  48.15 
 
 		 256 aa  247  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.283793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  50.8 
 
 		 253 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  52 
 
 		 250 aa  245  4.9999999999999997e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  51.82 
 
 		 250 aa  245  6e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  51 
 
 		 256 aa  244  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  51.42 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  48.99 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  50.2 
 
 		 257 aa  240  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  53.04 
 
 		 654 aa  240  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2802  triosephosphate isomerase  50.77 
 
 		 261 aa  239  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000097423  hitchhiker  0.00000994621 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  50.8 
 
 		 253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 655 aa  239  2.9999999999999997e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  48.8 
 
 		 254 aa  238  5e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  48.59 
 
 		 251 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  46.99 
 
 		 250 aa  238  6.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  48.58 
 
 		 251 aa  238  9e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4528  triosephosphate isomerase  50.79 
 
 		 254 aa  237  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  50.79 
 
 		 250 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  47.37 
 
 		 251 aa  235  6e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  48.63 
 
 		 256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  45.97 
 
 		 249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  47.01 
 
 		 257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  48.18 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  51.6 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  51.6 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 687 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3290  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 241 aa  231  9e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 260 aa  230  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  48.61 
 
 		 263 aa  231  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1078  triosephosphate isomerase  48.37 
 
 		 298 aa  230  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 		 251 aa  229  3e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  49.17 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  48.61 
 
 		 263 aa  229  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  48.18 
 
 		 252 aa  229  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2365  triosephosphate isomerase  48.41 
 
 		 262 aa  228  6e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  48.18 
 
 		 253 aa  227  1e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  48.79 
 
 		 263 aa  227  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  48.79 
 
 		 250 aa  227  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.18 
 
 		 650 aa  226  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  45.67 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  47.37 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  47.66 
 
 		 261 aa  225  4e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  46.75 
 
 		 252 aa  225  6e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  46.34 
 
 		 252 aa  224  7e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  48.55 
 
 		 256 aa  224  8e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  47.15 
 
 		 250 aa  224  8e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_649  triose-phosphate isomerase  47.62 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13130  triosephosphate isomerase  49.03 
 
 		 263 aa  224  1e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.751982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  47.18 
 
 		 246 aa  224  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01285  triosephosphate isomerase  49.79 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1380  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  48.52 
 
 		 243 aa  223  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  47.77 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  49.22 
 
 		 257 aa  223  3e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  45.56 
 
 		 250 aa  223  3e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0742  triosephosphate isomerase  47.62 
 
 		 251 aa  222  4e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1244  triosephosphate isomerase  47.77 
 
 		 252 aa  222  4e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  47.37 
 
 		 251 aa  222  4e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3448  triosephosphate isomerase  48.58 
 
 		 256 aa  222  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  47.81 
 
 		 254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5606  triosephosphate isomerase  49.22 
 
 		 263 aa  222  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245433  normal  0.85925 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  48.4 
 
 		 253 aa  221  7e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  48.4 
 
 		 253 aa  221  7e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  48.1 
 
 		 243 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 		 250 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  45.35 
 
 		 256 aa  221  9.999999999999999e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 252 aa  219  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  46.03 
 
 		 253 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  47.64 
 
 		 260 aa  218  6e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  47.95 
 
 		 248 aa  218  7e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 		 248 aa  218  7e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>