134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1926 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1926  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 334 aa  689    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1451  hypothetical protein  46.81 
 
 		 335 aa  294  2e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000857119  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0208  Radical SAM domain protein  44.34 
 
 		 333 aa  293  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.819308  hitchhiker  0.00109807 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0199  Radical SAM domain protein  45.57 
 
 		 333 aa  290  2e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3188  radical SAM domain-containing protein  43.9 
 
 		 329 aa  287  2e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1913  hypothetical protein  44.71 
 
 		 334 aa  281  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.971358  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1526  hypothetical protein  57.32 
 
 		 84 aa  95.9  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  27 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  30.73 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  24.35 
 
 		 328 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  23.99 
 
 		 328 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  24.72 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0156  biotin synthase  24.81 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  24.58 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  26.14 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  26.67 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1978  biotin synthase  26.32 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02874  biotin synthase  25.2 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2168  biotin synthase  23.74 
 
 		 335 aa  57  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  26.29 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1536  biotin synthase  25.09 
 
 		 326 aa  53.9  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  27.27 
 
 		 321 aa  52.8  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2151  biotin synthase  23.81 
 
 		 354 aa  52.8  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4292  biotin synthase  23.33 
 
 		 326 aa  52.8  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  25 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4840  biotin synthase  23.63 
 
 		 352 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.738334 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  20 
 
 		 329 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2292  biotin synthase  26.49 
 
 		 349 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1010  biotin synthase  24.3 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0841  biotin synthase  25.77 
 
 		 344 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  23.08 
 
 		 328 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  22.5 
 
 		 329 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  23.74 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1035  biotin synthase  24.7 
 
 		 335 aa  51.2  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  20.96 
 
 		 326 aa  50.8  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5176  biotin synthase  24.18 
 
 		 351 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00545091  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0131  biotin synthase  23 
 
 		 340 aa  50.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4088  biotin synthase  23.08 
 
 		 352 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.629007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0144  Radical SAM domain protein  20.99 
 
 		 352 aa  50.4  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000047373  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  24.03 
 
 		 364 aa  50.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  23.13 
 
 		 322 aa  50.1  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4622  biotin synthase  24 
 
 		 332 aa  50.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151493 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  25.64 
 
 		 331 aa  50.4  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1556  biotin synthase  22.6 
 
 		 315 aa  49.7  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1428  biotin synthase  22.6 
 
 		 315 aa  49.7  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  22.48 
 
 		 331 aa  49.3  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0362  biotin synthase  23.08 
 
 		 352 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.309451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06500  biotin synthase  23.63 
 
 		 352 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00342267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0422  biotin synthase  24.31 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0492  biotin synthase  24.47 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4687  biotin synthase  24.18 
 
 		 352 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.747716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0277  biotin synthase  28.67 
 
 		 340 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.504189  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2557  biotin synthase  21.29 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000730416  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2466  biotin synthase  24.56 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0190546 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2916  biotin synthase  24.53 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0430  biotin synthase  24.47 
 
 		 346 aa  49.3  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2823  biotin synthase  25.83 
 
 		 336 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2286  biotin synthase  25 
 
 		 331 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0215942 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  23.5 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0392  biotin synthase  23.63 
 
 		 352 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92095  normal  0.311291 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0612  biotin synthase  21.69 
 
 		 333 aa  48.5  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2462  biotin synthase  26.02 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  24.86 
 
 		 352 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3457  biotin synthase  20.88 
 
 		 364 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000294325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0050  biotin synthase  24.61 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0041  biotin synthase  24.61 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  31.33 
 
 		 361 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0600  biotin synthase  23.08 
 
 		 352 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  31.33 
 
 		 361 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0494  biotin synthetase  23.63 
 
 		 352 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2101  biotin synthase  22.12 
 
 		 345 aa  47  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2070  biotin synthase  25.22 
 
 		 340 aa  47  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  31.33 
 
 		 361 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3415  biotin synthase  25.89 
 
 		 374 aa  47  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.371377  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0388  biotin synthase  22.53 
 
 		 352 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402949  normal  0.564151 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3827  biotin synthase  24.02 
 
 		 347 aa  46.6  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0963  biotin synthase  24.22 
 
 		 326 aa  46.6  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.032686  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2103  biotin synthase  24.4 
 
 		 353 aa  46.6  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.881041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  21.96 
 
 		 320 aa  46.2  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  23.49 
 
 		 374 aa  46.2  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05980  Biotin synthase  23.08 
 
 		 351 aa  46.2  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2775  biotin synthase  25.65 
 
 		 347 aa  46.2  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2793  biotin synthase  22.02 
 
 		 331 aa  45.8  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.883098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30955  Biotin synthase  24.14 
 
 		 361 aa  46.2  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0547155 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  25 
 
 		 376 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00742  biotin synthase  21.48 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000391904  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2867  biotin synthase  21.48 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0449634  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  25 
 
 		 324 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  22.02 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4187  biotin synthase  27.27 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  24.31 
 
 		 350 aa  45.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2964  biotin synthase  21.48 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0923  biotin synthase  21.48 
 
 		 346 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0506953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0828  biotin synthase  21.48 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000258207  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0838  biotin synthase  21.48 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000158311  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0469  biotin synthase  24.42 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000778897 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  22.4 
 
 		 380 aa  45.4  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2868  biotin synthase  21.48 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0428479  normal  0.0299932 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0798  biotin synthase  21.48 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000218975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00759  hypothetical protein  21.48 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00062155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>