14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1913 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1913  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  691    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.971358  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3188  radical SAM domain-containing protein  65.35 
 
 
329 aa  461  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0208  Radical SAM domain protein  64.35 
 
 
333 aa  462  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.819308  hitchhiker  0.00109807 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0199  Radical SAM domain protein  64.76 
 
 
333 aa  458  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1451  hypothetical protein  63.36 
 
 
335 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000857119  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1926  Radical SAM domain protein  44.71 
 
 
334 aa  281  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1526  hypothetical protein  59.04 
 
 
84 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11991  biotin synthase  25.1 
 
 
335 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.496147  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1104  biotin synthase  25.19 
 
 
335 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.915369  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3189  biotin synthase  22.74 
 
 
345 aa  53.5  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000310414  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12001  biotin synthase  24.71 
 
 
314 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.678797  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11841  biotin synthase  23.35 
 
 
335 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.47971  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  25.12 
 
 
344 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21296  biotin synthase  23.79 
 
 
437 aa  43.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>