More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2840 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2840  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  573  1.0000000000000001e-162  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2775  transcriptional regulator, LysR family  52.43 
 
 		 297 aa  244  9e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2243  LysR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 302 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2243  LysR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 289 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3660  LysR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 295 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2069  LysR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 295 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1978  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 296 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224272  normal  0.0418865 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2280  transcriptional regulator, LysR family  41.12 
 
 		 305 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2158  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 300 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0300496  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2291  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 300 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2099  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 300 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1443  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 303 aa  172  9e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1656  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.191617  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1735  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6344  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.552099  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1748  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.8769 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0434  transcriptional regulator, LysR family  39.73 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1524  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 297 aa  169  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365371  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0958  LysR family transcriptional regulator  39.4 
 
 		 297 aa  169  7e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1255  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.515451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1656  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5031  LysR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.361143 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3855  transcriptional regulator, LysR family  37.11 
 
 		 316 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0449  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00010985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2293  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 301 aa  159  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  39.79 
 
 		 293 aa  159  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 302 aa  159  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0186  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000312054  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2817  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 296 aa  156  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6941  transcriptional regulator, LysR family  36.82 
 
 		 298 aa  152  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5262  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 296 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0263  transcriptional regulator, LysR family  30.82 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 297 aa  149  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 308 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2640  RuBisCO operon transcriptional regulator  38.54 
 
 		 305 aa  149  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1692  rubisco operon transcriptional regulator  37.06 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.250885  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1390  transcriptional regulator, LysR family  37.06 
 
 		 308 aa  146  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2494  transcriptional regulator, LysR family  32.64 
 
 		 322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3406  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2710  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  33.96 
 
 		 307 aa  145  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2781  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 329 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0482  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.545808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2398  putative Rubisco transcriptional regulator  35.61 
 
 		 329 aa  145  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0149  putative Rubisco transcriptional regulator  32.99 
 
 		 319 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0468  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1817  transcriptional regulator, LysR family  34.69 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2158  transcriptional regulator, LysR family  34.69 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0478  transcriptional regulator, LysR family  28.38 
 
 		 290 aa  143  4e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0101609  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4699  LysR family substrate binding transcriptional regulator  36.08 
 
 		 296 aa  142  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  26.37 
 
 		 296 aa  142  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0146  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 337 aa  142  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 297 aa  142  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01641  putative Rubisco transcriptional regulator  32.64 
 
 		 314 aa  142  8e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.569388  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  31.88 
 
 		 303 aa  142  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0172  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 297 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0351  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 297 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.363543  normal  0.665208 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 297 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  35.49 
 
 		 314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2639  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0295  putative Rubisco transcriptional regulator  35.87 
 
 		 331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  32.55 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26681  putative Rubisco transcriptional regulator  34.78 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 297 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1310  ndhF3 operon transcriptional regulator  34.83 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1980  LysR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.362231  normal  0.28719 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0687  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591422  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01661  putative Rubisco transcriptional regulator  32.64 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0448  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1615  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.979938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  32.55 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2065  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102765  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0866  transcriptional regulator, LysR family  34.47 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0989  transcriptional regulator, LysR family  34.47 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179593 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4870  transcriptional regulator, LysR family  33.79 
 
 		 298 aa  139  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1477  LysR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 314 aa  139  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490418  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2324  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.69 
 
 		 286 aa  139  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1047  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 318 aa  139  6e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00687136  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2009  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 334 aa  139  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476347  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2080  transcriptional regulator, LysR family  35.96 
 
 		 295 aa  139  7e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1749  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 337 aa  139  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4466  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 316 aa  139  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01751  putative Rubisco transcriptional regulator  32.29 
 
 		 317 aa  139  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2419  putative DNA-binding transcriptional regulator  35.36 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0953  transcriptional regulator, LysR family  37.07 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5247  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01621  putative Rubisco transcriptional regulator  33.21 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4836  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2625  transcriptional regulator  34.69 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.172216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3312  transcriptional regulator, LysR family  32.18 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.782402 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2199  transcriptional regulator, LysR family  30.93 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3033  transcriptional regulator, LysR family  37.3 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0089298  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0334  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000502074  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3039  rubisco operon transcriptional regulator  33.79 
 
 		 318 aa  136  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.670925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>