More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1750 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1750  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 636 aa  1275    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0604135 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1711  AMP-dependent synthetase and ligase  58.53 
 
 		 653 aa  746    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.103973  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1641  AMP-dependent synthetase and ligase  55.43 
 
 		 656 aa  654    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2769  putative acetyl-CoA synthetase and ligase  48.26 
 
 		 650 aa  557  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.914995  normal  0.208075 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  44.31 
 
 		 649 aa  521  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  41.04 
 
 		 664 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  41.69 
 
 		 667 aa  514  1e-144  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  41.07 
 
 		 667 aa  512  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  40.75 
 
 		 657 aa  510  1e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  40.6 
 
 		 666 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  41.25 
 
 		 653 aa  508  9.999999999999999e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  42.59 
 
 		 652 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  43.94 
 
 		 638 aa  502  1e-141  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  41.07 
 
 		 667 aa  500  1e-140  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  40.03 
 
 		 652 aa  501  1e-140  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3488  acetate--CoA ligase  44.44 
 
 		 656 aa  501  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  42.52 
 
 		 648 aa  496  1e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  42.37 
 
 		 655 aa  489  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  40.62 
 
 		 656 aa  489  1e-137  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  41.12 
 
 		 650 aa  491  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  41.39 
 
 		 660 aa  489  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  42.1 
 
 		 643 aa  488  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  40.68 
 
 		 658 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  40.84 
 
 		 658 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  41.25 
 
 		 649 aa  486  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  42.7 
 
 		 655 aa  487  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  42.09 
 
 		 715 aa  487  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  41.3 
 
 		 655 aa  486  1e-136  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  41.19 
 
 		 663 aa  488  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  41.41 
 
 		 655 aa  487  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  42.7 
 
 		 655 aa  487  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12630  acetyl-coenzyme A synthetase  43.3 
 
 		 658 aa  486  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406293  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  41.98 
 
 		 680 aa  484  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  42.59 
 
 		 656 aa  483  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  41.18 
 
 		 657 aa  482  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  41.97 
 
 		 657 aa  482  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  42.13 
 
 		 658 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0726  acetate/CoA ligase  42.44 
 
 		 655 aa  483  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  42.7 
 
 		 658 aa  484  1e-135  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  42.55 
 
 		 661 aa  483  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  42.62 
 
 		 674 aa  479  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  43.73 
 
 		 661 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18230  acetyl-coenzyme A synthetase  42.13 
 
 		 646 aa  477  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.276557  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  41.32 
 
 		 663 aa  477  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  41.44 
 
 		 666 aa  472  1e-132  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  42.06 
 
 		 661 aa  474  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  41.49 
 
 		 654 aa  474  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  41.6 
 
 		 664 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  41.98 
 
 		 639 aa  473  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  41.54 
 
 		 636 aa  472  1e-132  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  40.62 
 
 		 657 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  40.13 
 
 		 649 aa  472  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  41.76 
 
 		 667 aa  474  1e-132  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  39.84 
 
 		 656 aa  474  1e-132  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  40.4 
 
 		 656 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  41.94 
 
 		 639 aa  471  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  41.11 
 
 		 664 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  40.35 
 
 		 651 aa  471  1.0000000000000001e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0611  acetate/CoA ligase  42.48 
 
 		 667 aa  470  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  37.38 
 
 		 660 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  41.54 
 
 		 666 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  41.38 
 
 		 636 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5331  acetate/CoA ligase  42.07 
 
 		 656 aa  468  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.151979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0211  acetate/CoA ligase  43.67 
 
 		 659 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0067  acetate/CoA ligase  42.64 
 
 		 651 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3168  acetate/CoA ligase  42.03 
 
 		 670 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0566588 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  39.03 
 
 		 649 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  41.54 
 
 		 660 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  40.12 
 
 		 655 aa  467  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  40.72 
 
 		 636 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  41.54 
 
 		 660 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2880  acetate--CoA ligase  40.33 
 
 		 664 aa  463  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.287628  normal  0.570573 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  40.4 
 
 		 638 aa  464  1e-129  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  40.34 
 
 		 673 aa  464  1e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  37.65 
 
 		 660 aa  465  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  41.14 
 
 		 658 aa  465  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3916  acetate/CoA ligase  41.54 
 
 		 648 aa  463  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  42.5 
 
 		 654 aa  464  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1381  acetate/CoA ligase  42.55 
 
 		 677 aa  465  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0170029 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  40.97 
 
 		 657 aa  464  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1380  acetyl-CoA synthetase  42.95 
 
 		 653 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.110945  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1451  acetyl-CoA synthetase  39.41 
 
 		 651 aa  459  9.999999999999999e-129  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2047  acetyl-coenzyme A synthetase  42.83 
 
 		 651 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1576  acetate/CoA ligase  38.44 
 
 		 648 aa  459  9.999999999999999e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000882243  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1300  AMP-dependent synthetase and ligase  44.03 
 
 		 627 aa  461  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  40.87 
 
 		 632 aa  460  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01080  acetyl-coenzyme A synthetase  43.17 
 
 		 650 aa  459  9.999999999999999e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  41.12 
 
 		 656 aa  461  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1767  AMP-dependent synthetase and ligase  43 
 
 		 650 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.898058  normal  0.363453 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2652  acetyl-CoA synthetase  40.97 
 
 		 654 aa  458  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.822271  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  41.85 
 
 		 667 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  39.32 
 
 		 655 aa  458  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  41.07 
 
 		 644 aa  456  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  42.31 
 
 		 654 aa  457  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  37.73 
 
 		 660 aa  458  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  40.81 
 
 		 666 aa  457  1e-127  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  37.71 
 
 		 660 aa  458  1e-127  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  38.94 
 
 		 626 aa  456  1e-127  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13698  acetyl-CoA synthetase  42.48 
 
 		 651 aa  457  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.037981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5425  acetyl-CoA synthetase  41.37 
 
 		 663 aa  458  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>