More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0215 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 299 aa  572  1.0000000000000001e-162  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  55.29 
 
 		 312 aa  315  7e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  51.03 
 
 		 301 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  51.03 
 
 		 301 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  51.03 
 
 		 301 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  51.03 
 
 		 301 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  51.74 
 
 		 299 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  54.06 
 
 		 316 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  54.06 
 
 		 316 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  52.08 
 
 		 299 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  52.99 
 
 		 304 aa  258  9e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  51.79 
 
 		 326 aa  257  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3473  cation diffusion facilitator family transporter  56.18 
 
 		 319 aa  251  7e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  45.02 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  44.72 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  47.6 
 
 		 305 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  47.42 
 
 		 305 aa  249  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  43.64 
 
 		 299 aa  247  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  48.01 
 
 		 305 aa  245  6.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  51.44 
 
 		 300 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  51.44 
 
 		 300 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  48.07 
 
 		 299 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  44.72 
 
 		 299 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  48.94 
 
 		 313 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  45.36 
 
 		 299 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  45.77 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  45.42 
 
 		 299 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0498  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  51.59 
 
 		 297 aa  238  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  44.72 
 
 		 299 aa  237  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  44.72 
 
 		 299 aa  237  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0501  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  51.59 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0340413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  47.68 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  44.21 
 
 		 295 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  46.67 
 
 		 305 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  46.67 
 
 		 305 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  46.38 
 
 		 298 aa  228  7e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  45.7 
 
 		 327 aa  222  6e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  45.04 
 
 		 309 aa  219  5e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  52.16 
 
 		 328 aa  217  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  47.57 
 
 		 312 aa  216  5e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  45.39 
 
 		 314 aa  214  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6162  cation diffusion facilitator family transporter  47.43 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  46.98 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  42.9 
 
 		 308 aa  213  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 316 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  44.33 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  44.44 
 
 		 303 aa  209  4e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  41.88 
 
 		 311 aa  209  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  42.41 
 
 		 325 aa  208  8e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  41.54 
 
 		 331 aa  207  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  37.5 
 
 		 315 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  44.93 
 
 		 342 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  44.29 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2104  cation diffusion facilitator family transporter  47.06 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.20697  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  43.3 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  44.29 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  43.85 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  37.15 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  47.18 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  45.35 
 
 		 307 aa  206  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  43.9 
 
 		 312 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  43.9 
 
 		 312 aa  206  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  43.9 
 
 		 312 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  40.42 
 
 		 301 aa  205  7e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3767  cation diffusion facilitator family transporter  38.74 
 
 		 328 aa  204  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.784386  normal  0.408109 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4043  cation diffusion facilitator family transporter  38.74 
 
 		 328 aa  204  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  47.16 
 
 		 325 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  39.11 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  47.16 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  40.43 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2195  cation diffusion facilitator family transporter  47.06 
 
 		 342 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  46.25 
 
 		 308 aa  203  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  41.38 
 
 		 317 aa  202  4e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  39.38 
 
 		 298 aa  202  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  47.54 
 
 		 356 aa  202  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  41.18 
 
 		 334 aa  202  6e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  40.97 
 
 		 306 aa  202  6e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  44.93 
 
 		 340 aa  202  7e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  46.23 
 
 		 305 aa  202  8e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  44.55 
 
 		 306 aa  201  9e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  45.26 
 
 		 340 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  38.21 
 
 		 398 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 		 294 aa  199  3e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  42.91 
 
 		 307 aa  199  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 		 307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  43.43 
 
 		 352 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  42.96 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  41.69 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  43.31 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0166  Co/Zn/Cd efflux system component protein  42.03 
 
 		 312 aa  196  5.000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.157738  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1735  cation diffusion facilitator family transporter  44.98 
 
 		 342 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.912037  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  48.24 
 
 		 313 aa  195  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  43.43 
 
 		 333 aa  195  7e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  42.8 
 
 		 337 aa  195  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4059  cation diffusion facilitator family transporter  44.61 
 
 		 305 aa  194  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.552828  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  38.85 
 
 		 317 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  38.87 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0853  Hsp12 variant C  40.35 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  41.76 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3234  cation diffusion facilitator family transporter  38.46 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.34559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>