More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5579 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5579  response regulator receiver protein  100 
 
 		 157 aa  328  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5264  response regulator receiver protein  41.26 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  35 
 
 		 151 aa  90.1  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  33.57 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  31.51 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  31.91 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7057  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0449  response regulator receiver protein  33.1 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  31.11 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  29.08 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  30.5 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0749  response regulator receiver protein  31.16 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  30.87 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  34.03 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  33.57 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5174  response regulator receiver protein  27.94 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  30.99 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2912  response regulator receiver protein  30.56 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  32.86 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  30 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  31.16 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  29.05 
 
 		 152 aa  73.6  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  31.51 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  32.88 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1446  response regulator receiver protein  30.99 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0006 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  33.1 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  34.25 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  26.57 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  27.59 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  29.25 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  26.09 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5179  response regulator receiver protein  29.37 
 
 		 292 aa  70.5  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  28.91 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  24.84 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2997  response regulator receiver protein  30.4 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1599  response regulator receiver protein  26.9 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  35.35 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 		 1155 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 		 1155 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  30.14 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0501  response regulator receiver domain-containing protein  29.1 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 		 1155 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1229  response regulator receiver protein  27.94 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22981 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  28.36 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 		 1149 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  29.85 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  29.86 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  29.37 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  31.69 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1900  response regulator  29.25 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176755  normal  0.0491434 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  28.77 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  31.69 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3821  response regulator receiver protein  27.94 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305029  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1998  response regulator receiver protein  30.37 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 153 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2351  response regulator receiver protein  32.18 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  31.69 
 
 		 148 aa  67  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  31.94 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  29.08 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  29.08 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  30.56 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1391  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.540189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  37.21 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  35.63 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  26.71 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  28.87 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  28.37 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  30.22 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  29.37 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  26.95 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  26.71 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  28.28 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0100  response regulator receiver protein  28.47 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  32.09 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  29.86 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0665  response regulator receiver domain-containing protein  30.33 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0168  response regulator receiver protein  26.95 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  29.71 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5135  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000600577 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  29.41 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1619  DNA-binding response regulator  28.24 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4702  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  25.17 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0901362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2116  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  30.37 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  29.13 
 
 		 795 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  36.05 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  36.05 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  27.27 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3781  response regulator receiver domain-containing protein  21.9 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>