223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4074 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4074  protein of unknown function DUF179  100 
 
 		 186 aa  384  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499752  hitchhiker  0.00807045 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3626  protein of unknown function DUF179  59.78 
 
 		 186 aa  241  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7071  protein of unknown function DUF179  46.45 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1773  transcriptional regulator  46.96 
 
 		 182 aa  185  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.728608  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1896  protein of unknown function DUF179  45.45 
 
 		 187 aa  182  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.56007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0885  hypothetical protein  42.54 
 
 		 187 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0197  protein of unknown function DUF179  42.39 
 
 		 183 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0637  hypothetical protein  41.99 
 
 		 189 aa  161  6e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0776  protein of unknown function DUF179  39.23 
 
 		 187 aa  158  4e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0777  protein of unknown function DUF179  40.98 
 
 		 187 aa  156  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2142  protein of unknown function DUF179  39.23 
 
 		 187 aa  156  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1601  hypothetical protein  38.67 
 
 		 188 aa  154  6e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0943857  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1688  protein of unknown function DUF179  38.12 
 
 		 187 aa  154  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09628  putative transcriptional regulator  42.62 
 
 		 186 aa  154  9e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.770481  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0140  hypothetical protein  38.92 
 
 		 209 aa  149  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0483  hypothetical protein  34.03 
 
 		 190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.195339  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5633  protein of unknown function DUF179  37.67 
 
 		 146 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591685  normal  0.939371 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1704  hypothetical protein  32.97 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.77077  hitchhiker  0.00529814 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3631  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0090  protein of unknown function DUF179  33.15 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0723  hypothetical protein  33.52 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2659  hypothetical protein  33.53 
 
 		 184 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0999  hypothetical protein  33.53 
 
 		 184 aa  101  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2389  hypothetical protein  34.74 
 
 		 198 aa  101  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.468382  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  32.37 
 
 		 197 aa  101  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  32.39 
 
 		 188 aa  100  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7076  hypothetical protein  33.85 
 
 		 193 aa  97.8  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0436  hypothetical protein  32.37 
 
 		 190 aa  97.1  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  33.53 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1432  protein of unknown function DUF179  29.95 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.914919  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  31.28 
 
 		 187 aa  96.3  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  32.14 
 
 		 203 aa  95.9  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0924  hypothetical protein  30.05 
 
 		 193 aa  95.9  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0923  hypothetical protein  32.81 
 
 		 196 aa  95.5  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3882  protein of unknown function DUF179  31.77 
 
 		 191 aa  94.7  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  28.65 
 
 		 189 aa  93.6  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1710  hypothetical protein  31.28 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0726  hypothetical protein  31.14 
 
 		 186 aa  94  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0987  hypothetical protein  31.96 
 
 		 196 aa  93.6  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5392  hypothetical protein  34.04 
 
 		 204 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.891404  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  29.31 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39570  hypothetical protein  31.41 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.336935 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5481  hypothetical protein  34.04 
 
 		 204 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478764  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5768  hypothetical protein  34.04 
 
 		 204 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  30.95 
 
 		 195 aa  92.4  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4219  protein of unknown function DUF179  31.63 
 
 		 209 aa  91.7  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231215  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0331  protein of unknown function DUF179  32.97 
 
 		 198 aa  92  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502019  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6057  hypothetical protein  31.02 
 
 		 201 aa  91.3  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.229198  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10037  hypothetical protein  30.81 
 
 		 202 aa  90.9  9e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.739012 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02778  hypothetical protein  31.76 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.551052  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0747  protein of unknown function DUF179  31.76 
 
 		 211 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4251  hypothetical protein  31.76 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.390045  normal  0.313475 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0766  hypothetical protein  31.76 
 
 		 211 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155835  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02741  hypothetical protein  31.76 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3291  hypothetical protein  31.76 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3106  hypothetical protein  31.76 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3380  hypothetical protein  31.76 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966977  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0850  hypothetical protein  29.53 
 
 		 204 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3343  hypothetical protein  30 
 
 		 187 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.329323 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3335  hypothetical protein  30 
 
 		 187 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.288189 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3090  hypothetical protein  31.18 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132976  decreased coverage  0.00000221223 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002461  hypothetical protein  26.67 
 
 		 174 aa  89.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  29.88 
 
 		 191 aa  89.7  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3439  hypothetical protein  30 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.623694  hitchhiker  0.00691193 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3259  hypothetical protein  30 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0107487  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  29.09 
 
 		 192 aa  89.7  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  28.98 
 
 		 187 aa  89.4  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4833  protein of unknown function DUF179  30.41 
 
 		 225 aa  89.4  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0922435  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3270  hypothetical protein  30 
 
 		 187 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.552102  normal  0.0744312 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  27.65 
 
 		 200 aa  88.6  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  27.43 
 
 		 197 aa  88.6  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  29.1 
 
 		 200 aa  88.2  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1471  hypothetical protein  34.43 
 
 		 205 aa  87.8  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3774  hypothetical protein  30.3 
 
 		 198 aa  87.8  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3910  hypothetical protein  29.94 
 
 		 187 aa  87.4  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0230557  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  28.02 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  28.49 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1179  protein of unknown function DUF179  30.94 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0188247  normal  0.235234 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5076  protein of unknown function DUF179  30.81 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1574  hypothetical protein  30.59 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0297031  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88895  predicted protein  31.67 
 
 		 288 aa  86.3  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0380911  hitchhiker  0.00603627 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0636  hypothetical protein  30.77 
 
 		 187 aa  85.5  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0620  hypothetical protein  30.59 
 
 		 187 aa  85.9  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1289  hypothetical protein  32.8 
 
 		 191 aa  85.5  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  28.74 
 
 		 192 aa  85.5  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0058  hypothetical protein  29.49 
 
 		 185 aa  84.7  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  31.43 
 
 		 206 aa  84.3  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1286  hypothetical protein  30.59 
 
 		 197 aa  84.3  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  27.68 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  29.89 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2673  hypothetical protein  29.95 
 
 		 186 aa  84.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02000  hypothetical protein  28.41 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0481  hypothetical protein  29.59 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.756128  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0165  hypothetical protein  29.82 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.197287 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0547  hypothetical protein  29.44 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2669  protein of unknown function DUF179  27.01 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.670234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3062  hypothetical protein  27.01 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3352  hypothetical protein  27.43 
 
 		 212 aa  81.3  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0115365  decreased coverage  0.00224252 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  24.42 
 
 		 186 aa  80.9  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0501  hypothetical protein  28.25 
 
 		 187 aa  80.9  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>