More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3960 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3960  ROK family protein  100 
 
 		 302 aa  610  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5156  ROK family protein  69.67 
 
 		 304 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00561428  normal  0.212192 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1875  glucokinase  42.14 
 
 		 302 aa  222  7e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.173781  hitchhiker  0.00131381 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  33.02 
 
 		 332 aa  142  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  31.86 
 
 		 321 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  29.39 
 
 		 315 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  29.39 
 
 		 315 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  30.35 
 
 		 328 aa  119  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  27.78 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1702  ROK family protein  32.59 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38694  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  32.79 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  31.23 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2015  ROK family protein  32.43 
 
 		 330 aa  115  7.999999999999999e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.217755 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  30.92 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  29.75 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  29.09 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  30.94 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  28.53 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0225  glucokinase, putative  33.43 
 
 		 329 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  30.82 
 
 		 303 aa  112  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  32 
 
 		 297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0770  glucose kinase  29.06 
 
 		 322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000145403  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  32 
 
 		 297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  30.1 
 
 		 316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  30.36 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1639  glucokinase  33.12 
 
 		 324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00474414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  31.91 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  30.94 
 
 		 312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  30.18 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  30.5 
 
 		 322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  32.67 
 
 		 302 aa  108  8.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  30.63 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  30.77 
 
 		 352 aa  105  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  29.65 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2372  ROK family protein  31.5 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.26662  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0335  ROK family protein  30.56 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  30.32 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  32.69 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1636  transcriptional regulator/sugar kinase  32.37 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.582275  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  31.19 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  32.09 
 
 		 325 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2241  ROK family protein  29.82 
 
 		 330 aa  102  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  28.57 
 
 		 314 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  26.28 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  31.39 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  30.72 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2184  ROK family protein  31.74 
 
 		 328 aa  99.8  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000268105  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  28.16 
 
 		 308 aa  99  8e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  27.87 
 
 		 395 aa  98.2  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  27.21 
 
 		 295 aa  98.2  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  29.78 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  28.27 
 
 		 314 aa  97.4  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2459  ROK family protein  29.37 
 
 		 313 aa  97.1  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0122294  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  28.93 
 
 		 321 aa  96.7  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1048  ROK family protein  28.81 
 
 		 283 aa  96.7  4e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  31.68 
 
 		 317 aa  96.3  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1507  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  28.66 
 
 		 319 aa  95.9  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453151  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  29.94 
 
 		 314 aa  95.9  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  27.64 
 
 		 322 aa  95.9  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  30.91 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1371  glucokinase  29.03 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  28.18 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  28.7 
 
 		 321 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  29.37 
 
 		 314 aa  93.6  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  29.43 
 
 		 342 aa  94  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1206  glucokinase  30.48 
 
 		 323 aa  93.2  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000192168  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1072  ROK family protein  28.16 
 
 		 312 aa  93.2  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  31.85 
 
 		 313 aa  92.8  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0199  glucokinase, putative  30.46 
 
 		 326 aa  92.8  7e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  31.48 
 
 		 315 aa  92.8  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  28.66 
 
 		 393 aa  92.4  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2895  ROK family protein  30.41 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  25.6 
 
 		 335 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  29.62 
 
 		 314 aa  90.9  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1433  ROK family protein  26.91 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  31.01 
 
 		 318 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  29.62 
 
 		 314 aa  90.9  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6585  ROK family protein  27.61 
 
 		 278 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2714  ROK family protein  30.67 
 
 		 318 aa  90.5  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  28.8 
 
 		 321 aa  90.5  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  28.22 
 
 		 325 aa  90.9  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  27.89 
 
 		 313 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3895  putative transcriptional regulator  29.37 
 
 		 293 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4066  putative transcriptional regulator  28.38 
 
 		 293 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.407658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2948  ROK family protein  26.91 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.319818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  27.3 
 
 		 408 aa  89  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  28.57 
 
 		 416 aa  88.6  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0320  ROK family protein  28.06 
 
 		 322 aa  88.6  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0261245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0014  ROK family protein  30.41 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3880  putative transcriptional regulator  29.04 
 
 		 293 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3959  putative transcriptional regulator  29.04 
 
 		 293 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229726  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  31.69 
 
 		 314 aa  88.2  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1406  ROK family protein  26.58 
 
 		 282 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  30.66 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1397  ROK family protein  26.58 
 
 		 280 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.969879  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2005  ROK family protein  27.57 
 
 		 255 aa  87.8  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0056597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  28.63 
 
 		 408 aa  87.4  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2047  ROK family protein  26.25 
 
 		 297 aa  87  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  29.47 
 
 		 327 aa  86.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  29.47 
 
 		 327 aa  86.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>