More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2696 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6925  Aminopeptidase N-like protein  55.36 
 
 
628 aa  681    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2696  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  100 
 
 
619 aa  1295    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.133709  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1191  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  53.69 
 
 
640 aa  676    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.820594  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03240  Zn-dependent aminopeptidase  51.55 
 
 
603 aa  622  1e-177  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.0027723  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1241  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  46.7 
 
 
620 aa  584  1.0000000000000001e-165  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.778581  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2032  Aminopeptidase N-like protein  41.42 
 
 
1026 aa  496  1e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0395  peptidase  28.48 
 
 
638 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1442  aminopeptidase N  28.17 
 
 
1079 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.956828  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3951  Aminopeptidase N-like protein  27.76 
 
 
900 aa  218  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.823523  normal  0.346171 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1830  peptidase  27.49 
 
 
663 aa  216  8e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.932627  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4942  putative aminopeptidase precursor  27.04 
 
 
689 aa  214  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2099  putative Zn-dependent aminopeptidase  27.8 
 
 
818 aa  211  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0836381  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3339  putative Zn-dependent aminopeptidase  28.82 
 
 
526 aa  206  8e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.387477 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0411  putative aminopeptidase  29.72 
 
 
792 aa  195  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04033  putative Zn-dependent aminopeptidase  27.9 
 
 
821 aa  194  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0154987  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3437  aminopeptidase N-like protein  26.38 
 
 
756 aa  192  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.296035  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3947  aminopeptidase precursor  25.71 
 
 
666 aa  192  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4270  putative Zn-dependent aminopeptidase  26.05 
 
 
816 aa  191  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1430  aminopeptidase, putative  27.41 
 
 
811 aa  187  7e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0410174  hitchhiker  0.0000000588353 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2017  peptidase  25.55 
 
 
732 aa  184  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1781  putative Zn-dependent aminopeptidase  27.2 
 
 
838 aa  182  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488569  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1773  aminopeptidase N-like protein  26.85 
 
 
745 aa  182  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5083  putative aminopeptidase  26.92 
 
 
801 aa  182  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0409  putative Zn-dependent aminopeptidase  27.88 
 
 
815 aa  178  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0694511  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4234  putative aminopeptidase  28.12 
 
 
793 aa  179  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000700491  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3469  putative aminopeptidase  25.81 
 
 
778 aa  178  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0337605 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3700  putative aminopeptidase precursor  26 
 
 
655 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5082  Zn-dependent aminopeptidase  25.99 
 
 
792 aa  174  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.546478 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0655  putative aminopeptidase precursor  25.68 
 
 
655 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0685  putative aminopeptidase precursor  25.68 
 
 
655 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0677  putative aminopeptidase precursor  25.52 
 
 
655 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.796434  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1880  putative aminopeptidase  25.42 
 
 
775 aa  169  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07610  Zn-dependent aminopeptidase  25.65 
 
 
770 aa  168  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6044  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.92 
 
 
649 aa  161  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.334803  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02197  peptidase  25.31 
 
 
668 aa  161  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3347  hypothetical protein  25.95 
 
 
631 aa  156  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1889  hypothetical protein  26.08 
 
 
610 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.6 
 
 
480 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0816785  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2801  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.95 
 
 
506 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.402753 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4868  aminopeptidase N-like protein  26.43 
 
 
623 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0331081  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3101  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.27 
 
 
492 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0251  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.66 
 
 
504 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000018463  normal  0.187628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0417  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.21 
 
 
446 aa  103  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1084  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.44 
 
 
482 aa  100  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.799271  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0293  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.18 
 
 
504 aa  99.4  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.03684  normal  0.0231195 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2423  aminopeptidase N  22.45 
 
 
489 aa  98.2  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0590  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.08 
 
 
518 aa  87.4  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0535796  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0738  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  20.69 
 
 
559 aa  81.6  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00291351  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.97 
 
 
768 aa  79  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1225  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.64 
 
 
823 aa  77.8  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.921665  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5527  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.96 
 
 
517 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1997  M1 family peptidase  27.8 
 
 
628 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.69 
 
 
860 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.15 
 
 
846 aa  73.2  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3425  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.25 
 
 
834 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279831  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1757  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.78 
 
 
647 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000341023  normal  0.0233957 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2703  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.78 
 
 
647 aa  72  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000156716  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2628  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.78 
 
 
647 aa  72  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000178054  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2339  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.32 
 
 
642 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239765  normal  0.0830864 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2457  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.48 
 
 
642 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.982771  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2589  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.78 
 
 
647 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000915199  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3784  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.49 
 
 
858 aa  70.9  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2267  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.32 
 
 
642 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.283529  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5408  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.45 
 
 
905 aa  70.1  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.589855 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1136  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.6 
 
 
865 aa  69.3  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.332522  normal  0.469366 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.69 
 
 
822 aa  68.2  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.06 
 
 
823 aa  67.4  0.0000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.15 
 
 
857 aa  67.4  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.15 
 
 
857 aa  67.4  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0316  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.15 
 
 
865 aa  67  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670011  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10463  aminopeptidase  28.5 
 
 
688 aa  67  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2742  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.55 
 
 
606 aa  65.5  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.280641  hitchhiker  0.000071737 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3448  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.38 
 
 
595 aa  65.1  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00063727 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.66 
 
 
821 aa  65.5  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.97 
 
 
835 aa  65.1  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2917  aminopeptidase N  23.94 
 
 
875 aa  64.3  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3299  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.55 
 
 
597 aa  64.3  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00358084  decreased coverage  0.0000000385045 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0932  aminopeptidase N  25.12 
 
 
877 aa  63.9  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0957943  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0897  aminopeptidase N  25.12 
 
 
877 aa  63.9  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.77386  normal  0.216424 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0756  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.9 
 
 
506 aa  63.9  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3040  aminopeptidase N  25.12 
 
 
877 aa  63.9  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.623964  normal  0.59258 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.62 
 
 
824 aa  63.5  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0741  leukotriene A4 hydrolase  28.98 
 
 
671 aa  63.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.697982  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03140  putative cold-active aminopeptidase; secreted using a signal peptide  28.41 
 
 
643 aa  63.5  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.409297  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0830  aminopeptidase N  28.98 
 
 
647 aa  63.5  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387372  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0760  aminopeptidase N  27.35 
 
 
906 aa  63.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2314  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.34 
 
 
652 aa  63.2  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00696087  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05812  Leukotriene A-4 hydrolase (EC 3.3.2.6)(Leukotriene A(4) hydrolase)(LTA-4 hydrolase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0W8]  27.59 
 
 
618 aa  62.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0387  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.37 
 
 
516 aa  62.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.694523  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1365  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.31 
 
 
822 aa  62  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3244  aminopeptidase N  24.65 
 
 
887 aa  62.4  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3016  aminopeptidase N  27.31 
 
 
877 aa  62  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4528  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.59 
 
 
457 aa  62  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.567205  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.31 
 
 
866 aa  61.6  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2765  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.76 
 
 
593 aa  61.6  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160052  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3459  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  33.99 
 
 
642 aa  60.8  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2928  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.27 
 
 
686 aa  61.2  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105993  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1367  leukotriene A4 hydrolase  27.03 
 
 
623 aa  61.2  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.836195  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0899  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.91 
 
 
573 aa  60.8  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.276688  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1383  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.03 
 
 
623 aa  60.8  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>