53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1312 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1312  putative alpha-glucosidase  100 
 
 
655 aa  1349    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5726  Glycoside hydrolase 97  56.79 
 
 
656 aa  776    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.035847 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0169  putative alpha-glucosidase  41.6 
 
 
656 aa  519  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4959  hypothetical protein  37.42 
 
 
659 aa  494  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2360  putative alpha-glucosidase  39.02 
 
 
679 aa  485  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103256  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1628  putative alpha-glucosidase  39.17 
 
 
678 aa  473  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0539219  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2298  putative alpha-glucosidase  37.46 
 
 
647 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5410  alpha-glucosidase, putative  38.05 
 
 
648 aa  467  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0179561  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3217  alpha-glucosidase, putative  33.38 
 
 
682 aa  303  8.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751285  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23190  alpha-glucosidase  29.39 
 
 
701 aa  271  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243429  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1777  alpha-glucosidase  30.33 
 
 
697 aa  269  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1876  alpha-glucosidase  29.55 
 
 
707 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.507439 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4326  hypothetical protein  28.02 
 
 
672 aa  263  8e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0590  alpha-glucosidase  30.11 
 
 
684 aa  263  8e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.225417  normal  0.0221919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0058  Glycoside hydrolase 97  28.69 
 
 
693 aa  256  9e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.52966 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1108  alpha-glucosidase  28.57 
 
 
676 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1209  hypothetical protein  27.25 
 
 
726 aa  255  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0367  putative alpha-glucosidase  28.75 
 
 
677 aa  254  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2002  alpha-glucosidase  29.06 
 
 
727 aa  250  7e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2329  alpha-glucosidase  28.97 
 
 
710 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20719  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1876  alpha-glucosidase  28.97 
 
 
703 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1394  hypothetical protein  26.66 
 
 
700 aa  244  3e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.872498  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2102  alpha-glucosidase  28.97 
 
 
703 aa  244  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.869354  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2445  alpha-glucosidase  28.83 
 
 
710 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.607095  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2329  alpha-glucosidase  28.69 
 
 
710 aa  243  7e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1931  alpha-glucosidase  28.83 
 
 
703 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2017  alpha-glucosidase  28.83 
 
 
702 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.248833  hitchhiker  0.00490164 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2740  alpha-glucosidase  29.37 
 
 
703 aa  242  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2450  alpha-glucosidase  28.41 
 
 
699 aa  241  4e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1019  alpha-glucosidase  28.88 
 
 
683 aa  241  5e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51780  alpha-glucosidase  28.53 
 
 
673 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.816262  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1892  alpha-glucosidase  27.48 
 
 
682 aa  228  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0185  alpha-glucosidase  27.17 
 
 
680 aa  225  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1400  hypothetical protein  26.2 
 
 
704 aa  218  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2708  hypothetical protein  26.37 
 
 
629 aa  205  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0314889  normal  0.739389 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5767  putative alpha-glucosidase  25.62 
 
 
711 aa  205  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4429  hypothetical protein  25.68 
 
 
707 aa  200  7e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.857441  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3876  Glycoside hydrolase 97  30.63 
 
 
571 aa  196  8.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0907495  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0777  hypothetical protein  25.91 
 
 
606 aa  196  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0928  hypothetical protein  25.37 
 
 
728 aa  188  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.453447  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0626  alpha-glucosidase  24.88 
 
 
727 aa  187  4e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1153  putative alpha-glucosidase  30.9 
 
 
574 aa  183  9.000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0476  alpha-glucosidase, putative, adg97A  26.27 
 
 
643 aa  182  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3805  hypothetical protein  24.3 
 
 
615 aa  171  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3590  hypothetical protein  24.96 
 
 
630 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116623  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2499  putative alpha-glucosidase  24.21 
 
 
674 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1420  hypothetical protein  24.37 
 
 
649 aa  165  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.828826  normal  0.205294 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0790  alpha-glucosidase  23.64 
 
 
661 aa  156  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0155602  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2469  Glycoside hydrolase 97  25.76 
 
 
641 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3873  hypothetical protein  23.44 
 
 
647 aa  140  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2159  alpha-glucosidase, putative, adg97A  24.69 
 
 
658 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1419  Glycoside hydrolase 97  24.92 
 
 
648 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.067122  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  23.23 
 
 
1255 aa  123  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>