272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1250 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1250  protein of unknown function DUF34  100 
 
 		 264 aa  527  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1623  hypothetical protein  42.81 
 
 		 336 aa  239  5e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.820814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0541  protein of unknown function DUF34  36.05 
 
 		 324 aa  166  5e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1948  protein of unknown function DUF34  50 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0259  protein of unknown function DUF34  52.03 
 
 		 344 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00852119 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1729  hypothetical protein  48.51 
 
 		 330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  30.92 
 
 		 279 aa  125  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  28.03 
 
 		 256 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  34.93 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0774  protein of unknown function DUF34  35.09 
 
 		 255 aa  117  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.245788  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  29.73 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  29.34 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1227  hypothetical protein  30.6 
 
 		 262 aa  109  5e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  28.51 
 
 		 264 aa  108  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  32.47 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4876  hypothetical protein  30.8 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276153  hitchhiker  0.00000161362 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3818  hypothetical protein  31.54 
 
 		 263 aa  103  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  25.9 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1111  protein of unknown function DUF34  26.38 
 
 		 255 aa  101  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1202  hypothetical protein  29.64 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  30.92 
 
 		 268 aa  99.8  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  31.19 
 
 		 296 aa  99.8  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1955  hypothetical protein  30.83 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0771  hypothetical protein  28.57 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.149762  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  31.38 
 
 		 310 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1110  hypothetical protein  26.84 
 
 		 265 aa  96.7  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.562425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1174  hypothetical protein  29.91 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171309  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3276  protein of unknown function DUF34  30.47 
 
 		 286 aa  95.9  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173418  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  27.78 
 
 		 269 aa  95.5  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  29.41 
 
 		 278 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0618  dinuclear metal center protein, YbgI family  30.77 
 
 		 294 aa  94.7  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2313  hypothetical protein  32.05 
 
 		 286 aa  93.6  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  0.328132 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2460  protein of unknown function DUF34  28.63 
 
 		 258 aa  93.2  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.625795 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  29.6 
 
 		 287 aa  93.2  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  32 
 
 		 366 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  28.51 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  29.71 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  29.72 
 
 		 290 aa  90.5  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0805  hypothetical protein  26.32 
 
 		 241 aa  89.4  6e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.708368  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0737  hypothetical protein  27.67 
 
 		 306 aa  89  7e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.698842  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  35.88 
 
 		 373 aa  88.6  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3463  protein of unknown function DUF34  30.2 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.807621  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1001  conserved hypothetical protein (NIF3 domain protein)  28.05 
 
 		 241 aa  88.6  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.561476  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0285  hypothetical protein  28.74 
 
 		 240 aa  87.8  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000517518  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1046  hypothetical protein  24.91 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0728  hypothetical protein  26.04 
 
 		 241 aa  87.8  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0727321  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  35.88 
 
 		 373 aa  86.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  35.88 
 
 		 373 aa  86.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  35.88 
 
 		 373 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  35.88 
 
 		 373 aa  86.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  35.88 
 
 		 373 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  35.88 
 
 		 373 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  35.11 
 
 		 373 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0419  hypothetical protein  28.57 
 
 		 248 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201589 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2667  hypothetical protein  28.57 
 
 		 248 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0440  hypothetical protein  28.57 
 
 		 248 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  27.53 
 
 		 290 aa  85.1  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  35.11 
 
 		 373 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  35.11 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16660  hypothetical protein  29.32 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  34.4 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  34.4 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0896  hypothetical protein  25.68 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1301  hypothetical protein  25.47 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4817  hypothetical protein  32.91 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203194  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2043  hypothetical protein  35.94 
 
 		 364 aa  82.4  0.000000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126917 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  35.9 
 
 		 366 aa  82.4  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  34.35 
 
 		 373 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0014  hypothetical protein  27.55 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0039713  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09470  conserved hypothetical protein TIGR00486  28.83 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  39.02 
 
 		 371 aa  82.4  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1624  hypothetical protein  25.97 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1438  hypothetical protein  26.89 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.127976  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2460  hypothetical protein  26.44 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000153632  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1884  protein of unknown function DUF34  26.05 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000303025  hitchhiker  0.00204179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0358  hypothetical protein  28.12 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388987  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1572  hypothetical protein  27.76 
 
 		 250 aa  82  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000308577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0367  hypothetical protein  28.12 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.465671 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1050  hypothetical protein  24.9 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.277421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  35.16 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2580  hypothetical protein  26.05 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  normal  0.0950239 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2208  hypothetical protein  29.17 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171842  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3538  hypothetical protein  30.14 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.416608 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  27.71 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0753  hypothetical protein  24.51 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0434961  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0343  hypothetical protein  27.68 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.799255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  37.5 
 
 		 371 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl272  hypothetical protein  21.92 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000472671  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2467  hypothetical protein  26.05 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255427  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3545  protein of unknown function DUF34  26.34 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630294  normal  0.0213286 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2571  hypothetical protein  28.19 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12960  hypothetical protein  28.21 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0413  hypothetical protein  26.34 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1137  protein of unknown function DUF34  27.69 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.43804  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0444  hypothetical protein  24.82 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.427722  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  30.28 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1289  protein of unknown function DUF34  28.69 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.146392  normal  0.550542 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  31.06 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1068  hypothetical protein  27.78 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1217  protein of unknown function DUF34  38.26 
 
 		 373 aa  76.3  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000145347  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>