More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0637 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0637  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 716 aa  1464    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1157  putative PAS/PAC sensor protein  36.33 
 
 		 723 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148223 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1421  putative PAS/PAC sensor protein  33.47 
 
 		 687 aa  348  3e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.377844  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1974  putative PAS/PAC sensor protein  34.4 
 
 		 701 aa  321  3e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0567  putative PAS/PAC sensor protein  30.47 
 
 		 693 aa  282  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0002  putative PAS/PAC sensor protein  28.04 
 
 		 690 aa  272  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1154  putative PAS/PAC sensor protein  31.17 
 
 		 706 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.986646  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1559  metal-dependent phosphohydrolase  30.27 
 
 		 698 aa  163  9e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000474129  normal  0.225702 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3421  putative PAS/PAC sensor protein  32 
 
 		 341 aa  134  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2835  putative PAS/PAC sensor protein  39.18 
 
 		 452 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0837096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1507  putative PAS/PAC sensor protein  30.42 
 
 		 357 aa  127  9e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000751678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1729  metal-dependent phosphohydrolase  34 
 
 		 359 aa  122  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0757929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1320  HD-GYP domain-containing protein  29.86 
 
 		 471 aa  119  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0434  putative PAS/PAC sensor protein  37.39 
 
 		 458 aa  118  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1049  HD domain-containing protein  28.42 
 
 		 311 aa  115  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0090576  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.39 
 
 		 491 aa  114  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  35.07 
 
 		 771 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  30.63 
 
 		 474 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7735  metal dependent phosphohydrolase  43.02 
 
 		 905 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  34.53 
 
 		 389 aa  112  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2130  response regulator receiver protein  38.5 
 
 		 334 aa  112  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1175  metal dependent phosphohydrolase  37.17 
 
 		 389 aa  111  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 		 480 aa  111  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.64 
 
 		 364 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  40.56 
 
 		 848 aa  110  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  28.96 
 
 		 469 aa  108  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1477  metal dependent phosphohydrolase  35.12 
 
 		 643 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.27 
 
 		 496 aa  108  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2906  metal dependent phosphohydrolase  35.12 
 
 		 643 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.19603  normal  0.482942 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1441  metal dependent phosphohydrolase  35.12 
 
 		 643 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1446  metal dependent phosphohydrolase  35.12 
 
 		 643 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  35.32 
 
 		 388 aa  108  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  35.16 
 
 		 649 aa  107  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1148  metal dependent phosphohydrolase  36.61 
 
 		 405 aa  107  9e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8321  putative metal dependent phosphohydrolase  37.37 
 
 		 451 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  35.5 
 
 		 371 aa  106  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  37.1 
 
 		 703 aa  106  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  37.1 
 
 		 703 aa  106  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  35.16 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  35.29 
 
 		 632 aa  105  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1612  putative PAS/PAC sensor protein  36.13 
 
 		 305 aa  105  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244603  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3564  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.16 
 
 		 492 aa  104  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1875  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.08 
 
 		 361 aa  104  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  30.38 
 
 		 453 aa  104  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  36.73 
 
 		 509 aa  104  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0111  metal dependent phosphohydrolase  42.18 
 
 		 228 aa  103  8e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.153504  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  37.18 
 
 		 465 aa  103  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  28.42 
 
 		 339 aa  103  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  37.57 
 
 		 712 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  41.94 
 
 		 710 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  31.14 
 
 		 407 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  34.74 
 
 		 308 aa  102  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  33.96 
 
 		 1171 aa  102  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1344  metal dependent phosphohydrolase  31.96 
 
 		 643 aa  102  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  34.7 
 
 		 1237 aa  101  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.99 
 
 		 351 aa  101  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 740 aa  101  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2919  metal dependent phosphohydrolase  35.11 
 
 		 451 aa  101  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  32.29 
 
 		 545 aa  100  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4444  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 		 526 aa  100  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  38.51 
 
 		 692 aa  99.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3705  metal dependent phosphohydrolase  36.16 
 
 		 444 aa  100  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3894  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.78 
 
 		 353 aa  100  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109719  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  35.52 
 
 		 428 aa  99.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  35.96 
 
 		 718 aa  99.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  33.77 
 
 		 719 aa  99  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2820  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 642 aa  99.4  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0546  metal dependent phosphohydrolase  29.55 
 
 		 451 aa  99.8  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.880848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  27.09 
 
 		 713 aa  99  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 574 aa  98.6  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  35.11 
 
 		 1301 aa  99  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  34.97 
 
 		 518 aa  97.8  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  34.21 
 
 		 539 aa  97.8  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  32.65 
 
 		 452 aa  97.4  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.82 
 
 		 487 aa  97.4  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  34.91 
 
 		 398 aa  97.4  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.13 
 
 		 508 aa  97.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2059  metal dependent phosphohydrolase  33.87 
 
 		 430 aa  96.7  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000152605  hitchhiker  0.00000484417 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2646  metal dependent phosphohydrolase  32.16 
 
 		 642 aa  96.7  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0914  HD domain-containing protein  32.42 
 
 		 377 aa  96.3  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0897  HD domain-containing protein  32.42 
 
 		 373 aa  96.3  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000539881  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0881  group-specific protein  32.42 
 
 		 373 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57625  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  32.8 
 
 		 212 aa  96.3  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 		 481 aa  96.3  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2457  metal dependent phosphohydrolase  35.47 
 
 		 358 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0975  HD domain-containing protein  32.42 
 
 		 377 aa  96.3  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1052  HD domain protein  32.42 
 
 		 374 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34036e-23 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2713  metal dependent phosphohydrolase  32.16 
 
 		 642 aa  96.3  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2306  metal dependent phosphohydrolase  36.32 
 
 		 531 aa  96.3  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  34.38 
 
 		 487 aa  96.3  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.67 
 
 		 513 aa  95.5  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1266  metal dependent phosphohydrolase  28.82 
 
 		 631 aa  95.5  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  32.47 
 
 		 499 aa  95.5  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 505 aa  95.9  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  33.5 
 
 		 545 aa  95.5  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2495  metal dependent phosphohydrolase  33.7 
 
 		 400 aa  95.1  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.33 
 
 		 853 aa  95.1  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3676  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.71 
 
 		 328 aa  94.7  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0585  metal dependent phosphohydrolase  31.67 
 
 		 420 aa  94  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  34.03 
 
 		 650 aa  94  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>